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基于谷歌地图的传染病空间聚集性分析被引量：5: 2014年; 目的探讨谷歌地图在传染病空间聚集性分析中的应用,探索以社区(行政村)为单位进行空间聚集性分析。方法利用谷歌地图的地理译码技术和计算几何算法以及文本解析方法,将宁波市镇海区2005-2010年结核病的报告数据和模拟数据,转换成以社区(行政村)为单位的发病统计数据,以此为基础利用SaTScan进行扫描统计分析,比较以街道为单位和以社区(行政村)为单位进行空间聚集性分析的结果。结果无论是以街道为单位还是以行政村为单位的聚集性分析,均发现镇海区蛟川街道2005-2010年具有明显的结核病空间聚集性现象,而以行政村为单位的聚集性分析更精确地给出主要聚集区位于中官路村、五里牌村和俞范社区等行政村。对镇海区招宝山街道模拟数据的分析表明,以社区为单位进行聚集性分析能够在早期发现街道内部小范围的空间聚集性,这与以街道为单位进行聚集性分析着重发现较大范围的空间聚集性形成互补。结论谷歌地图及其地理译码技术在传染病空间聚集性分析中具有广阔的应用前景,以社区(行政村)为单位进行空间聚集性分析具有可行性和现实意义。; 袁东方应莉娅刘志芳罗旭红董长征; 关键词：空间聚集性谷歌地图

基因水平的关联分析方法被引量：5: 2013年; 全基因组关联研究(Genome wide association study,GWAS)已经在国内外的医学遗传学研究中得到广泛应用,但是GWAS数据中所蕴含的与多基因复杂性状疾病机制相关的丰富信息尚未得到深度挖掘。近年来,研究者采用生物网络分析和生物通路分析等生物信息学和生物统计学手段分析GWAS数据,并探索潜在的疾病机制。生物网络分析和生物通路分析主要是以基因为单位进行的,因此必须在分析前将基因上全部或者部分单个单核苷酸多态性(Single nucleotide polymorphism,SNP)的遗传关联结果综合起来,即基因水平的关联分析。基因水平的关联分析需要考虑单个SNP的遗传关联、基因上SNP数量和SNP之间的连锁不平衡结构等多种因素,因此不仅在遗传学的概念上也在统计方法方面具有一定的复杂性和挑战性。文章对基因水平的关联分析的研究进展、原理和应用进行了综述。; 罗旭红刘志芳董长征; 关键词：全基因组关联研究网络分析

利用Monte-Carlo模拟评价基因水平的关联分析方法: 2015年; 采用Monte-Carlo模拟了多种参数条件下的遗传关联数据,计算多种基因水平的关联分析方法的统计效能.结果显示:主成分Logistic回归分析(累积贡献率为95%)和我们之前发展的基于LD结构和Fisher组合法的新方法(LD-Fisher)在多种参数条件下都具有很高的统计效能,Fisher组合法只有在单个易感SNP的P值较小时或者存在多个P值不太小的易感SNP时表现较好.主成分Logistic回归分析和LD-Fisher可以作为基因水平关联分析的较为理想的分析方法.; 桂娟娟罗旭红张添方华启航董长征; 关键词：MONTE-CARLO模拟

基因水平的疾病遗传关联分析方法研究: 目的：基于单核苷酸多态性（Single nucleotide polymorphism，SNP）的全基因组关联研究（Genome wide association study，GWAS）能够有效地挖掘多基因复杂性...; 罗旭红; 关键词：MONTE-CARLO模拟网络分析全基因组关联分析; 文献传递

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罗旭红