杨娟
- 作品数：22 被引量：68H指数：5
- 供职机构：中国农业科学院饲料研究所更多>>
- 发文基金：中央级公益性科研院所基本科研业务费专项“十一五”国家科技支撑计划武汉市科技攻关计划项目更多>>
- 相关领域：农业科学医药卫生文化科学经济管理更多>>
- 基于网络药理学和分子对接探讨常见酚酸提高机体免疫力的作用机制被引量：3
- 2023年
- 目的:运用网络药理学和分子对接研究常见酚酸类化合物提高机体免疫力的分子机制。方法:利用TCMSP数据库、STITCH数据库、SwissTargetPrediction在线靶点筛选平台收集常见酚酸类化合物潜在靶点,并利用Cytoscape3.8.0软件构建酚酸类化合物-靶点网络图。在GeneCard数据库、OMIM数据库收集免疫力相关靶点,与常见酚酸类化合物靶点取交集并导入STRING数据库进行蛋白质与蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)分析,得到酚酸类化合物提高免疫力的核心作用靶点,将核心靶点导入DAVID数据库进行GO功能富集及KEGG通路富集。最后,应用AutoDock软件对关键成分与关键靶点进行分子对接验证。结果:共收集到常见酚酸类化合物36个,对应靶点496个,提高免疫力靶点16691个,二者取交集,获得酚酸类化合物增强免疫作用靶点454个,其中关键作用的靶点为SRC、MAPK1、HSP90AA1、AKT1、TP53等,发挥作用的主要成分为迷迭香酸、迷迭香酸甲酯、鞣花酸、阿魏酸乙酯、芥子酸等。GO及KEGG分析结果显示,常见酚酸类化合物通过调控正调控RNA聚合酶Ⅱ启动子转录、转录的正调控,DNA模板化、凋亡过程的负调节等生物过程,通过癌症通路、多聚糖肿瘤通路、MAPK信号通路等多条通路发挥增强免疫作用。分子对接结果表明,关键化合物与靶点分子对接结果良好,验证了网络药理学预测结果的准确性。结论:本研究揭示常见酚酸类化合物通过调控多靶点、多途径发挥增强机体免疫力的作用,为酚酸类化合物的开发及进一步研究奠定基础。
- 张宇欣刘魏魏杨娟周炜炜戴小枫李秀梅郑威
- 关键词：免疫功能网络药理学分子对接
- 基于网络药理学和分子对接分析赤芍抗氧化应激作用的活性成分及其机制被引量：6
- 2023年
- 【目的】利用网络药理学及分子对接技术分析赤芍抗氧化应激作用的有效活性成分及其分子机制。【方法】运用TCMSP数据库搜集赤芍的活性成分和靶点,借助UniProt数据库对靶点进行基因名转化;通过GeneCards和OMIM数据库检索氧化应激的相关基因,利用Veeny在线平台获得赤芍与氧化应激的交集靶点,将交集靶点上传至STRING数据库和Cytoscape 3.8.0软件建立蛋白互作(PPI)网络图和赤芍-靶点-氧化应激可视化网络并进行拓扑学分析,筛选关键靶点;运用Metascape数据库对关键靶点进行GO功能和KEGG通路富集分析,确定赤芍发挥抗氧化应激作用的活性成分和信号通路;运用AutoDock和PyMol软件对赤芍发挥抗氧化应激作用的核心靶点进行分子对接验证。【结果】共筛选到12个赤芍活性成分,包括黄芩素、β-谷甾醇、鞣花酸、豆甾醇、(+)-儿茶素等;赤芍活性成分与氧化应激靶点分别有76和4873个,其中赤芍与氧化应激交集靶点共69个,包括蛋白激酶B(AKT1)、转录因子AP-1(JUN)、细胞肿瘤抗原p53(TP53)、肿瘤坏死因子(TNF)和半胱氨酸蛋白酶-3(CASP3)等;GO功能和KEGG通路富集结果提示,赤芍抗氧化应激与磷脂酰肌醇-3-激酶/蛋白激酶B(PI3K-Akt)、核因子κB(NF-κB)等多个信号通路有关;分子对接结果表明,赤芍主要活性成分黄芩素、β-谷甾醇与核心靶点有较好的结合能力。【结论】赤芍可能通过黄芩素、β-谷甾醇、鞣花酸等活性成分调控PI3K-Akt、NF-κB、白细胞介素-17(IL17)等信号通路中的关键靶点来发挥抗氧化应激作用。
- 豆佳红王梓颖杨娟周炜炜张同存何红鹏戴小枫李秀梅
- 关键词：赤芍抗氧化应激网络药理学分子对接
- 基于网络药理学研究板蓝根抑菌活性成分及其作用机制被引量：5
- 2022年
- 旨在基于网络药理学研究板蓝根的主要抑菌药效成分及其作用机理。利用中药系统药理学在线分析数据库(TCMSP)筛选出板蓝根药效成分及其潜在作用靶点,通过OMIM和GeneCards数据库以“抑菌”为关键词搜索相关靶点。通过Venny平台获取板蓝根和抑菌的交集靶点。通过STRING数据库结合Cytoscape软件构建PPI网络图并筛选关键靶点。通过DAVID数据库进行GO功能富集和KEGG通路富集分析。通过Autodock Tools 1.5.7软件将关键药效成分和抑菌靶点进行分子对接。通过菌落计数法和SDS-PAGE法验证关键药效成分抑菌作用和作用靶点。结果显示:共筛选到药效成分33个,药物靶点61个,抑菌靶点2192个,药物与抑菌作用交集靶点32个。蛋白互作网络分析发现,TNF、TP53、CASP3、JUN、ESR1、PTGS2等30个蛋白可能是板蓝根抑菌作用的关键靶点。GO功能富集分析得到126个条目,包括生物过程条目86个(如对雌二醇的反应、凋亡信号通路、神经元凋亡过程的正调控),细胞组分条目11个(如细胞质、核),分子功能条目29个(如蛋白质同源二聚化活性、酶结合)。KEGG通路富集分析得到20条通路。分子对接结果显示,度值排名前3位的活性成分(β-谷甾醇、豆甾醇、金合欢素)与关键抑菌靶点编码蛋白的结合能均<0kJ·mol^(-1)。抑菌试验验证表明,豆甾醇是板蓝根的关键药效成分,其能够下调胞内CASP3和PTGS2蛋白的表达。板蓝根主要通过药效成分豆甾醇作用于PTGS2、CASP3靶点,通过TNF、癌症途径信号通路发挥抑菌作用。
- 田薇李秀梅杨娟王小莹周炜炜李中媛戴小枫
- 关键词：板蓝根网络药理学抑菌活性
- 基于网络药理学探讨白龙散治疗鸡腹泻的作用机制被引量：3
- 2022年
- 【目的】采用网络药理学技术与方法预测白龙散治疗鸡腹泻的物质基础、作用靶点和通路。【方法】通过中药系统药理学分析数据库TCMSP筛选中药复方白龙散中的白头翁、黄连、龙胆的有效活性成分及其潜在作用靶点。通过GeneCards和OMIM数据库检索鸡腹泻的相关疾病靶点。利用Venny平台获得药物和疾病的交集靶点。将交集靶点上传至STRING数据库进行分析,构建蛋白互作(PPI)网络图并获得关键靶点,并进一步对关键靶点进行GO功能和KEGG通路富集分析。【结果】共筛选得到活性成分27个,药物靶点57个,疾病靶点4207个;药物与疾病交集靶点45个。PPI网络发现原癌基因蛋白质C(MYC)、雌激素受体1(ESR1)、白细胞介素-6(IL-6)、G1/S-specific周期蛋白D1(CCND1)等45个蛋白可能是白龙散治疗鸡腹泻的关键靶点。GO功能富集分析确定了112个条目,KEGG通路富集分析确定了22条通路。【结论】中药复方白龙散主要通过槲皮素、山奈酚、异鼠李素等多个化学成分调控转录因子AP-1(JUN)、MYC、ESR1、IL-6等靶点,作用于细胞因子-细胞因子受体相互作用、肿瘤抑制蛋白(p53)信号通路、丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)等信号通路来治疗鸡腹泻。
- 王小莹李秀梅王秀敏刘魏魏杨娟田薇周炜炜戴小枫
- 关键词：网络药理学
- 新型饲料添加剂藤茶黄酮的研究进展被引量：9
- 2011年
- 藤茶黄酮是从藤茶中提取的一种天然植物添加剂,二氢杨梅素是其主要的化学成分。近年来,研究者对藤茶黄酮及二氢杨梅素在畜禽生产上的应用效果进行了广泛研究,发现以其作为饲料添加剂,能有效提高动物机体免疫力,增强生产性能、促进生长,并具有抗氧化作用,可改善动物产品品质。作者主要阐述了藤茶黄酮作为一种新型天然饲料添加剂在动物生产上的研究进展。
- 杨娟赵炳超于倩倩李秀波
- 关键词：二氢杨梅素饲料添加剂
- 苍术茎叶HPLC指纹图谱质量评价方法
- 本发明涉及农业生物技术领域，具体涉及苍术茎叶提取物的HPLC指纹图谱质量评价方法。本申请采用高效液相色谱法建立苍术茎叶的质量控制方法，通过考察波长、流动相、改性剂、柱温、流速和分析时间等对苍术茎叶化学成分数量和分离度的影...
- 李秀梅戴小枫杨娟石冬冬田薇
- 基于网络药理学研究槲皮素调控黄曲霉菌引起宿主感染的分子机制
- 2022年
- 试验基于网络药理学方法研究槲皮素调控黄曲霉菌引起宿主感染的分子网络调控机制。利用中药系统药理学在线分析数据库(TCMSP)筛选出槲皮素潜在作用靶点,通过Genecards数据库以“黄曲霉菌”为关键词检索相关靶点;通过Venny平台获取槲皮素和黄曲霉菌的交集靶点,String数据库建立PPI网络图并选取关键靶点,DAVID数据库进行GO功能富集和KEGG通路富集分析;通过Autodock Tools 1.5.7软件将槲皮素和核心抑菌靶点进行分子对接。结果显示:共筛选得到槲皮素潜在作用靶点128个,黄曲霉菌相关靶点60个,槲皮素调控黄曲霉菌引起宿主感染关键靶点12个。GO功能富集分析得到144个条目,包括生物过程条目127个(如细胞因子介导的信号通路、细胞对脂多糖的反应、基因表达的正向调控),细胞组分条目3个(如细胞外空间、细胞外区、细胞表面),分子功能条目14个(如咖啡因氧化酶活性、细胞因子活性、酶结合)。KEGG富集分析结果显示,槲皮素调控黄曲霉菌引起宿主感染与炎症性肠病、IL-17信号通路、TNF信号通路等10条信号通路相关。分子对接结果显示,IL-6与槲皮素有较好亲和力,可能是槲皮素调控黄曲霉菌引起宿主感染的主要靶点。研究表明,槲皮素可能通过IL-17、TNF信号通路的关键靶点IL-6调控黄曲霉菌引起宿主感染。
- 田薇孙悦龙杨娟李中媛李秀梅
- 关键词：槲皮素黄曲霉菌网络药理学
- 苍术茎叶HPLC指纹图谱质量评价方法
- 本发明涉及农业生物技术领域，具体涉及苍术茎叶提取物的HPLC指纹图谱质量评价方法。本申请采用高效液相色谱法建立苍术茎叶的质量控制方法，通过考察波长、流动相、改性剂、柱温、流速和分析时间等对苍术茎叶化学成分数量和分离度的影...
- 李秀梅戴小枫杨娟石冬冬田薇
- 动物专用抗原虫药咪唑苯脲研究进展被引量：11
- 2012年
- 咪唑苯脲是一种具有良好治疗和预防作用的动物专用抗原虫药。文章综述了其理化性质、抗原虫机理、药代动力学、毒性、残留和临床应用等方面的研究进展,旨在为其在兽医临床的合理使用提供理论依据。
- 赵蕾蕾杨娟刘义明李鹏飞王中杰苏丹李秀波
- 关键词：咪唑苯脲药代动力学毒性
- 沃尼妙林中甲基叔丁基醚残留量的测定
- 2010年
- 建立了沃尼妙林中甲基叔丁基醚残留量的测定方法。采用顶空进样毛细管气相色谱法,HP-innowax毛细管柱,载气为氮气,氢火焰离子化检测器,水为溶解介质,检测了沃尼妙林原料药中甲基叔丁基醚的残留量。结果表明:在0.59～37.04μg/mL浓度范围内,药物浓度与峰面积具有良好的线性(r=0.999 95),平均回收率为94.95%,RSD为0.47%,检测限为0.01μg/mL。
- 杨娟范志影郭桂芳李鹏飞于倩倩李秀波
- 关键词：顶空毛细管气相色谱法
