叶灵
- 作品数:36 被引量:119H指数:6
- 供职机构:丽水市疾病预防控制中心更多>>
- 发文基金:浙江省医药卫生科学研究基金丽水市科技计划项目浙江省公益性技术应用研究计划项目更多>>
- 相关领域:医药卫生农业科学更多>>
- 浙江省衢州市2017年输入性基孔肯雅病毒全基因组序列特征分析
- 2019年
- 目的对衢州市2017年1例曾有孟加拉国旅行史的发热患者血清标本进行基孔肯雅病毒(CHIKV)全基因组序列测定及遗传进化分析。方法无菌采集患者血液,分离血清后采用实时荧光定量PCR检测CHIKV和登革热病毒核酸,反转录PCR扩增CHIKV全基因组靶向基因片段并测序,采用生物信息学软件(Contig Express、SeqMan、Clustalx V2.0、BioEdit V7.0、GENEDOC和MEGA X)分析全基因序列。结果患者血清为CHIKV核酸阳性。测序数据拼接处理后获得CHIKV全基因组序列(QZ0823株),包含11 787 bp核苷酸,非结构蛋白主要结构位点未发现变异,结构蛋白缺乏E1中的适应性突变A226V和E2中可能影响CHIKV神经毒力的新取代K252Q突变,不存在增强埃及伊蚊的适应性突变E1:K211E和E2:V264A。全基因组序列进化分析显示,QZ0823与孟加拉国、印度、巴基斯坦流行株彼此紧密聚集,具有密切的进化相关性。结论衢州市输入性基孔肯雅病毒QZ0823全基因组和结构基因C-E3-E2-6K-E1核苷酸序列均符合CHIKV特征,与孟加拉国流行株同属东中南非洲遗传谱系(ECSA)。
- 王晓光杨瑞军黄世腾曹国平雷永良叶灵
- 关键词:基孔肯雅病毒全基因组进化分析
- 基于芯片式数字PCR技术的乙型肝炎病毒绝对定量检测方法的建立及应用被引量:8
- 2018年
- 目的建立芯片式数字PCR技术用于乙型肝炎病毒的绝对定量检测,并对此方法的灵敏度、检出限、检测范围开展评估。方法本研究设计了芯片式数字PCR用于乙型肝炎病毒绝对定量检测的引物探针,并对扩增条件、反应的体系进行了优化,采用阴性对照法和稀释法对检出限、检测范围和检测方法的重复性进行评估。同时与实时荧光定量PCR的结果作了平行比较。结果芯片式数字PCR检出限为3.94×10~4copies/ml,检测范围是3.94×10~4copies/ml^2.82×10~7copies/ml,重复性的相对标准偏差(RSD)为2.89%~13.37%。相比较实时荧光定量PCR,对样本的浓度要求苛刻,高稀释倍数与阴性对照均出现阳性。结论本研究建立了芯片式数字PCR技术用于乙型肝炎病毒的绝对定量方法,不必依赖对照品或标准品,可高度耐受PCR反应抑制剂,为乙型肝炎病毒载量的测定提供了一种新的检测手段。
- 梅建华雷永良陈秀英王晓光叶灵刘敏
- 关键词:乙型肝炎病毒
- 一株H3N2亚型流感病毒株的全基因序列测定及其分子特征分析
- 2020年
- 目的了解1株人流感H3N2毒株的全基因组序列特征、遗传进化及生物学特性。方法对浙江省丽水市分离的1株H3N2流感毒株进行全基因组测序,从美国国立生物信息中心(NCBI)和全球倡议分享流感数据库(GISAD)获取其他流感毒株基因组全序列,通过BioEdit7.0.9将该毒株8节段基因与其他序列比对,MEGA7.0软件邻接法构建进化树,并全面分析该毒株的进化、致病力和抗原性等特征。结果测序得到该毒株为人流感分离株A/Homo sapien/China/LS340/2019(H3N2)株(LS340),LS340为典型的季节性人流感病毒,血凝素基因属于3C.2a1进化分支,具备人际传播能力,部分位点呈现高传播性和高致病性特征,对金刚烷胺耐药。与当季推荐疫苗株相比,抗原区出现涉及A、B两个表位3个位点突变。结论LS340未出现重组、缺失等较大变异,但与当季推荐疫苗株相比已经发生抗原漂变,应及时更新疫苗,同时加强此类病毒变异监测,防止流感大流行发生。
- 叶灵王晓光陈秀英叶碧峰
- 关键词:流感病毒A型H3N2亚型分子特征遗传进化
- 丽水市严重急性呼吸道感染病毒多重检测的调查分析被引量:4
- 2017年
- 目的 了解本市严重急性呼吸道病毒病原谱的构成情况,以期能够为临床用药提供病原学数据。方法采用基于DPO技术的多重RT-PCR方法同时检测呼吸道感染13种病毒:人呼吸道合胞病毒(RSV),人鼻病毒(hRV),呼吸道腺病毒(AdV),人肠道病毒(hEV),人偏肺病毒(hMPV),人冠状病毒(hCoV 229E/OC43),人博卡病毒(hBoV),甲、乙型流行性感冒病毒(Inf A and Inf B),副流感病毒(PIV 1/2/3),凝胶电泳鉴定结果。结果累计761份严重急性呼吸道感染患者标本中,共检出病毒阳性标本214份,阳性率为28.12%。除PIV 2和hCoV 229E未检出外,其他11种病原均有被检出,检出率为32.19%,前三位分别是RSV 55份、hRV 45份、Inf B 36份。共有27份病原混合感染标本,其中23份双重感染,4份三重感染,混合感染前三位分别是hRV 18份、RSV 13份和PIV 37份。结论丽水市严重急性呼吸道病毒感染的主要病原体是RSV,除流感病毒外hRV、hMPV、PIV 3、hEV亦为主要单一致病原,hRV、RSV较高的混合感染率提示hRV或RSV的多重感染可能是呼吸道的基础感染。
- 王晓光雷永良叶碧峰叶灵刘敏
- 关键词:病毒呼吸道感染基因多重PCR
- 丽水市某高校学生艾滋病知晓率调查分析被引量:3
- 2016年
- 目的调查了解丽水市某高校学生对艾滋病相关知识、行为、态度的基本情况,总结各种现象并提出针对性方法。方法随机抽取500名大学生,采用调查问卷的方式调查其个人基本情况、艾滋病预防知识的了解程度、相关行为及对待艾滋病患者的态度。结果本次参与调查的大学生对艾滋病相关知识总体知晓率为71.55%,对传播途径的总体知晓率为74.6%,低于国家期望的"校内青少年艾滋病防治知识知晓率达到85%以上"的目标。调查学生中存在较高比例与感染相关的高危行为。结论高校应加强性道德教育,增加艾滋病预防知识讲座;加强案例宣传,如以身边的例子警示学生;设立专家咨询中心,报道最新治疗进展,减少学生对艾滋病的恐惧。
- 陈沙彬陈秀英雷永良叶灵陶桃刘敏
- 关键词:大学生艾滋病知晓率
- Foxp3 mRNA在抗病毒治疗的HIV/AIDS患者外周血单个核细胞中的表达及临床意义被引量:1
- 2019年
- 目的探讨在抗病毒治疗的HIV/AIDS患者外周血单个核细胞中叉头状转录因子P3(Foxp3) mRNA相对表达量和患者疾病进展的关系。方法采集丽水辖区内95例正接受高效抗病毒(HAART)治疗的HIV/AIDS患者及83例健康对照者的抗凝全血,流式细胞技术检测CD4细胞的数量,荧光定量PCR技术检测HIV核酸、Foxp3 mRNA表达量,对Foxp3 mRNA表达量高于检测下限的患者进行分析。结果在接受抗病毒治疗的95例患者中,患者病毒载量高于检测下限的仅5例。Foxp3 mRNA高于检测下限的有60例。在60例患者中,Foxp3 mRNA基因的表达水平与CD4细胞数量呈正相关。结论对于接受抗病毒治疗的人群,通过检测外周血Foxp3 mRNA的相对表达水平可以推测机体在疾病变化中的免疫状态,Foxp3 mRNA基因的表达水平可以作为预测疾病严重程度的参考指标之一,为患者预后评估及临床治疗开辟了新思路。
- 陈秀英陈沙彬雷永良梅建华丛迎叶灵
- 关键词:MRNA抗病毒治疗HIV/AIDS患者疾病进程
- 浙江省丽水市人感染H7N9禽流感病毒监测结果分析被引量:6
- 2014年
- 目的了解H7N9禽流感病毒在人、禽间的分布情况,指导人感染H7N9禽流感防制工作。方法对2013年4月至2014年2月浙江省丽水市医疗机构发热伴呼吸道症状病例及外环境标本采用实时荧光定量聚合酶链反应方法检测H7N9亚型禽流感病毒核酸,对监测结果进行分析。结果轻症流感样病例和严重呼吸道感染病例分别检测768份和605份,H7N9禽流感病毒全部阴性,不明原因肺炎病例检测92份,阳性1份,阳性率1.09%;家禽粪便标本、笼具表面涂抹物、鸡蛋外壳涂抹物及不明原因死亡家野禽咽拭子和肛拭子共检测1317份,H7N9禽流感病毒阳性22份,阳性率1.67%,阳性标本分布在4个县(区)的8个活禽交易市场。结论首次在丽水市检测到人感染H7N9禽流感病毒,并在多个县(区)的活禽交易市场外环境检测到H7N9禽流感病毒,提示H7N9禽流感病毒已在丽水市禽间传播,存在人感染H7N9禽流感病毒的风险。
- 雷永良叶夏良陈秀英叶碧峰叶灵王晓光刘敏梅建华丛迎陈沙彬
- 2013—2018年丽水市疟疾疫情分析
- 2020年
- 目的分析2013—2018年丽水市疟疾疫情及流行特征,为疟疾防控提供参考依据。方法通过中国疾病预防控制信息系统传染病报告信息管理系统和寄生虫病防治信息管理系统,收集、分析2013—2018年丽水市疟疾报告病例的流行病学资料。结果2013—2018年,丽水市共报告疟疾病例119例,其中恶性疟101例(84.87%)、间日疟6例(5.04%)、卵形疟8例(6.72%)、混合感染4例(3.36%)。1例为因输血感染的本地病例,118例为境外感染的输入性病例。输入性病例感染地以非洲国家为主,占98.32%。报告病例较多的地区为青田县和莲都区,分别占60.50%和22.69%;患者多为20~50岁青壮年(86.55%),职业主要为赴境外务工和经商人员,分别占52.94%和38.65%。结论丽水市疟疾疫情仍以非洲输入性病例为主,应加强赴境外务工等高风险人群监测以及疟疾防控知识健康教育等工作。
- 黄晓蒙叶灵於洋梅建华
- 关键词:疟疾疫情
- 2017—2019年丽水市流感监测和甲型流感病毒HA基因进化分析
- 2022年
- 目的对2017—2019年丽水市流行性感冒(简称流感)监测数据和甲型流感病毒HA基因进行分析,以了解丽水市流感的流行情况、病毒亚型构成和基因进化特征。方法收集2017—2019年丽水市流感监测哨点医院的流感样病例(influenza-like illness,ILI)数据以及流感病毒病原学检测结果,采用描述性流行病学方法进行分析。将实时荧光定量方法检测阳性的标本进行MDCK细胞分离鉴定,特异性扩增H1N1、H3N2流感病毒HA基因序列,利用生物学软件比对分析。结果丽水市2017—2019年度流感样病例就诊百分比为5.70%,不同年度之间ILI%差异有统计学意义,总体阳性率为17.08%。随年龄增加流感病毒阳性检出率呈逐渐降低趋势,不同性别之间阳性率无差异。新甲型H1N1、季节性H3N2、Yamagata、Victoria均有检出,不同年份、不同年龄组各型别分布差异均有统计学意义。ILI%和流感病毒阳性检出率呈正相关(r;=0.576,P<0.05)。获得19个新甲型H1N1和27个季节性H3N2长度为1701 bp的HA全基因序列,H1N1分离株均处于2009年流感大流行后时期单一的6B.1进化分支,有14处氨基酸变异;H3N2分离株共聚类在2015年起流行的进化支3C.2a,发生了支系分化:3C.2a1和3C.2a2,有18处氨基酸变异。结论2017—2019年丽水市流感流行趋势基本平稳,符合南方地区流行特征。进化分析显示H1N1、H3N2并未发生抗原漂移,相比同期2018—2019年度疫苗株匹配性不佳,但与2020—2021年度更新后疫苗株匹配性良好。
- 叶碧峰王晓光叶灵陈秀英梅建华
- 关键词:流行性感冒流行病学流感病毒HA基因
- 进口胶体硒法检测孕妇抗-HIV假阳性2例被引量:2
- 2016年
- 目的探讨进口胶体硒试剂检测HIV抗体假阳性的原因。方法对2例HIV抗体酶标法试验阴性但进口胶体硒试剂检测强阳性的样本进行确证试验,确证试验方法为蛋白印迹法和核酸检测法。结果 2例病例蛋白印迹法检测无特异性条带,核酸检测无特异性扩增,结合流行病学史判断均为阴性。结论长期以来人们对进口胶体硒试剂检测准确度认同性很高,本案例说明胶体硒试剂在特殊人群检测中可能存在较高比例的假阳性,应给予关注。
- 叶灵陈秀英陈沙彬梅建华
- 关键词:HIV抗体胶体硒法蛋白印迹假阳性