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枳根生长cDNA文库的构建及生物信息学研究: 枳是我国柑橘产业最主要的砧木品种,具有耐寒、抗多种病害等优良特性。为了解枳根中基因的总体表达状况及发掘枳优良基因,本文构建了枳根的cDNA全长文库,并对得到的EST片段进行测序和生物信息学分析,得到如下研究结果:　　 ...; 王金萍; 关键词：CDNA文库砧木品种生物信息学基因表达; 文献传递

资阳香橙根cDNA全长文库的构建及EST分析: 以资阳香橙根RNA为材料，采用SMART技术构建了cDNA全长文库并对其质最进行了鉴定。结果显示，该文库的库容量为4.8×105 pfu·mL-1，重组率为93％，文库插入片段大小主要集中在0.5～1.0 kb。从文库中...; 王金萍姚利晓李凤龙何永睿陈善春; 关键词：表达序列标签 EST分析; 文献传递

枳根全长cDNA文库的构建及生物信息学研究: 枳是我国柑橘产业最主要的砧木品种,具有耐寒、抗多种病害等优良特性。为了解枳根中基因的总体表达状况及发掘枳优良基因,本文构建了枳根的cDNA全长文库,并对得到的EST片段进行测序和生物信息学分析,得到如下研究结果：1.以T...; 王金萍; 关键词：CDNA文库表达序列标签功能基因; 文献传递

一种快速微量提取柑橘早期胚基因组DNA的方法(英文): 2010年; [目的]建立一种快速微量提取柑橘基因组DNA的方法。[方法]采用优化的CTAB微量提取法,以20.0,10.0,5.0,2.5mg的早期杂种胚为材料进行基因组DNA的提取,并对其DNA进行质量检测和SSR验证。[结果]该方法简单易行,所需材料少,提取的DNA纯度较高,OD260nm/OD280nm在1.800～2.000,可满足SSR等以PCR扩增为基础的试验需要。[结论]建立的方法可以用于快速微量提取柑橘基因组DNA。; 范达雷天刚王军政宋二玲彭爱红谭洪泉王金萍李政利李凤龙陈勇陈善春; 关键词：CTAB法 PCR

枳根cDNA全长文库的构建与分析被引量：1: 2015年; 为了解柑橘优良砧木枳(Poncirus trifoliata)根部的基因表达信息,利用SMART技术构建了枳的根组织全长c DNA文库。检测结果显示所建枳根原始文库的容量为1.08×106 cfu·m L-1,扩增后文库容量为1.30×109 cfu·m L-1,重组率为95%。通过文库随机测序获得182个长度大于100 bp的ESTs序列(Gen Bank登录号为JK316116~JK316297),序列拼接后得到96个Unigenes,包括12个Contigs和84个singletons。其中,68个Unigenes可与Gen Bank中登录的基因相匹配,56个与已知的柑橘基因相匹配,36个为全长基因。对24个全长基因完成了功能注释,并进一步开展了生物信息学分析,发现有6个应激反应基因和3个根发育相关基因。; 姚利晓王金萍何永睿雷天刚许兰珍彭爱红邹修平陈善春; 关键词：DNA文库表达序列标签生物信息学分析

资阳香橙根cDNA全长文库的构建及EST分析: 2011年; 以资阳香橙根RNA为材料，采用趴压ART技术构建了cDNA全长文库，并对其质量进行鉴定。结果显示，该文库的库容量为4．8×10。pfu／mL，重组率为93％，文库插入片段大小主要集中在0．5～1．0kb。从文库中随机挑取450个克隆进行5’端单向测序，去除载体序列及低质量的序列后，共获得有效长度大于150bp的高质量ESTs（expressed sequence tags）序列438条，利用Bi-oEdit软件对有效ESTS序列进行片段重叠群分析和拼接后，获得251个独立基因（Unigenes），其中包括87个片段重叠群（Contigs）和164个独立的ESTs（Singlets）；通过与NCBI的非冗余核酸数据库进行tBLASTx比对，初步确定已知功能基因146个，未知功能基因91个．另有14个umgene未与数据库中序列匹配。该研兜为进一步分离克隆资阳香橙根部功能基因奠定了基础。; 王金萍宋二玲姚利晓李凤龙何永睿陈善春; 关键词：CDNA文库表达序列标签测序

一种快速微量提取柑橘早期胚基因组DNA的方法被引量：5: 2011年; [目的]建立一种快速微量提取柑橘基因组DNA的方法。[方法]采用优化的CTAB微量提取法,以20.0、10.0、5.0、2.5 mg早期杂种胚为材料进行基因组DNA的提取,并对其DNA进行质量检测和SSR验证。[结果]该方法简单易行,所需材料少,提取的DNA纯度较高,OD260nm/OD280nm在1.800～2.000,可满足SSR等以PCR扩增为基础的试验需要。[结论]建立的方法可以用于快速微量提取柑橘基因组DNA。; 范达雷天刚王军政宋二玲彭爱红谭洪泉王金萍李政利李凤龙陈勇陈善春; 关键词：CTAB法 PCR

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王金萍