吴明明
- 作品数:43 被引量:105H指数:6
- 供职机构:中国农业科学院北京畜牧兽医研究所更多>>
- 发文基金:转基因生物新品种培育专项国家自然科学基金山东省现代农业产业技术体系创新团队建设专项资金更多>>
- 相关领域:农业科学生物学更多>>
- 转pGH基因猪阳性鉴定及外源基因在染色体上定位的研究
- 为探讨睾丸注射法制备转基因猪的高效性,本试验应用PCR检测、Southern印迹杂交、荧光定量PCR分析等技术,检测通过睾丸注射法制备的第一代转pGH基因猪阳性率。利用FISH杂交技术研究外源基因在染色体上的具体整合情况...
- 蒋亚军吴明明曹月胜刘剑飞孙静迟晓瑶孙金海
- 关键词:转基因猪PCR检测外源基因整合位点
- 红褐色乌苏里貉TYRP1基因的克隆及表达水平分析被引量:4
- 2014年
- 实验旨在探讨红褐色乌苏里貉和野生型乌苏里貉TYRP1基因的核酸序列以及表达水平差异。本实验克隆了红褐色和野生型乌苏里貉TYRP1基因CDS序列,并利用实时定量PCR技术对TYRP1基因在2种毛色貉中的mRNA表达水平进行了分析。结果表明:2种貉TYRP1基因CDS序列全长1 614 bp,包括完整的开放阅读框,共编码537个氨基酸;红褐色乌苏里貉TYRP1基因编码序列与狗、猪、绵羊、小鼠、人、牛、猫、马、虎鲸和黑猩猩核酸序列高度同源,同源性分别为99.07%、90.56%、89.64%、83.22%、88.90%、89.39%、90.87%、88.63%、90.25%和88.65%,与野生型乌苏里貉序列完全相同。利用SPSS软件进行独立样本t检验,结果表明TYRP1基因在2种貉皮肤组织中均可稳定表达,利用F=(1+E)-△△Ct计算可知TYRP1基因在红褐色乌苏里貉中的表达量是野生型乌苏里貉的0.93倍,但差异不显著(P>0.05)。该实验为TYRP1基因的功能分析及红褐色乌苏里貉毛色突变分子遗传机制的探讨提供了一定的理论基础。
- 朱艳菲胡义洁吴明明李祯孙金海张廷荣
- 关键词:克隆
- 睾丸注射转染外源DNA制备转基因猪的研究
- 目前实验室制备转基因动物的常用方法仍然是原核显微注射法。但该方法需要使用昂贵的显微注射仪,技术要求较高,外源基因整合率低,整合有较大的随机性。为研究睾丸内注射外源DNA法生产转基因猪的可行性,以雄性动物为对象,运用雄性配...
- 吴明明曹月胜蒋亚军刘剑飞孙金海
- 关键词:转基因阳性率
- 基于群体分化指数F_(ST)的绵羊全基因组选择信号检测被引量:17
- 2013年
- 本研究基于苏尼特羊(n=66)、德国肉用美利奴羊(n=159)和杜泊羊(n=93)3个群体的Illumina Ovine SNP50芯片分型数据,借助群体分化指数FST法进行群体间选择信号的检测分析,应用生物信息学方法分析寻找选择信号区域内的重要基因。结果,共找到343个"离群"位点,通过基因注释找到这些位点对应的365个候选基因。其中部分基因与绵羊生长、繁殖及肉质性状相关,如IGF2PB3、IGF1R、BMP2、BMPR1B、CAPN3等,本研究结果也进一步验证了前期利用CNV和GWAS研究检测到的基因结果。通过GO分析发现,这些基因主要富集在新陈代谢和去甲基化等条目。通过群体分化指数FST能有效地检测到具有选择信号的基因,其中包括绵羊部分重要经济性状的候选基因,研究结果能为绵羊的育种提供参考。
- 曾滔赵福平王光凯吴明明魏彩虹张莉李利张红平杜立新
- 关键词:候选基因
- 乌珠穆沁绵羊RIPK2基因多态性与生长性状的关联被引量:6
- 2016年
- 【目的】基于前期绵羊肉用性状GWAS研究结果,旨在探讨RIPK2基因对乌珠穆沁绵羊生长性状的影响,找到该基因中与绵羊生长性状相关的分子标记,同时对GWAS结果进行验证。【方法】在343只乌珠穆沁绵羊试验群体中,选取其中30个个体的血液DNA样本,以相同浓度组成池DNA,设计引物对RIPK2基因外显子及其上下游1 000bp的调控区进行PCR扩增,PCR产物检测为目的条带后测序。使用DNAMAN和Chromas2软件对测序峰图进行分析,采用飞行质谱方法对检测到的SNP位点及前期GWAS得到的SNP位点进行基因型分型。使用Haploview软件对多态位点构建单倍型及连锁不平衡分析。使用SPSS(22.0)软件进行RIPK2基因SNP位点与生长性状间的关联分析。【结果】共发现了4个多态位点,A5536G的同义突变rs01位于第四外显子内,在该位点检测到三种基因型,AA基因型频率为0.42,AG基因型频率为0.45,GG基因型频率为0.13,优势等位基因为A,其频率为0.65;在第七外显子上检测到T8952C错义突变rs02,在该突变位点检测到3种基因型,其中TT基因型频率为0.82,TC基因型频率为0.16,CC基因型频率为0.02,T为优势等位基因,基因频率为0.9;在第十外显子检测到T2836C的突变rs05,在该位点检测到两种基因型TT和CC,没有检测到杂合子基因型,TT基因型频率为0.25,CC基因型频率为0.75;上游调控区发现一个G5181C的突变rs30,有3种基因型,其中GC基因型频率为0.50,CC基因型频率为0.18,GG基因型频率为0.32,G为优势等位基因,其频率为0.58;GWAS得到的SNP位点是T4456C,在本研究中被命名为rs34,在该位点有3种基因型,其中TT基因型频率为0.49,TC基因型频率为0.37,CC基因型频率为0.14,优势等位基因T的频率为0.68。χ^2适合性检验发现,除rs34位点外,其余位点均处于Hardy-Weinberg平衡状态(P〉0.05)。rs02位点处于低度多态(PIC〈0.25),
- 马晓萌轩俊丽王慧华袁泽湖吴明明朱才业刘瑞凿魏彩虹赵福平杜立新张莉
- 关键词:生长性状多态性
- Lnc-SEMT促进绵羊肌肉分化生成的功能研究
- LncRNA是一类长度大于200个nt且不表现出蛋白质编码潜能的RNAs。参与了X染色体沉默,基因组印记以及染色质修饰,转录激活,转录干扰,核内运输等多种重要的调控过程,涉及到表观遗传调控、转录调控及转录后调控等多个层面...
- 吴明明
- 关键词:绵羊胎儿细胞分化骨骼肌IGF-2
- 文献传递
- 猪NCOA1基因PCR-RFLP多态性分析(摘要)(英文)
- 2010年
- [目的]研究猪NCOA1基因的PCR-RFLP多态性,为猪的分子育种和标记辅助选择提供理论依据。[方法]以81头山东寿光六和原种猪场的长白猪为研究对象,采取常规酚-氯仿抽提法从猪耳组织提取基因组DNA,以基因组DNA为模板进行PCR扩增获得440 bp的NCOA1基因目的片段,利用限制性内切酶RsaⅠ对PCR产物进行酶切和琼脂凝胶电泳检测,并计算各等位基因频率和基因型频率。[结果]琼脂糖电泳检测酶切产物出现3种基因型:AA型(1条带:440 bp)、AB型(3条带:440、282、158 bp)、BB型(2条带:282、158 bp);基因型频率分别为0.54、0.43和0.03;A和B 2个等位基因的基因频率分别为0.76和0.24。[结论]该研究猪群中,A为优势等位基因,AA基因型频率较高。
- 侯永刚闫守庆何晓波柏蒙蒙孙泰雷吴明明孙金海
- 关键词:NCOA1基因PCR-RFLP多态性
- 13/17罗伯逊易位猪CMYA3基因多态性分析(摘要)(英文)被引量:2
- 2010年
- [目的]对13/17罗伯逊易位杂合子猪[2n=36,rob(13;17)]互交后代中的148个体进行CMYA3基因的多态性分析。[方法]采用PCR-RFLP方法分析CMYA3基因在13/17罗伯逊易位猪群中的多态性。用酚-氯仿抽提法从猪耳组织中提取基因组DNA。以基因组DNA为模板进行PCR扩增,反应体系为25μl:dNTPs 2μl,上下游引物各0.5μl,Taq酶1 U,模板DNA1μl,用ddH2O补足至25μl。PCR反应条件为:94℃预变性5 min;94℃变性30 s,53℃退火45 s,72℃延伸30 s,共35个循环;72℃延伸10 min。PCR产物经PCR纯化试剂盒纯化,限制性内切酶Bsh1236 I 37℃酶切过夜后,1%琼脂糖凝胶电泳,检测酶切结果。[结果]通过PCR扩增所有个体均能获得507 bp的目的片段,PCR产物经限制性内切酶Bsh1236I酶切,琼脂糖凝胶电泳结果表明该基因在此群体中具有A和B 2个等位基因,基因频率分别为0.699和0.301,具有AA、AB和BB 3种基因型,基因型频率分别为0.615、0.169和0.216。因此,在该试验猪群中,A为优势等位基因,AA基因型频率最大。[结论]该研究为13/17罗伯逊易位猪的分子育种和标记辅助选择提供了理论依据。
- 孙泰雷闫守庆柏蒙蒙侯永刚吴明明李戈孙金海
- 关键词:罗伯逊易位PCR-RFLP
- 猪NCOA1基因PCR-RFLP多态性分析被引量:6
- 2010年
- [目的]研究猪NCOA1基因的PCR-RFLP多态性,为猪的分子育种和标记辅助选择提供理论依据。[方法]以81头山东寿光六和原种猪场的长白猪为研究对象,采取常规酚-氯仿抽提法从猪耳组织提取基因组DNA,以基因组DNA为模板进行PCR扩增获得440bp的NCOA1基因目的片段,利用限制性内切酶RsaⅠ对PCR产物进行酶切和琼脂凝胶电泳检测,并计算各等位基因频率和基因型频率。[结果]琼脂糖电泳检测酶切产物出现3种基因型:AA型(1条带:440bp)、AB型(3条带:440、282、158bp)、BB型(2条带:282、158bp);基因型频率分别为0.54、0.43和0.03;A和B2个等位基因的基因频率分别为0.76和0.24。[结论]该研究猪群中,A为优势等位基因,AA基因型频率较高。
- 侯永刚闫守庆何晓波柏蒙蒙孙泰雷吴明明孙金海
- 关键词:NCOA1基因PCR-RFLP多态性
- 一种制备转基因猪的方法
- 本发明公开了一种制备转基因猪的方法,其特征在于包括如下步骤:(a)将携带外源基因的载体与脂质体溶液制成混合溶液;(b)将混合溶液注射到成年猪的睾丸中,其中注射点位于睾丸中心线两侧1.4-1.6cm左右的位置,注射深度为1...
- 孙金海吴明明曹月胜孙金宁刘焕奇
- 文献传递