余永红
- 作品数:51 被引量:61H指数:4
- 供职机构:广东食品药品职业学院更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金广东省医学科学技术研究基金广州市科技计划项目更多>>
- 相关领域:生物学农业科学医药卫生轻工技术与工程更多>>
- 高职分子生物学操作课程改革实践被引量:2
- 2016年
- 针对广东食品药品职业学院中澳生物制药技术专业,借鉴澳大利亚TAFE(Technical And Further Education)职教体系,对分子生物学操作课程进行改革实践,采用新的教学模式,合理选择教学内容,改进教学方法,取得良好教学效果。
- 余永红马建荣方春生
- 关键词:高职分子生物学课程改革
- 水稻白叶枯病菌FabG同源蛋白生物信息学分析被引量:3
- 2022年
- 【目的】拟运用生物信息学的方法对目标基因进行预测分析,为后续展开水稻白叶枯病菌FabG及脂肪酸代谢途径的实验室研究提供参考。【方法】利用大肠杆菌(Escherichia coli)FabG(EcFabG)序列,在Xoo PXO99^(A)菌株基因组中经同源性比对发现,PXO_03085、PXO_00989、PXO_03629、PXO_02411、PXO_02878、PXO_02709所编码蛋白与大肠杆菌FabG具有同源性,将该6个基因分别命名为XoofabG1~XoofabG6,并将其编码蛋白命名为XooFabG1~XooFabG6。进一步运用生物信息学在线分析软件对这6个蛋白与EcFabG进行了理化性质、蛋白结构、亲水性、跨膜结构、信号肽、磷酸化位点及蛋白相互作用网络方面进行预测分析。【结果】6个蛋白(XooFabG1~XooFabG6)在理化性质、亲水性和信号肽方面区别较大,其中XooFabG1是一个不稳定蛋白,属于短链脱氢酶家族,具有酮脂酰ACP还原酶活性,但蛋白稳定性差,很可能与细菌应激状态下的反应有关。XooFabG3被标注为3-酮脂酰ACP还原酶,与EcFabG相比,功能相差较大,推测与辅因子和维生素的代谢相关。XooFabG5具有酮脂酰ACP还原酶结构域(KR domain),但该结构域在蛋白质序列中所处位置与EcFabG相比差异较大,推测其催化底物可能与EcFabG不同。XooFabG6在各方面的性质与EcFabG最接近,推测XooFabG6为3-酮脂酰ACP还原酶并参与脂肪酸合成代谢。但XooFabG2和XooFabG4的功能还不明确。【结论】本文通过预测分析黄单胞菌水稻致病变种中6个同源蛋白的特性,推测了其中4个蛋白可能具有的功能,对研究Xoo的脂肪酸合成途径具有一定意义。
- 马建荣余永红宋卉刘戈飞沈晓萌
- 关键词:生物信息学
- 市场销售大豆的转基因检测被引量:3
- 2018年
- 在市场随机购买大豆样品,采用试剂盒法提取基因组总DNA,并通过扩增大豆凝集素参照基因验证基因组总DNA的完整性,进一步通过检测转基因常用的Ca MV35S启动子和NOS终止子,分析检测样品是否为转基因品种。检测结果显示市售大豆80%为转基因大豆。
- 马建荣余永红
- 关键词:转基因检测PCR扩增大豆
- 一种黄原胶产量相关基因及其应用
- 本发明公开了一种黄原胶产量相关基因及其应用。黄原胶产量相关基因编码的氨基酸序列如SEQ ID NO.1所示,该基因的核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示。该基因可用于黄原胶生成菌株的遗传改造,提高黄胶原产量。采用该基因...
- 余永红马建荣宋卉迟海洋
- 一种菌黄素合成相关基因及其在构建产无色黄原胶工程菌中的应用
- 本发明公开了一种菌黄素合成相关基因XC_4092,基因序列如SEQ ID NO.1所示,其编码产物具有3‑酮脂酰ACP还原酶活性,能够催化菌黄素合成中的还原反应。本发明进一步的公开了基因XC_4092在生产无色黄原胶方面...
- 余永红王海洪马建荣
- 一种黄原胶产量相关基因及其构建高产黄原胶工程菌的应用
- 本发明公开了一种黄胶原产量相关基因及其构建高产黄原胶工程菌的应用。所述黄胶原产量相关基因即新基因XC_1672,序列如SEQ ID NO.1所示。该基因可用于黄原胶生成菌株的遗传改造,提高黄胶原产量。本发明将基因XC_1...
- 余永红王海洪马建荣迟海洋黎壮伟
- 妥布霉素生物合成基因簇中6’-脱氢酶基因的研究
- 黑暗链霉菌H6(Streptomyces tenebrarius H6)产生三种抗生素:安普霉素、氨甲酰妥布霉素和少量氨甲酰卡那霉素B。为研究妥布霉素生物合成基因簇中tacB基因的功能,利用PCR扩增获得tacB及其上下...
- 余永红
- 关键词:黑暗链霉菌
- 野油菜黄单胞菌中烯脂酰ACP还原酶的功能鉴定被引量:4
- 2016年
- 烯脂酰ACP还原酶是细菌脂肪酸合成的关键酶之一.本研究通过生物信息学分析发现,野油菜黄单胞菌Xanthomonas campestris(Xcc)8004基因组中XC_0119(Xccfab V)注释为反-2-烯脂酰Co A还原酶基因.但其编码产物与铜绿假单胞菌的烯脂酰ACP还原酶Fab V具有较高的同源性,并含有相同的催化活性中心Tyr-(Xaa)8-Lys序列.用携带Xccfab V的质粒载体互补大肠杆菌fab I温度敏感突变株JP1111,转化子能在42℃生长,表明Xccfab V能遗传互补大肠杆菌fab I突变.体外重建脂肪酸合成反应表明,Xcc Fab V能催化不同链长的烯脂酰ACP还原为脂酰ACP,且催化活性不受三氯森抑制.遗传学研究表明,Xccfab V是必需基因,不能获得Xccfab V基因敲除突变株.将携带大肠杆菌fab I的外源质粒导入野生菌后,可敲除染色体上的fab V基因,获得的替换突变株生长特性和脂肪酸组成未发生显著变化,但替换突变株对三氯森敏感.上述结果证实,野油菜黄单胞菌fab V是必需基因,编码烯脂酰ACP还原酶,参与脂肪酸从头合成反应,且Fab V是Xcc对三氯森耐受的根本原因.
- 余永红马建荣王海洪
- 关键词:野油菜黄单胞菌
- 野油菜黄单胞菌中LipB-LipA是唯一的硫辛酰化途径被引量:1
- 2020年
- 【目的】硫辛酸是细胞内重要的辅因子,参与多种基础代谢过程。野油菜黄单胞菌(Xcc)是十字花科植物黑腐病的病原菌,在全球范围内引起植物病害,引起重大经济损失。为此研究Xcc中硫辛酸的合成途径,为防治黑腐病提供新思路。【方法】利用大肠杆菌硫辛酸合成关键酶LipA和LipB序列,同源比对发现Xcc基因组中XC0713(XccLipA)和XC0712(XccLipB)具有较高的同源性。采用PCR方法分别扩增XccLipA和XccLipB基因,并连入表达载体pBAD24M后分别互补大肠杆菌突变株,并检测转化子生长表型。利用同源重组方法,获得替换突变株,分析其生长性状,并利用剪叶法检测替换突变株对寄主植物甘蓝的致病力。【结果】XcclipA和XcclipB能分别恢复大肠杆菌lipA和lipB突变株在基础培养上生长。XcclipA和XcclipB都是菌体生长的必需基因,不能直接被敲除。但导入pSRK-EclplA后,成功分别获得XcclipA和XcclipB敲除突变株。两种EclplA替换后的敲除突变株在基础培养上都不能生长,添加硫辛酸后能恢复生长表型。在丰富培养基上,XcclipB敲除突变株能正常生长,而XcclipA敲除突变株不能生长,添加硫辛酸后生长也能恢复。分别测定不同培养条件下生长曲线,也得到同样的结果。寄主植物侵染结果显示,与野生菌相比,XcclipA敲除突变株致病性几乎丧失,而XcclipB敲除突变株的致病性与野生菌无显著性差异。【结论】Xcc中lipA编码硫辛酸合成酶,lipB编码辛酰转移酶,两者都是必需基因。Xcc中LipB-LipA途径是唯一的硫辛酰化途径,而没有外源性的硫辛酸途径。lipA敲除后显著影响Xcc的致病性,可作为抗菌药物筛选的靶点。
- 马建荣刘安娜张文彬毛雅慧余永红
- 关键词:野油菜黄单胞菌
- 一种直接产生妥布霉素的工程菌及其应用
- 本发明属于医药技术领域,涉及一种直接产生妥布霉素的工程菌及其应用,主要是对妥布霉素产生菌中氨甲酰转移酶基因实施了破坏,菌种不再产生氨甲酰妥布霉素,而是产生妥布霉素。本发明通过框架内删除失活的方法阻断黑暗链霉菌中tacA基...
- 夏焕章隋鑫余永红侯曦凡