王大鹏
- 作品数：48 被引量：87H指数：5
- 供职机构：上海交通大学更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金国家高技术研究发展计划国家科技支撑计划更多>>
- 相关领域：医药卫生轻工技术与工程农业科学生物学更多>>
- 1株三型丁香假单胞菌猕猴桃致病变种细菌全基因组扫描图测序及分析被引量：2
- 2020年
- 丁香假单胞菌猕猴桃致病变种(Pseudomonas syringae pv.actinidiae,简称Psa)是引起猕猴桃细菌性溃疡病的病原菌。对从感染溃疡病的东红猕猴桃枝条中分离得到的1株Psa野生株(命名为GX05)进行全基因组测序,获得基因组草图,分析其中毒力基因、耐药基因和致病基因的情况。研究发现,多位点序列分型结果显示GX05为biovar 3,与毒力因子数据库比对,GX05携带99种毒力因子及692个相关毒力基因,同源性和匹配度最高的毒力因子是PvdL和Irp1;与综合抗生素抗性基因数据库比对,GX05携带336种耐药基因,与29种抗生素有关;与病原宿主互作数据库比对,不表达导致病原菌致病力减弱的基因数量最多,其中同源性和匹配度最高的是PvdL,此外与增强致病力相关的同源性和匹配度最高的基因是hrcC。通过全基因组测序信息初步分析了1株三型Psa菌株中存在的毒力、耐药及致病基因情况,对深入研究其致病机制和合理用药有重要意义。
- 邓博涵刘丹蕾陈秋菊倪培恩张子蕾王大鹏纠松涛王磊马超张才喜王世平沈叶鑫鲍金平许文平
- 关键词：猕猴桃细菌性溃疡病全基因组测序毒力基因耐药基因致病基因
- 上海市售海产品中副溶血性弧菌的分布状况被引量：13
- 2015年
- 海产品中副溶血性弧菌引起的食物中毒已成为我国沿海地区细菌性食物中毒的首要病原。本研究中针对上海市闵行区某农贸市场的海产品开展为期1年的调查分析,共采集257份样品。按照国家标准(GB/T4789.7-2008),以硫代硫酸钠柠檬酸胆盐蔗糖培养基(TCBS)和科玛嘉弧菌显色培养基(CV)两种选择性培养基辅助分离副溶血性弧菌疑似菌株,结合生化试验和PCR方法对疑似菌株进行鉴定,从84份阳性样本中获得107株副溶血性弧菌分离株。其结果表明:该农贸市场市售海产品中副溶血性弧菌的污染率为32.7%,其中牡蛎中副溶血性弧菌污染率最高(达54.4%),蛤蜊和海瓜子次之(分别为33.9%,25.6%)。牡蛎中副溶血性弧菌的污染水平与季节性变化直接相关。对107株分离株的主要毒力基因tdh和trh进行PCR筛查,tdh阳性菌株为10株,trh阳性菌株为1株,并且此株菌为tdh、trh双阳性菌株,tdh和trh的携带率分别为9.4%和1.0%,tdh、trh双基因的携带率为1.0%。结论:市售海产品中副溶血性弧菌污染状况较为严重。这为政府相关职能部门开展食品安全防控提供了参考依据。
- 陈志芸施春雷周秀娟张茜周敏王大鹏史贤明
- 关键词：海产品副溶血性弧菌PCR
- A组轮状病毒原位捕获RT-qPCR检测体系的建立及评估被引量：1
- 2021年
- 目的建立基于原位捕获反转录实时定量PCR方法(in situ capture real time quantitative reverse transcription PCR,ISC-RT-qPCR)检测感染性A组轮状病毒(group A rotavirus,RVA)的体系,并对其进行评估。方法以自行构建的NSP3重组质粒为对象,绘制标准曲线;通过优化ISC-RT-qPCR体系中猪胃粘膜提取物(porcine gastric mucin,PGM)包被浓度、孵育时间、孵育缓冲液pH和封闭时间的参数,建立、完善RVA的ISC-RT-qPCR检测体系,并评估该体系的特异性、检测限及稳定性。结果ISC-RT-qPCR最佳试验参数分别为:PGM包被浓度为1.0 mg/mL、孵育时间为60 min、孵育pH为9.0、封闭时间为60 min;体系的检测限约为5拷贝/mL,检测特异性强、稳定性好。结论本研究所建立的ISC-RT-qPCR是一种可用于检测感染性RVA的方法,具有操作简单、绿色环保、可高通量检测等优点,适合于临床、尤其是低病毒载量的食品和环境样品中RVA的快速检测。
- 鲁飞凤吕陈昂石镇涛王大鹏
- 关键词：A组轮状病毒
- 一种人源诺如病毒免疫胶体金试剂盒及细胞株
- 本发明公开了一种人源诺如病毒免疫胶体金试剂盒，涉及分子生物学与免疫学领域，包括固相载体、检测抗体和样品处理液，其中固相载体包括样品垫、胶体金结合垫、具有检测线和质控线的承载膜、吸收垫及底板，胶体金结合垫包括结合垫本体和涂...
- 王大鹏
- 文献传递
- 氨基化磁性纳米粒子捕获基因组DNA结合PCR快速检测牛奶中金黄色葡萄球菌被引量：3
- 2017年
- 本研究对氨基化磁性纳米粒子进行优化,再用优化后的纳米粒子分离牛奶样品中微量的金黄色葡萄球菌基因组DNA,结合PCR检测,可以达到100 CFU/m L的检测限。在此过程中,纳米粒子与DNA的复合物直接加入到PCR体系中进行检测,无需洗脱、纯化等步骤,这样既减少了操作步骤,也减少了DNA损耗,还起到了浓缩的作用。而且,此方法中纳米粒子无需抗体等生物分子标记,成本非常低廉,在生命物质的快速检测中具有广阔的前景与巨大的潜力。
- 崔妍白亚龙施春雷王大鹏史贤明
- 关键词：金黄色葡萄球菌
- 沙门氏菌内标PCR快速检测试剂盒的研制与应用被引量：12
- 2011年
- 【目的】研制一种能有效指示假阴性的PCR检测产品,用于沙门氏菌快速、准确、灵敏的检测。【方法】针对沙门氏菌invA基因、stn基因序列分别设计引物与扩增内标,建立添加扩增内标的沙门氏菌PCR检测方法,组装试剂盒,并对试剂盒的各项性能进行评价。【结果】试剂盒对147株沙门氏菌和28株非沙门氏菌的检测结果显示,所有沙门氏菌均能扩增出362 bp的目标条带,非沙门氏菌仅扩增出520 bp的内标条带。试剂盒检测沙门氏菌基因组DNA的检测限为8.0 fg/PCR,检测染菌量为4—5 CFU/10 mL的牛奶样品,增菌8—10 h即得到阳性结果。反复冻融60次或-20℃下贮存1年,均不影响试剂盒的使用效果。对食品样品的检测结果显示,阳性检出率为2/30,与国标法的检测结果相符,比未添加扩增内标的PCR检测结果(阳性检出率为1/30)准确。【结论】采用添加扩增内标的PCR试剂盒检测沙门氏菌,特异性强、灵敏度高、稳定性好,并能有效指示假阴性,提高检测的准确性,适用于食品中沙门氏菌的快速筛检。
- 李小玲刘斌但现龙王大鹏周敏史贤明
- 关键词：沙门氏菌扩增内标检测试剂盒
- 诺如病毒研究进展被引量：3
- 2017年
- 近年来，媒体曝光了多起因诺如病毒（Norovirus，以下简称“NoV”）污染导致的食品安全事件，目前，美国、英国、法国、德国、日本、澳大利亚、中国等诸多国家都有NoV感染的报道。NoV每年可导致全球125亿人次感染和3．5万人死亡，且发病量逐年攀升。通过对我国27个省份173家哨点门诊2009年～2013年腹泻病例的调查可以发现。
- 王大鹏
- 关键词：病毒食品安全事件NOV
- 一种基于显微红外光谱技术快速检测副溶血弧菌的方法
- 本发明涉及食品安全领域，建立了一种基于显微红外光谱技术快速检测副溶血弧菌的方法。本发明方法为：利用显微红外光谱仪采集细菌的红外谱图，进行数据预处理后提取特征中红外波段（3000-2800cm<Sup>-1</Sup>、1...
- 史贤明喻文娟施春雷侯静文王瑞斌朱邦尚王大鹏
- 文献传递
- 一种多氨基硅包磁性纳米粒子的制备与应用
- 本发明公开了一种多氨基硅包磁性纳米粒子的制备方法与应用，以磁性纳米粒子为核心，用反相微乳液法对磁性核心进行包硅与氨基化修饰，在氨水催化作用下，水解TEOS和APTES，包被硅层的同时表面形成粗糙的网状结构，此结构表面携带...
- 史贤明白亚龙施春雷崔妍王大鹏
- 文献传递
- 人源诺如病毒的受体和配体
- 2023年
- 人源诺如病毒(human norovirus,HuNoV)是重要的食源性病毒,可导致全球范围内非细菌性肠胃炎的暴发;每年全球约6.84亿例患者感染,经济损失超600亿美元[1]。HuNoV隶属于杯状病毒科(Caliciviridae)诺如病毒属,病毒颗粒直径约35 nm,无囊膜,二十面体对称[2]。病毒基因组由单股正链RNA编码,约7.5 kb,由3个开放阅读框(open reading frame,ORF)组成[3]。ORF 2编码主要结构蛋白(VP1);VP1又被分为壳区(shell domain,S)蛋白和突出区(protruding domian,P)蛋白,后者负责结合中和抗体及识别病毒受体/配体[4]。根据VP1的序列差异,HuNoV至少被分为39种基因型[3],全球范围内的主要流行毒株是GII.4型,是HuNoV研究领域的典型代表。不同基因型病毒的生物学特性具有一定的差别,导致HuNoV研究难度陡增。
- 王大鹏
- 关键词：病毒颗粒肠胃炎病毒基因组诺如病毒中和抗体非细菌性
