连璧
- 作品数:4 被引量:7H指数:2
- 供职机构:福建农林大学生命科学学院更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金福建省教育厅资助项目教育部科学技术研究重点项目更多>>
- 相关领域:生物学农业科学更多>>
- 稻瘟病菌NAD(H)激酶的生物信息学及表达分析被引量:2
- 2011年
- 对稻瘟病菌(Magnaporthe oryzae)全基因组中可能的NAD(H)激酶进行生物信息学和表达分析。结果表明,该菌含有3个可能的NAD(H)激酶,均具有保守的ATP-NAD激酶结构域;系统进化分析显示,NAD(H)激酶随着物种的进化而进化,但重要的功能结构域相对保守;MoPOS5在稻瘟病菌各生长发育阶段和致病过程中都有稳定转录,表明其在维持正常的生长发育及定殖扩展过程中扮演着十分重要的角色。
- 陈晓峰王琴秋连璧王爱荣鲁国东
- 关键词:稻瘟病菌生物信息学
- 基于基因组重测序的方法研究稻瘟病菌菌株间的变异特点
- 稻瘟病菌(Magnaporthe oryzae)是对水稻危害十分严重的一种病原真菌,对世界的粮食安全带来严重的威胁。稻瘟病菌全基因组测序已经完成,测序菌株为70-15,是法属圭亚那田间水稻上分离的菌株Guy11和画眉草上...
- 连璧
- 关键词:稻瘟病菌
- 文献传递
- 稻瘟病菌RhoGAP基因表达特征及其生物信息学分析被引量:4
- 2013年
- Rho GAPs(GTPase activating proteins)是真核生物中Rho GTP酶的负调控因子之一,通过激活Rho GTP结合蛋白内在的GTP酶活性,使其加速水解成结合GDP的失活态。全基因组分析指出稻瘟病菌有8个Rho GAP成员(MoRhoGAP),但是其功能不清。本研究利用在线工具分析了其蛋白MoRhoGAP蛋白结构域及其定点突变后的三级结构,以及MoRhoGAP的互作蛋白网络,构建了系统发育树;利用基因芯片和公共数据库分析了在稻瘟病菌不同发育和侵染阶段Rho GAP的基因表达情况,为进一步研究稻瘟病菌RhoGAP的功能提供了理论依据。
- 叶文雨胡芳辉连璧陈晓余文英鲁国东陈继圣王宗华
- 关键词:生物信息学基因表达稻瘟病菌
- 稻瘟病菌MoYpt5蛋白互作网络预测被引量:1
- 2014年
- 稻瘟病菌(Magnaporthe oryzae)共有11个假定的Rab蛋白家族成员,本文选取了MoYpt51(MGG_06241)和MoYpt52(MGG_01185)进行了生物信息学分析。通过搜索多个大型蛋白互作数据库和文献,共得到数百个与核心蛋白互作的蛋白和互作对。利用信息处理技术和高效制图平台将这些蛋白互作对构建成互作网络,得到若干个具有生物学意义的模块。结果表明,筛选得到的互作蛋白中,有的参与了蛋白降解的泛素途径(MGG_04053等)、囊泡介导的蛋白胞内运输(MGG_01238等),有的在蛋白、染色体的组装和修饰等过程(MGG_03677等)起重要作用。大部分假定互作蛋白定位于细胞质和质膜上,为其与目标蛋白互作提供了空间可能性。
- 党谢陈健连璧王宗华周洁
- 关键词:稻瘟病菌