甄博珺
- 作品数：30 被引量：166H指数：7
- 供职机构：北京市通州区疾病预防控制中心更多>>
- 发文基金：国家科技重大专项北京市自然科学基金首都卫生发展科研专项更多>>
- 相关领域：医药卫生生物学更多>>
- 2022年北京市通州区一起霍乱疫情分离菌株的病原学特征分析被引量：3
- 2023年
- 目的分析2022年北京市通州区一起霍乱弧菌引起的疫情的病原学特征,并与引起通州区过往疫情的菌株进行比对分析。方法用实时荧光PCR方法检测样本中O1/O139群霍乱弧菌的特异性基因,同时按常规法对样本进行菌株的分离培养鉴定;用普通PCR方法检测霍乱弧菌的11种毒力基因;用微量肉汤稀释法进行12种药物的敏感性试验,采用NotⅠ限制性内切酶进行脉冲场凝胶电泳(PFGE)和聚类分析,基于全基因组序列进行菌株遗传学分析。结果本次疫情共检出5株O1群小川型非产毒霍乱弧菌,所有菌株均携带ompU、toxR、tcpI、tcpA^(EL)、hlyA^(EL)、hlyA^(CL)和rtxC基因,不携带ctxAB基因,5株菌耐药情况一致,均为美罗培南–头孢噻肟–头孢他啶–链霉素–氨苄西林–氨苄西林/舒巴坦6种药物耐药,为多重耐药菌株。PFGE分6种带型Ⅰ~Ⅵ,本次疫情菌株带型为Ⅱ型。与通州区既往检出的菌株相比,与2011年2株产毒O1群小川型霍乱弧菌带型较为接近,耐药情况一致,毒力基因携带情况有所差异,但都携带tcpA^(EL)基因。遗传学分析显示本次疫情菌株为不同于第七次世界大流行菌株的新出现的克隆群。结论通州区流行的O1群霍乱菌株以多重耐药小川型非产毒株为主,PFGE带型分散,本次疫情菌株是新出现的克隆群,以后的霍乱防控工作中应重视此类菌株并制定相应的策略。
- 张萍邹林高翔杨郝亮甄博珺李伟红郭晓晨林长缨李仁清严寒秋逄波
- 关键词：O1群霍乱弧菌毒力基因脉冲场凝胶电泳遗传学分析
- 北京市一起由宋内志贺菌引起的细菌性痢疾暴发病原学分析被引量：7
- 2022年
- 目的对北京市一起由宋内志贺菌引起的暴发疫情进行流行病学调查以及病原学分析,为此类疫情处理提供参考。方法2019年9月5—20日,采集病例及厨师粪便/肛拭子样本,以及水样、外环境等标本进行病原分离鉴定,并将分离到的病原菌进行药物敏感性试验、脉冲场凝胶电泳(PFGE)分子分型、全基因组测序,利用全基因组数据分析病原菌的耐药、毒力相关基因,并进行多位点序列分型(MLST),构建全基因组单核苷酸多态性(wgSNP)分型树状图。结果共分离到16株宋内志贺菌和1株肠产毒性大肠埃希菌(ETEC),志贺菌均对氨苄西林、四环素、复方新诺明、头孢唑啉、头孢噻肟、庆大霉素、萘啶酸、阿奇霉素、多西环素耐药,且均为产超广谱β-内酰胺酶(ESBLs)菌株。均为ST152型,是国内常见型别。其中1株宋内志贺菌全基因组中存在insA插入序列,而在其他志贺菌全基因组中未发现,与其同时分离到的ETEC全基因组中发现有该插入序列。结论本次疫情是由多耐药宋内志贺菌引起。在病原溯源研究中,全基因组数据分析是PFGE分型的必要补充。
- 吕冰田祎杨艳娜甄博珺贾蕾林长缨张新黄瑛曲梅
- 关键词：宋内志贺菌全基因组脉冲场凝胶电泳
- 2007-2009年北京市通州区食源性副溶血性弧菌的初步分析被引量：2
- 2011年
- 目的对北京市通州区2007-2009年从食品中分离到的副溶血性弧菌(vibrio parahaemolyticus,VP)进行研究并建立相关资料的数据库。方法对20株食源性VP进行神奈川试验,脲酶试验,血清分型和核糖体核酸(rDNA)指纹图谱分析,并进行同源性比较。结果 20株食源性VP的神奈川试验均为阳性,其中有2株脲酶试验为阳性,血清分型显示20株食源性VP分属于14个不同的血清型别,rDNA指纹图谱将20株食源性VP分为16个核糖体型。结论在通州区食品中检出的VP都具有致病性。在不同的年份,既存在着拥有同源关系VP的重复流行,也会有新的分子型别的VP菌株出现。本研究建立了通州区食源性VP的生化性状和分子图谱数据,为今后预防和控制由VP引起的食源性疾患的发生提供了科学依据。
- 张扬张兰荣周景林金岳佟玲甄博珺迟复平王宝兰
- 关键词：血清分型
- 2022年北京市一起产气荚膜梭菌引起的食源性疾病暴发事件病原学分析
- 2024年
- 目的 对一起北京市某学校由产气荚膜梭菌导致的腹泻暴发事件进行病原学分析,为类似疫情的快速精准分析与处置提供参考。方法 采用实时荧光聚合酶链式反应(PCR)方法对样本进行多重病原筛查;根据初筛结果进行常规细菌分离培养、生化鉴定和质谱分析;分离到的产气荚膜梭菌进行PCR毒力基因检测和脉冲场凝胶电泳分子分型。结果 28份病例肛拭子样本中有26份产气荚膜梭菌核酸初筛阳性,分离菌株26株;13份粪便样本有10份产气荚膜梭菌核酸初筛阳性,4份样本分离到20株产气荚膜梭菌;其他样本未检测到病原;46株菌均携带cpa基因和cpe基因,为携带肠毒素CPE基因的A型产气荚膜梭菌;46株菌中41株菌集中在2个脉冲场凝胶电泳带型。结论 本次腹泻暴发事件由产气荚膜梭菌(含肠毒素)导致,分子生物学方法可用于产气荚膜梭菌暴发事件的快速检测。
- 赵凤玲高翔邹林江南罗宇馨黄震甄博珺张萍李颖陈倩马晓晨马晓晨
- 关键词：产气荚膜梭菌毒力基因脉冲场凝胶电泳
- 北京地区腹泻就诊患者中肠致病性大肠埃希菌分离株特征分析被引量：12
- 2013年
- 目的分析北京市通州区腹泻就诊患者中肠致病性大肠埃希菌(EPEC)分离株的特征。方法 eaeA基因聚合酶链反应(PCR)扩增阳性的菌株,进行系统生化鉴定、EPEC诊断血清分型、bfpA基因PCR扩增以及脉冲场凝胶电泳(PFGE)分析。结果 20株成年人腹泻患者EPEC分离株中,仅1株鉴定为O126血清群;4株儿童腹泻患者分离株中,仅1株鉴定为O26血清群。儿童与成年人腹泻患者EPEC分离株bfpA基因均为阴性。23株EPEC菌株的PFGE带型呈高度多态性,聚类图显示与患者年龄及性别无明显相关。结论北京市通州区腹泻患者EPEC分离株以非典型为主,单纯通过血清群来诊断EPEC的方法,将会造成极大的漏诊。
- 高翔赵红庆甄博珺张兰荣张冲邹林李洪军赵爱兰王宝兰刘晓峰熊衍文
- 关键词：感染性腹泻致泻性大肠埃希菌肠致病性大肠埃希菌
- 通州区6类食品单增李斯特菌污染状况及分子流行病学特征调查研究被引量：14
- 2007年
- 目的:了解通州区6类食品中单增李斯特菌的污染情况,探讨所污染菌株携带的三个毒力基因(hlyA、iap、prfA)的状况和DNA随机扩增多态性PCR分型情况。方法:依据国标方法,采用全自动微生物分析仪和API Listeria试剂条鉴定系统对样本进行单增李斯特菌分离和生化鉴定;采用聚合酶链反应检测实验菌株携带毒力因子的情况,使用随机引物PCR的方法对菌株进行分子分型。结果:从通州区共采集6类食品样品121件,检出单增李斯特菌18株,检出率为14.9%;18株实验菌株均携带单核细胞增多性李斯特菌特异的毒力因子;随机引物PCR方法将实验菌株分成6个随机引物PCR型别。结论:本区食品中单增李斯特菌污染较为严重,且毒力基因prfA、hly、iap同时存在,说明有潜在的致病能力,应引起相关部门关注;通州区在不同时间、不同地点分离的单增李斯特菌其PCR型别差别较大,有多种型别的细菌存在;也可根据PCR分型看出在食品加工过程中存在着内部污染问题。但来源不同的菌株之间PCR分型无关联,无流行趋势。
- 张兰荣唐一清甄博珺张冲
- 关键词：食品污染单核细胞增生李斯特菌毒力因子
- 沙门菌主要血清型标准菌株的筛选鉴定被引量：2
- 2023年
- 目的依据《病原微生物菌(毒)种国家标准株评价技术标准》(WS/T 812—2022),获得8种沙门菌主要血清型标准株,并建立标准株筛选主要流程。方法分别对原代及传代沙门菌菌株进行形态学观察、生化试验及基因组测序分析,获得形态及生化典型、基因组稳定的标准菌株。结果从24株沙门菌中筛选获得8株分属8种血清型(伤寒沙门菌、甲型副伤寒沙门菌、乙型副伤寒沙门菌、丙型副伤寒沙门菌、鼠伤寒沙门菌、肠炎沙门菌、单相鼠伤寒沙门菌、猪霍乱沙门菌)的菌株,这8株菌在沙门菌推荐用选择性培养基上形态典型,生化反应典型,传代后基因组变异较小,血清凝集结果稳定,可以作为沙门菌检验的参比菌株。结论本研究通过筛选获得具有相应血清型病原特征的8种沙门菌主要血清型标准株,可作为沙门菌检测、血清分型质控、基因组进化分析的参比菌株,并为后续核酸标准品的研制提供基础。
- 高翔张龙飞侯心娇张萍甄博珺郭晓晨孙慧颖闫梅英
- 关键词：沙门菌血清型基因组标准菌株
- 酶联免疫吸附试验与实时荧光聚合酶链反应对A组轮状病毒的检测效果比较
- 2023年
- 目的比较酶联免疫吸附试验(enzyme linked immunosorbent assay,ELISA)与实时荧光聚合酶链反应(real-time fluorescent polymerase chain reaction,实时荧光PCR)对A组轮状病毒的检测效果,为后续试验提供参考。方法收集2015—2020年北京市某医院肠道门诊5岁以下腹泻儿童粪便样本,使用ELISA和实时荧光PCR两种方法检测A组轮状病毒,采用GP基因分型方法检测ELISA和实时荧光PCR检测阳性的样本。使用SPSS 20.0软件进行Kappa和Spearman统计分析。结果2015—2020年共采集1412份粪便样本,其中155份ELISA检测阳性,166份实时荧光PCR检测阳性。对实时荧光PCR和ELISA两种方法的检测结果进行Kappa检验,Kappa=0.954>0.75,说明这两种诊断方法检测一致性良好。ELISA法的吸光度A值呈偏态分布,实时荧光PCR法的Ct值类似正态分布,Spearman相关系数r=0.088,P=0.278,Ct值和吸光度A值无相关性。有13份标本两种方法检测结果不一致,仅有1份为ELSIA阳性、实时荧光PCR阴性,12份均为ELSIA阴性、实时荧光PCR阳性,其中,10份有GP分型结果,4份为G2[P4],4份为G9[P8],1份为混合感染G2/9[P4],1份为未分型。结论两种诊断方法定性诊断的一致性良好,但ELISA吸光度A值和实时荧光PCR Ct值无相关性,不能通过任何一种方法结果数值来推断另一种方法的结果数值。基因分型结果提示ELISA阴性、实时荧光PCR阳性的样本可能与G2[P4]型别的毒株与检测抗体的匹配度不是很高有关。
- 甄博珺田祎邹林高翔张萍张靖张扬郭晓晨高志勇
- 关键词：A组轮状病毒实时荧光PCR
- 实时荧光PCR检测弯曲菌感染病例的粪便和肛拭子样本
- 2024年
- 目的通过对3起弯曲菌暴发事件中粪便和肛拭子样本采用实时荧光PCR和培养法检测结果的比较,为实验室快速有效地应对此类事件奠定基础。方法收集3起弯曲菌感染暴发事件中病例的生物样本;使用过滤培养法进行弯曲菌培养检测,分别使用原始样本、增菌24 h和增菌48 h样本提取DNA进行弯曲菌实时荧光PCR检测;使用Kappa检验对实时荧光PCR检测结果和培养法结果进行一致性分析。结果原始样本、增菌24 h和增菌48 h实时荧光PCR检测灵敏度分别为90.91%、97.22%和100%,特异度分别为75.00%、84.00%和78.95%,与培养法结果一致性分析的Kappa值分别为0.643、0.813和0.785。结论实时荧光PCR检测与培养法结合使用是弯曲菌暴发事件处置的有效实验室检测方法。
- 邹林贾楠张萍甄博珺郭晓晨王芳冀国强闫爱霞康颖马红梅李颖
- 关键词：弯曲菌荧光定量聚合酶链式反应培养法腹泻病例
- 北京市2008-2017年细菌性痢疾病原学监测分析被引量：11
- 2019年
- 目的分析2008-2017年北京市细菌性痢疾(菌痢)病原学监测资料,为菌痢防治提供参考。方法分析2008-2017年北京市两个菌痢国家级监测点数据,以标本检出志贺菌为菌痢诊断的金标准,描述志贺菌的阳性率、菌痢的诊断符合率及耐药情况,率的比较采用χ2检验,应用非条件logistic回归分析志贺菌阳性的相关因素。结果 2008-2017年,北京市菌痢报告发病率和腹泻患者的志贺菌阳性率均明显下降,菌痢的临床诊断符合率为7.80%(111/1 423)。北京市菌痢的病原以宋内志贺菌为主,占73.95%(159/215),其他均为福氏志贺菌。采用非条件logistic回归分析志贺菌阳性的相关因素,便常规阳性(与阴性相比,OR=1.863,95%CI:1.402~2.475)、7-10月发病(与其他月份比较,OR=7.271,95%CI:4.514~11.709)、体温≥38 ℃(与体温<38 ℃比较,OR=4.516,95%CI:3.369~6.053)和6~59岁(与其他年龄比较,OR=1.617,95%CI:1.085~2.410)的志贺菌阳性率更高。氨苄西林(97.57%,201/206)和萘啶酸(94.90%,186/196)的耐药率最高,环丙沙星(16.33%,32/196)、氧氟沙星(9.57%,11/115)及阿莫西林(15.05%,31/206)耐药率较低;福氏志贺菌的耐药情况较宋内志贺菌更为严重;耐药≥3种抗菌素的比例为30.00%(21/70)。结论北京市菌痢临床诊断符合率低,耐药情况较严重,临床医生做出诊断时应综合考虑腹泻患者的流行病学史、临床表现以及实验室检测结果。
- 贾蕾吕冰田祎张新刘重程彭华李洪军甄博珺王小莉黄瑛曲梅王全意
- 关键词：细菌性痢疾诊断符合率耐药
