张勇
- 作品数：2 被引量：11H指数：2
- 供职机构：北京师范大学化学学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：理学更多>>
- 苏氨酸在昆虫抗冻蛋白抗冻活性中的作用被引量：2
- 2007年
- 设计系列昆虫抗冻蛋白CfAFP突变体,通过分子动力学模拟确定各突变体与冰晶的最佳作用模式,并用半经验分子轨道方法AM1和PM3研究了其与冰晶的相互作用.结果表明,TXT面上的苏氨酸在蛋白与冰晶相互识别和结合过程中十分关键,对CfAFP与冰晶间相互作用的贡献大,用其它疏水或亲水氨基酸残基替换都将削弱抗冻蛋白与冰晶的相互作用强度,从而降低蛋白的抗冻活性.但是,在维系蛋白和冰晶结构匹配的基础上,疏水基团的增加加强了抗冻蛋白与冰晶的结合,从而增加蛋白的抗冻活性.
- 周艳霞张勇谭宏伟贾宗超陈光巨
- 关键词：昆虫抗冻蛋白亲水作用疏水作用分子动力学模拟
- 非经典三铂核药物与DNA作用的理论研究被引量：9
- 2007年
- 利用分子力学、分子动力学和量子化学等计算方法研究了新型临床二期抗癌药物BBR3464([{trans-PtCl(NH3)2}2-μ-{trans-Pt(NH_(3))_(2)(NH_(2)(CH_(2))_(6)NH_(2))_(2)}]^(4+))与寡聚DNA片段复合物的几何构型及其电子结构.结果表明,利用分子力学和分子动力学确定的复合物结构与实验的基本吻合.BBR3464为+4价高电荷铂药,与两端的铂相连的两个Cl配体间的距离是2·74nm,这使得药物与DNA交联速度快,形成远程的1,4-链间交联.计算结果表明,BBR3464与DNA识别能力强,结合稳定.所形成的复合物中既有Pt-N7间较强的配位键,也存在许多氢键、弱氢键及静电作用.复合物中结合位点及结合位点外的嘌呤碱基的构象发生了不同程度的改变.复合物结构特征说明,DNA在键合药物后其构型并未发生定域的链弯曲,而是离域的嘌呤碱基的构象转化,其对DNA所造成离域性损伤与经典的药物不同.DNA是铂抗肿瘤药物的靶点,多点键合和离域性损伤的结构特征与BBR3464的独特生物活性和临床表现相关.
- 郝兰张勇谭宏伟陈光巨
- 关键词：DNA片段分子动力学方法量子化学方法
