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11 条 记 录,以下是 1-10
排序方式:
中国部分地区159株结核分枝杆菌临床分离株MLVA-19分型分析被引量:1
2009年
目的初步了解中国部分地区结核分枝杆菌临床分离菌株数目可变串联重复序列(variable number of tandem repeats,VNTRs)基因多态性特征。方法采用多位点VNTRs分析(multiple loci VNTRS analysis,MLVA)技术,随机选取159株中国部分地区结核分枝杆菌临床分离菌株,PCR和琼脂糖凝胶电泳技术,对结核分枝杆菌的19个VNTRs位点进行检测,用BioNumerics(Version 5.0)软件进行结果分析,数据结果与国际MLVA数据库(http://minisatellites.u-psud.fr)比对,初步分析结核分枝杆菌DNA多态性特征。结果159株菌株大致被分成4个主要的簇,其中73.8%的菌株为北京家族菌株,其次为H37Rv相似菌株及在数据库中没有比对结果的一簇,这一簇的MLVA特点是ETRD>3,MIRU10、MIRU27、MIRU39、MIRU40及Mtub21位点结果为22221,与其他簇的菌株结果有比较明显的区别。可能是中国特有的菌株。另外发现与BCG相似的一簇。结论本次研究中的中国结核分枝杆菌具有明显的VNTR基因多态性,主要流行菌株为北京家族菌株,可能存在中国特异的VNTR基因型。BCG临床分离株的发现,提示BCG疫苗相关病例可能成为值得关注的卫生问题。
吕冰刘梅李兆娜刘志广赵秀芹万康林
关键词:结核分枝杆菌卡介苗
OXA-50基因在铜绿假单胞菌中分布的初步研究
目的研究铜绿假单胞菌(pseudomonas aeruginosa,PA)对碳青霉烯类抗生素耐药的分子机制。方法收集非重复34株铜绿假单胞菌临床株,PCR 扩增 bla基因、测序、在 Genbank 上比对、提取质粒 D...
刘梅杜宝中曾蔚程曦陶传敏康梅贾文祥
关键词:铜绿假单胞菌碳青霉烯类抗生素
文献传递
不同串联重复序列位点组合用于中国结核分枝杆菌基因分型的能力比较分析被引量:11
2009年
目的初步评价不同串联重复序列(VNTR)位点在中国8省市结核分枝杆菌基因分型中的应用,寻找适合中国地区结核分枝杆菌基因分型的位点组合。方法从中国8个省(市、自治区)2800余株结核分枝杆菌临床分离菌株中以简单数字表法随机抽取140株,采用多位点数目可变串联重复序列分析方法(MLVA)对27个数目可变VNTR位点进行基因多态性检测,采用BioNumerics数据库软件进行单位点和不同位点组合的分辨率(Hunter-Gaston指数,HGI)分析,并比较分析其对140株菌的基因分型鉴定能力。同时采用间隔区寡核苷酸分型(Spoligotyping)将140株菌分为北京家族和非北京家族,评价上述不同VNTR位点组合在北京家族和非北京家族中的分型能力。结果140株菌主要可分为2个基因群,即北京家族112株,占80%;非北京家族28株,占20%。Spoligotyping分型对140株结核分枝杆菌的HGI为0.4589。MLVA分析结果显示不同位点在不同菌株群存在明显的多态性,不同位点的HGI具有较大差异(0~0.809),对全部菌株、北京家族菌株、非北京家族菌株的HGI达到0.5以上的VNTR位点数分别为8、7和14个。27个VNTR位点进行不同的位点组合:优化筛选的8位点组合、国际推荐的12个、15个和24个位点组合。4个组合的HGI分别为0.9991、0.9882、0.9980和0.9986;在北京家族菌株中,上述组合的HGI依次为0.9987、0.9318、0.9969和0.9975;在非北京家族菌株中分别为1、0.9894、1和1。结论不同的VNTR位点和不同VNTR位点组合在中国8省市结核分枝杆菌中的HGI均存在明显差异;本研究优化的8个位点组合MLVA分型方法在中国结核分枝杆菌流行病学研究可能具有良好的应用前景。
李兆娜刘梅吕冰赵秀芹刘志广焦伟伟孙琳贾文祥申阿东万康林
关键词:核酸细菌分型技术
45个可变数目串联重复序列位点用于中国结核分枝杆菌基因型鉴定的分辨力评价被引量:11
2009年
目的评价结核分枝杆菌基因组中串联重复序列(VNTR)位点在中国结核分枝杆菌临床分离株的分型鉴定的分辨力。方法参考http://minisatellites.u-psud.fr/网站记载的位点选取其中VNTR位点,参照H37Rv结核分枝杆菌标准株全基因序列,利用DNAStar软件设计引物,采用PCR分别对中国结核分枝杆菌临床来分离株和H37Rv标准株的VNTR位点进行检测,根据PCR凝胶电泳图片中各菌株相应位点扩增产物的大小,确定重复单元的重复次数。计算Hunter-Gaston指数来分析各位点的分辨能力,及各位点合并分辨力。结果共检测135株中国结核分枝杆菌临床分离株和H37Rv标准株的45个VNTR位点。结果显示45个VNTR位点对136株菌的分辨力各不相同,Hunter-Gaston指数最大者为0.814(0.797-0.830),最小者为O.015(0.001-0.028),〉0.5的有13个位点。位点的合并分辨力分析显示,随着位点数量增加,分辨力增强,如Qubll-b和Qub18两个位点合并分析,Hunter-Gaston指数为0.936,分组数为44组;Qub11-b、Qub18、Mtub21、Rv2372、MIRU26、Qub26、Qub4156c、Qub11-a和Qub15等9个位点合并分析,Hunter-Gaston指数已经达到1,组数为136组,表示已达到最大分辨力,即株水平分型。结论不同VNTR位点具有不同的分辨力。其分型分辨力,多位点联合明显好于单位点。Qub11-b等9个位点的合并分型能力较好,这些位点有利于结核分枝杆菌的分型研究。
吕冰李兆娜刘梅刘志广赵秀芹万康林
关键词:结核分枝杆菌可变数目串联重复序列
溶原性噬菌体对铜绿假单胞菌生物被膜形成的影响被引量:4
2008年
目的研究铜绿假单胞菌(PA3094)溶原性噬菌体Ppa3094对该菌生物被膜形成的影响。方法采用平板培养法建立PA3094及PA3094-L(带前噬菌体Ppa3094的溶原性菌株)两株菌的体外生物被膜模型;MTT法测定生物被膜形成过程中两株菌的生物被膜活菌量;实时荧光定量PCR测定两株菌在培养不同时间点藻酸盐合成基因algC、algD的表达量。结果两株菌均在培养5~7 d时形成成熟的生物被膜,呈薄膜状。在生物被膜形成过程中,两株菌的生物被膜菌量存在明显差异,在整个生物被膜形成过程中,PA3094生物被膜菌量均比PA3094-L高;PA3094-L在培养第5 d时生物被膜菌量达最高,第7 d有所下降。随着培养时间的延长,藻酸盐合成基因algD、algC表达量均上调,但PA3094-L表达量均比PA3094低,且algC表达量差异更大。结论铜绿假单胞菌溶原性噬菌体Ppa3094可降低藻酸盐合成基因algD、algC的表达,从而影响生物被膜的形成。
杜宝中曾蔚陶传敏康梅刘梅张再蓉贾文祥
关键词:铜绿假单胞菌生物被膜藻酸盐基因表达
OXA-50型碳青霉烯酶基因在铜绿假单胞菌中分布的初步研究被引量:2
2008年
目的研究铜绿假单胞菌(Pseudomonas aeruginosa,PA)对碳青霉烯类抗生素耐药的分子机制。方法收集非重复34株铜绿假单胞菌临床株,PCR扩增blaOXA-50基因、测序、在GenBank上比对、提取质粒DNA、对该基因进行PCR扩增。结果PCR检测出34株铜绿假单胞菌中有15株含OXA-50型基因,其中30株耐亚胺培南的铜绿假单胞菌中有12株阳性,4株敏感菌中亦有3株阳性;随机选取1株阳性菌PCR产物送测序,测序结果在GenBank上进行blast比对,显示有两个突变点;blaOXA-50基因扩增阳性的15株铜绿假单胞菌,提取质粒DNA扩增该基因,结果为阴性。结论本次实验检测了34株铜绿假单胞菌临床株,OXA-50型基因的检出率为44.10%,其中1株发现有两个位点突变;检测到的blaOXA-50编码基因位于染色体上。
刘梅杜宝中曾蔚程曦陶传敏康梅贾文祥
关键词:铜绿假单胞菌碳青霉烯类抗生素
一种用于霉酚酸检测的荧光碳点在霉酚酸检测方面的应用
本发明公开了一种用于霉酚酸检测的荧光碳点在霉酚酸检测方面的应用,本发明涉及药物含量检测技术领域。该碳点制备方法包括以下步骤:将β‑环糊精和L‑苯丙氨酸加入去离子水中,超声混合均匀,水热反应,得反应溶液;冷却至室温,然后依...
付春梅刘梅
OXA-50基因在铜绿假单胞菌中分布的初步研究
铜绿假单胞菌(PA)属革兰阴性杆菌,可引起菌血症、肺炎、泌尿系感染、烧伤感染和囊性纤维化继发感染等疾病,尤其易感染免疫力低下的患者。由于其耐药株不断产生耐药性不断变化,已成为医院内获得性感染最严重的条件致病菌之一。目前为...
刘梅杜宝中曾蔚程曦陶传敏康梅贾文祥
关键词:铜绿假单胞菌致病菌分布碳青霉烯类抗生素
文献传递
论人文资源与水库移民的适应障碍 ——屏山县城整体搬迁案例研究
在宜宾向家坝水库移民工程中,宜宾市屏山县将被淹没九镇一城,其中屏山县城所处的屏山镇将被整体淹没。此次移民搬迁虽然距离较短,但由于是从金沙江流域搬迁到岷江流域,形成了一定的流域文化差异,对屏山县移民造成了潜在的适应问题。本...
刘梅
关键词:水库移民人文资源
文献传递
铜绿假单胞菌中OXA-50基因的初步研究
目的目前国内应用的碳青霉烯类抗生素以亚胺培南、美罗培南为主。然而,随着碳青霉烯类的广泛应用,细菌对其敏感性逐年下降,耐碳青霉烯类抗生素铜绿假单胞菌也在不断增多。本文研究铜绿假单胞菌(pseudomonas aerugin...
刘梅杜宝中曾蔚程曦陶传敏康梅贾文祥
文献传递
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