毛宇荣
- 作品数:1 被引量:8H指数:1
- 供职机构:中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金国家高技术研究发展计划更多>>
- 相关领域:医药卫生更多>>
- 中国轮状病毒非结构蛋白NSP4基因变异特征的分析被引量:8
- 2003年
- 目的 研究我国轮状病毒流行株NSP4基因的变异特点。方法 对近年来从我国不同地区获得的 2 7份人轮状病毒流行株的NSP4基因用RT PCR进行扩增 ,克隆后进行全长cDNA序列分析 ,并利用Clustal× 1.8,TreeView3 2及DNAStar软件与参比株Wa、KUN、AU 1、EW及来自GenBank的OSU、SA11、Hochi、US2 44、Bristol株的NSP4序列进行分析比较。采用PCR分型方法对VP7血清型进行鉴定 ,确定轮状病毒G型与NSP4基因型的关系。结果 氨基酸同源性比较表明 ,我国轮状病毒不同流行株NSP4之间同源性为 81.7%~ 99.4% ,据此可将 2 7株RVNSP4分为 2组 ,分别以Wa株和KUN株为代表 ,其中以Wa组为主。组内同源性分别为 92 .0 %~ 99.4%和 92 .0 %~ 98.9% ,组内变异率分别为 0~ 8 5 %及 1 2 %~ 8 5 %。两组间变异率达 16 6%~ 2 1 0 %。氨基酸进化树提示在Wa组内包括 3个亚组。轮状病毒G血清型与NSP4基因型之间的联系不确定。结论 我国流行株NSP4基因主要可分为Wa组和KUN组 ,在Wa组内可形成三个亚组 ,并且在高变区有特征性的氨基酸位点。
- 王大燕王健伟徐倏燊温乐英毛宇荣于修平洪涛
- 关键词:轮状病毒属蛋白质构象基因转变