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王任小: 作品数：65 被引量：91H指数：5; 供职机构：中国科学院上海有机化学研究所更多>>; 发文基金：国家自然科学基金国家高技术研究发展计划上海市科学技术委员会资助项目更多>>; 相关领域：医药卫生理学化学工程自动化与计算机技术更多>>

合作作者

苯基噻吩磺酰胺类化合物、药物组合物、其制备方法和应用: 本发明公开了一种苯基噻吩磺酰胺类化合物、药物组合物、其制备方法和应用，该类化合物能够在分子水平上有效地、选择性地抑制细胞凋亡过程中的关键蛋白Bcl‑2家族中的Bcl‑XL、Bcl‑2或Mcl‑1。同时，它们对癌细胞，尤其...; 王任小洪然田杰樊文杰李嫣周宓李晴孔文娜李杨峰李婕; 文献传递

有机化合物脂水分配系数和溶解度的计算方法被引量：13: 2010年; 有机化合物的脂水分配系数和溶解度在药物化学以及环境化学的研究中是十分重要的物理化学性质,在许多涉及有机化合物在生物体内的吸收、转运、代谢以及在环境中迁移等过程的定量构效关系研究(QSAR)中发挥着不可替代的作用.目前在实践中应用较多的计算有机化合物脂水分配系数和溶解度的理论方法主要有片段加合法和基于描述符的方法.本文总结了这两大类方法的优缺点以及在该领域中未来可能的发展方向.; 王艳玲李婕王任小; 关键词：溶解度 LOGS

应用化学基因组信息预测小分子化合物的潜在生物靶标的理论方法被引量：1: 2009年; 在后基因组时代,化学基因组技术在药物作用靶点的确认、小分子化合物对通路的作用,以及小分子先导化合物的识别等方面都有着广泛的应用,为新药研发提供了新的技术方法。本文主要介绍了当前几种基于化学基因组信息来预测小分子化合物潜在生物靶标的理论方法(包括化学相似性搜索方法、反向分子对接方法、数据挖掘方法以及生物活性谱图分析方法),并分析了这些方法的优缺点以及应用前景。; 李嫣王任小; 关键词：数据挖掘

应用机器学习方法构建药物分子解离速率常数的预测模型被引量：5: 2020年; 越来越多的研究表明:药物分子与靶标分子的结合动力学性质与其在体内的药效有很强的相关性。因此,以改善结合动力学性质为导向的分子设计为药物研发提供了新的思路。本工作的研究目标在于得出预测药物分子解离速率常数(koff)的通用型定量结构-动力学关系(QSKR)模型。我们从文献中收集了406个配体分子的解离速率常数实验值,采用分子模拟方法构建了所有配体与靶蛋白复合物的三维结构模型。然后基于蛋白-配体原子对描述符,采用随机森林算法来构建预测配体分子解离速率常数的QSKR模型。通过探索不同条件(如距离区间,划分区间宽度和特征选择标准)下产生的描述符集合对模型预测精度的影响,确定当采用距离阈值为15?、划分区间宽度为3?、特征选择方差水平为2时得到的QSKR模型为最优,在两个独立测试集上获得良好的预测精度(相关系数为0.62)。本工作对预测药物分子解离速率常数这一关键科学问题进行了有益的探索,可为后续研究提供思路。; 苏敏仪刘慧思林海霞王任小

完善评价蛋白-配体打分函数性能的CASF方法体系: 亲合性打分函数由于其具有计算消耗小,计算结果准确性尚可等优点而得到了广泛的应用。一个标准的评价体系可以帮助研究者客观了解打分函数的性能及其局限性,为打分函数的发展奠定一个扎实的基础。本课题组致力于发展一个高质量的打分函数...; 苏敏仪李嫣刘志海王任小; 关键词：打分函数性能评价

靶向PRMT5先导化合物的筛选及其抗肿瘤作用探讨: 2013年; 目的筛选可能作用于PRMT5蛋白的化合物并检测其抗肿瘤作用。方法以PRMT5蛋白为靶标,通过虚拟筛选技术挑选并购买得到101种化合物样品;以MTS法筛选所有化合物对人慢性粒细胞白血病K562细胞生长的抑制作用并计算IC50值;以化合物处理K562细胞48 h,收集细胞提取全蛋白,使用蛋白质印迹技术检测PRMT5下游甲基化蛋白H4RSDM的变化。结果以MTS法测试101种化合物,发现对K562细胞生长具有明显抑制作用的化合物共20个(其中8个化合物IC50<30μmol);蛋白质印迹技术进一步验证甲基化的H4RSDM蛋白表达水平并无明显变化,说明这些以PRMT5蛋白为靶标虚拟筛选获得的化合物并非通过抑制PRMT5甲基化来抑制K562细胞增殖的。结论所有测试的化合物中发现有8个对K562细胞的生长具有良好的抑制作用,但是其在分子水平上的作用机理还有待进一步研究。; 施晓柯李婕王任小潘景轩; 关键词：K562细胞系

苯基唑环取代酰胺类化合物及其制备方法和用途: 本发明公开了一类苯基唑环取代酰胺类化合物及其制备方法和用途，其结构通式如式(I)、(II)、(III)所示，尤其指苯基四唑乙酰胺(N-烷基)(硫)脲类、苯基四唑乙酰胺(N-烷基)酰胺类、苯基三唑甲酰胺N-烷基(硫)脲类化...; 王任小王慧马大为杨成文刘真巴乾李井泉张政希周宓李嫣; 文献传递

探讨评价打分函数中的统计问题: 亲合性打分函数（Scoring function）是一类计算蛋白-配体亲合性的方法。相关系数R则是评价打分函数的一个重要的指标。在评价打分函数时,用于计算相关系数的测试集只有一个,因而计算的相关系数是相倚的（correl...; 杨启帆王任小; 关键词：打分函数样本数测试集

On the Theory of Comparing Two Models with Correlation Coefficients: The quality of a computational model, e.g.a scoring function for computing protein-ligand binding affinity, is...; 杨启帆王任小

螺环吲哚酮类化合物、制备方法、药物组合物及用途: 本发明公开了螺环吲哚酮类化合物、制备方法、药物组合物及用途。本发明提供了一种如式I或II所示的螺环吲哚酮类化合物。本发明还提供了如式I或II所示的螺环吲哚酮类化合物的制备方法及其在制备抗肿瘤药物中的应用。本发明的化合物带...; 王任小吕龙冯骁周宓李杨峰李晴; 文献传递