董喜成
- 作品数：5 被引量：31H指数：3
- 供职机构：中国科学院上海有机化学研究所更多>>
- 发文基金：国家重点基础研究发展计划中国科学院知识创新工程更多>>
- 相关领域：化学工程医药卫生更多>>
- 几种改进的CoMFA方法比较研究血小板活化因子拮抗剂被引量：17
- 2003年
- 由于传统的比较分子场分析(CoMFA)方法本身存在一些缺陷,使得分子的叠合规则以及叠合分子的空间取向和空间位置等因素对q^2的影响很大,因此相继提出了几种改进的CoMFA方法.为了优化CoMFA结果,应用传统的CoMFA方法和交叉验证的R^2引导的区域选择法(q^2-GRS)、全取向搜索法(AOS)、全空间搜索法(APS)以及比较分子相似性指数(CoMSIA)等四种改进的CoMFA方法,对18个pinusolide类衍生物这类新发现的血小板活化因子(PAF)拮抗剂进行了比较研究.结果表明四种改进的CoMFA方法得到的q^2值均比传统CoMFA的高.q^2-GRS方法得到的q^2值有所提高,但综合结果并不理想,AOS与APS得到的q^2较为理想,而在CoMSIA中,q^2几乎不受空间取向或空间位置的影响.同时我们引入基于样本的偏最小二乘法(SAMPLS)取代原AOS/APS程序中的传统PLS进行统计分析,明显提高了其运行速度.最后,根据q^2最高的CoMFA模型和CoMSIA模型设计了几个预测活性更高的pinusolide类似物.
- 聂晶董喜成潘家祜
- 关键词：血小板活化因子拮抗剂药物设计
- q^2引导构象选择CoMFA方法研究HIV-1 RT抑制剂被引量：6
- 2003年
- 对未知受体结构的药物设计其主导方法CoMFA来说,柔性目标分子的多种构象造成了问题的复杂性.本文介绍交叉验证参数R^2(q^2)引导的构象选择CoMFA方法,选择化合物的最佳构象.将一组47个HIV-1 RT抑制剂进行有、无构象选择的CoMFA分析来作评价.根据化合物的活性、毒性、选择性指数(毒性/活性比)等实验数据构建得到的模型,其交叉验证参数q^2为0.7以上,非交叉验证的相应参数为0.94以上,最后,还经过试验集化合物验证该模型的预测能力,置信度(1-α)>0.99.
- 曾宝珊陈敏伯董喜成刘新泳
- 关键词：药物设计
- PAF拮抗剂的三维定量构效关系研究
- 2003年
- 聂晶董喜成潘家枯
- 关键词：PAF拮抗剂三维定量构效关系配体药物设计受体
- Sulfonylurea类ALS/AHAS抑制剂作用方式的分子对接研究和新抑制剂的虚拟筛选被引量：8
- 2006年
- 采用Dock5和Autodock3的组合,从乙酰乳酸合成酶(ALS)的晶体结构出发,对五个磺酰脲分子和三个类磺酰脲分子与ALS的相互作用方式进行了详细的分子对接研究,并结合对ALS与氯嘧磺隆(类磺酰脲)共结晶的复合物晶体结构的分析得出了一个简化的药效团模型,与前人利用其它手段得到的药效团模型一致.结合此药效团模型并根据sulfonylurea类分子与ALS的作用机理,我们对425个具有不同除草和杀虫作用的已知农药和ALS进行了分子对接研究和筛选,从中发现了一些可能对ALS有抑制作用的农药分子.此结果可以很好地解释这类农药的结构和活性的关系,对设计、开发新ALS抑制剂的先导化合物提供依据和指导.
- 张涛董喜成陈海峰陈敏伯
- 关键词：分子对接
- PAF拮抗剂的三维定量构效关系研究
- 目的:对血小板活化因子(plateletactivatingfactor,PAF)拮抗剂pinusolide及其衍生物进行比较分子场分析(ComparativeMolecularFieldAnalysis,CoMFA)研...
- 聂晶董喜成潘家枯
- 文献传递
