目的研究2016年山东省烟台地区手足口病(hand,foot and mouth disease,HFMD)的病原谱组成特点,分析烟台HFMD病原谱中柯萨奇病毒A组6型(coxsackie virus A group 6 type,CV-A6)流行株的进化及VP1区重要氨基酸位点的变异情况。方法采用real-time RT-PCR方法,对2016年烟台地区采集于HFMD患者的738份样品进行肠道病毒(enterovirus,EV)核酸检测和分子定型,统计各型EV阳性标本数量及比例。根据EV的优势型别,选取8株CV-A6进行VP1区扩增,并进行核苷酸序列测定和分析,然后进行系统进化分析。结果从738份标本中检出EV 460份,主要病原构成为柯萨奇病毒A组16型(coxsackie virus A group 16 type,CV-A16)(56.09%,258/460)、肠道病毒A组71型(enterovirus A group 71 type,EV-A71)(13.48%,62/460)、柯萨奇病毒A组10型(coxsackie virus A group 10 type,CV-A10)(10.65%,49/460)、CV-A6(9.57%,44/460)、柯萨奇病毒A组4型(coxsackie virus A group 4 type,CV-A4)(1.96%,9/460)。其中成功分离到8份CV-A6阳性标本毒株,并进行了全长VP1区核苷酸序列分析,8株CV-A6的序列分析结果表明,其核苷酸相似性为96.12%~100%,氨基酸相似性为97.78%~100%。系统进化分析显示8株CV-A6烟台株均属于D基因型中的D3基因亚型。与参考株CVA6-Gdula-AY421764相比,烟台市CVA16分离株VP1第10、14、174、194、279、283、305位氨基酸出现突变。结论CV-A16、EV-A71、CV-A10、CV-A6是引起2016年烟台地区HFMD发病的常见病原体,本次分离到的CV-A6均属于D基因型中的D3基因亚型。
目的通过Meta分析评价多重荧光定量PCR（multiplex real time polymerase chain reaction，MRT—PCR）方法在呼吸道病毒中常见呼吸道合胞病毒（respiratory syncytial virus，RSV）和腺病毒（adenovirus，ADV）感染的诊断价值，为临床应用提供参考。方法检索数据库包括PubMed、EMBASE、Cochrane、万方、CNKI等，检索2010年1月至2018年1月关于MRT—PCR方法检测呼吸道病毒感染的中英文文献，由2位研究者独立筛选文献、提取资料，并采用QUADAS-2工具评价纳人研究的偏倚风险后，采用Meta—disc1．4对数据进行统计分析。结果本研究纳入10篇文献共2528例样本。Meta分析结果显示，MRT—PCR检测RSV的Sen合并=0．87（95％CI：0．83—0．90）、Spe合并=0．98（95％CI：0．97—0．98）、AUC=1．00。MRT—PCR检测ADV的Sen合并=0．64（95％CI：0．56—0．71）、Spe合并=0．99（95％CI：0．98—0．99）、AUC=0．99、Q=0．96。Deeks漏斗图检验结果提示无明显的发表偏倚。结论MRT-PCR方法检测RSV和ADV的灵敏度有待提高，但检测综合能力较好，对临床上呼吸道病毒感染的早期诊断具有一定的应用价值。
