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三氯乙烯职业中毒皮肤损害与HLA-DR、DQ基因相关性研究被引量：4: 2007年; [目的]从HLA-DR、DQ基因角度探讨三氯乙烯职业中毒皮肤损害易感的遗传背景。[方法]采用PCR- SSP(sequence specific primer)法对三氯乙烯职业中毒皮肤损害组(病例组)及对照组进行HLA-DR、DQ基因位点等位基因分型。[结果]HLA-DRB1位点在病例组检出11个等位基因,11个血清型;对照组检出13个等位基因,13个血清型。HLA-DQB1位点在病例组及对照组均检出5个等位基因,7个血清型。获得了各等位基因分布及基因频率资料,其中DRB1*09(DR9)和DQB1*03(DQ9)等位基因频率在病例组与对照组间差异均有显著性(P<0．05);OR值(95％可信区间)分别为DRB1*09(DR9)等位基因为0．174(0．037～0．830),DQB1*03(DQ9)等位基因为0．226(0．046～1．108)。[结论] DRB1*09(DR9)和DQB1*03(DQ9)等位基因可能是三氯乙烯职业中毒皮肤损害的保护基因。; 庾蕾庄志雄黄海雄俞慕华叶小明谢富焕; 关键词：三氯乙烯皮肤损害人类白细胞抗原基因多态性

几种重要DNA修复基因对化学毒性的保护机制及多态性研究: 庄志雄唐焕文胡大林江高峰杨淋清黄海燕刘建军袁建辉胡恭华庾蕾刘起展何云朱志良陈雯任泽舫沙焱杜柳涛刘汝青王军彩杨晓华蒋友胜杨建平涂晓志叶小明; 本研究是申请者在自己多年来主持多项国家级、省级、市级课题的基础上，总结提炼的自选项目，属于预防医学领域。　　研究系列结合分子生物学实验研究与流行病学调查的方法，建立了研究DNA 修复基因功能的技术平台，构建了人类错配修复...; 关键词：; 关键词：DNA 修复基因基因多态性

反式二羟环氧苯并(a)芘所致人支气管上皮细胞POLK基因高表达被引量：2: 2007年; 目的观察不同剂量反式二羟环氧苯并(a)芘(anti-BPDE)处理对人支气管上皮细胞(16HBE)POLK基因表达的影响。方法分别以0.25、0.50、1.00、2.00μmol/L的反式-BPDE1次或3次处理16HBE细胞,采用TaqmanMGB探针实时定量聚合酶链反应方法相对定量POLK和POLZ基因表达,同时对反式-BPDE转化的16HBE及肺癌H1299细胞POLK基因表达进行了分析。结果反式-BPDE1次处理及3次处理可诱导正常16HBEPOLK基因高表达。反式-BPDE转化16HBE和肺癌H1299细胞POLK基因表达明显增高,分别是正常16HBE的2.25和5.49倍。结论反式-BPDE处理可致16HBEPOLK基因高表达。; 庾蕾纪卫东庄志雄杨淋清张仁利叶小明刘建平; 关键词：POLK 实时定量聚合酶链反应人支气管上皮细胞

TaqMan-MGB探针检测人REV3L基因的毒物兴奋效应被引量：5: 2005年; 研究低剂量紫外线照射诱导人胚肺成纤维细胞(MRC5)REV3L基因表达量变化的毒物兴奋效应,用四氮唑盐比色法(MTT法)检测细胞增值抑制率,得到紫外线对MRC5毒性的剂量反应关系,并对低剂量处理组(10s和20s)和高剂量处理组(30s、60s和300s)染毒细胞,采用TaqManMGB探针,进行荧光实时定量PCR,检测REV3L基因表达量的变化.发现低剂量处理组(20s)使REV3L基因的表达量明显增高.表明低剂量紫外线照射可以引起MRC5细胞REV3L基因产生毒物兴奋效应.; 叶小明庾蕾庄志雄胡章立; 关键词：紫外线

三氯乙烯药疹样皮炎患者肿瘤坏死因子α-857C/T基因多态性研究被引量：4: 2006年; 目的从肿瘤坏死因子α(TNFα)基因-857位点多态性角度探讨三氯乙烯药疹样皮炎易感的遗传背景。方法采用TaqManMGB探针,建立TNFα-857C/T位点实时定量聚合酶链反应分型方法。用该方法对三氯乙烯药疹样皮炎组(47例)及对照组(53例)进行-857nt(C/T)位点分型,比较病例组与对照组之间各基因型及等位基因频率是否有差异。结果TNFα-857C/T多态的基因型及等位基因频率在三氯乙烯药疹样皮炎组及对照组差异无显著性(P>0.05)。结论TNFα-857C/T位点多态可能不是中国人群三氯乙烯药疹样皮炎的风险因子。; 庾蕾庄志雄叶小明黄海雄杨淋清; 关键词：三氯乙烯药疹样皮炎肿瘤坏死因子Α 单核苷酸多态性

血痕Chelex 100抽提DNA用于人类TNF-α基因启动子区SNP分型被引量：4: 2005年; 建立快速、简便的血样本采集及DNA抽提方法,可用于大规模的分子流行病学调查及群体遗传学研究。采用无菌纱布为载体取血,Chelex100快速抽提DNA,用TaqManMGB探针对人类TNF-α基因启动子区-857(C/T)位点进行SNP分型。344份血样均得到明确的分型结果,获得的荧光信号强,本底低。深圳地区汉族群体-857位点基因型频率分别为:cc为0.78,ct为0.21,tt为0.01。血痕Chelex100抽提DNA为大规模血样本的采集,DNA的抽提提供了有效的手段。; 庾蕾庄志雄叶小明甘永霞杨学艳; 关键词：血痕 DNA TNF-Α 基因启动子区 SNP分型

实时RT-PCR基因表达相对定量REST~软件分析与2^((-ΔΔCT))法比较被引量：22: 2007年; 目的利用实时RT-PCR技术建立一种简便、准确的基因表达相对定量方法。方法以正常的人支气管上皮细胞株(16HBE)cDNA为模板5倍系列稀释,分别作DNA聚合酶K(POLK)和磷酸甘油醛脱氢酶(GAPDH)基因标准曲线。以不同剂量反式二羟环氧笨并芘(anti-BPDE)诱导的16HBE、anti-BPDE转化的16HBE及肺癌细胞株(H1299)cDNA为模板,进行实时定量RT-PCR。以GAPDH基因作为内参照,进行POLK基因表达相对定量。实验数据分别采用2(-ΔΔCT)法及REST软件分析。结果5倍系列稀释法制作的标准曲线,呈现较好的线型关系(Rsq0.997)。POLK及GAPDH基因扩增效率分别为117.5%和103.5%。采用2(-ΔΔCT)法计算出的表达比值均比REST软件分析高。结论实时RT-PCR技术结合REST软件分析是一种简便、准确的基因表达相对定量分析手段。; 庾蕾刘建平庄志雄杨淋清张仁利叶小明程锦泉; 关键词：基因表达

用Taqman MGB探针研究中国人群TNF-α基因启动子区单核苷酸多态性被引量：4: 2006年; 目的了解中国人群肿瘤坏死因子α(thetumournecrosisfactorα,TNF-α)基因启动子区多态性。方法随机选取20名深圳地区汉族健康体检者,采用两对引物PCR扩增TNF-α基因启动子区(-1389nt～+125nt),对PCR产物进行序列分析,寻找单核苷酸多态性位点(singlenucleotidepolymorphisms,SNPs)。采用TaqmanMGB探针建立了-857nt(C/T)位点的实时定量PCR(thereal-timePCR)分型方法,并对中国汉族、壮族、布依族,水族及苗族群体共1108份样本进行了基因分型。结果在启动子区(-1322nt～+67nt),发现6个SNP位点,即-885(A/G)、-863(C/A)、-646(G/A)、-648(G/A)、-568(G/C)和-857(C/T),其中位点-646nt(G→A)为新发现SNP。-885、-648及-568nt位点碱基虽然与Genbank不同,但测序的20个个体基因分型相同。中国人群-857nt(C/T)位点基因型频率分别为0.79(CC),0.19(CT)和0.02(TT),中国汉族、壮族、布依族,水族及苗族群体间无显著性差异。中国人群-857T等位基因频率为0.116,与文献报道的韩国人群相同,但比日本人群低。结论中国人群TNF-α基因启动子区单核苷酸多态性可能较保守。采用TaqmanMGB探针实时定量PCR技术对SNPs进行基因分型简便、快速及准确,易于自动化,为大规模的疾病相关性研究提供了有效的工具。; 庾蕾庄志雄谢富焕黄海雄叶小明; 关键词：多态性肿瘤坏死因子Α 单核苷酸多态性实时定量PCR TAQMAN

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叶小明

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