刘海燕
- 作品数：43 被引量：88H指数：6
- 供职机构：中国科学技术大学更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金中国科学院知识创新工程重要方向项目中国科学技术大学青年基金更多>>
- 相关领域：生物学自动化与计算机技术医药卫生理学更多>>
- 用于蛋白质设计的Rotamer库和能量函数分析
- ＜正＞我们能否设计、创造自然界尚不存在的蛋白质分子是检验人们对蛋白质结构和其折叠规律是否正确、完整的重要手段。自1997年Mayo成功的设计了第一条序列以来, 这个方向得到了越来越多的重视。2003年Baker工作组对α...
- 丁博周长海刘海燕
- 文献传递
- 基于芯片合成寡核苷酸为基础的高通量DNA合成与应用
- 宛雯王冬梅刘海燕高晓连洪泂
- 诱导的T7 RNA聚合酶
- 本发明涉及一种诱导的T7 RNA聚合酶，尤其是光或小分子化合物诱导调控的T7 RNA聚合酶；具体是选择T7 RNA聚合酶中特定的氨基酸序列位置作为拆分位点拆分，并将拆分后的片段与光敏感或小分子化合物敏感的结构域、蛋白或肽...
- 刘海燕陈泉韩悌云
- 文献传递
- GB1蛋白去折叠相变的分子动力学模拟
- ＜正＞ 蛋白质折叠或去折叠问题是当代分子生物学和生物物理学面临的挑战之一。蛋白质热力学特性和蛋白质的折叠机制密切相关。Pivalove等人用微卡路里方法对蛋白质折叠和去折叠过程的热力学性质进行了大量研究,结果表明蛋白质折...
- 王吉华张志勇刘海燕施蕴渝
- 文献传递
- 分子动力学模拟程序库GROMOS与半经验量化方法AM1的结合
- 1993年
- 分子动力学模拟已成为研究生物大分子力学、功能的重要手段之一。但经典的分子力学势不适用于研究化学反应,而一般的量化方法也无法处理含有上千个原子的生物大分于体系中或溶液中的化学反应.最近,Karplus 等人提出把半经验量子化学方法AM1 与分子力学势结合。
- 刘海燕施蕴渝
- 关键词：分子动力学GROMOS生物大分子AMI
- 蛋白质结构与动力学的计算机模拟：从方法到应用被引量：1
- 2008年
- 计算机模拟已发展为根据生物分子结构和动力学阐释生物功能的重要工具.同现有实验比较,计算机模拟不仅能提供结构的时空平均,而且可获得任意微观量的时空分布和演化轨迹.除结构之外,生物功能往往依赖于对动力学的控制.计算机模拟可用于重构构象跃迁路径,发现中间体和过渡态等.本文总结了作者实验室在这一领域的近期工作,特别是关于能量模型、酶催化模拟、构象空间采样等.
- 刘海燕
- 关键词：计算机模拟分子动力学蛋白质
- 蛋白质设计统计能量模型:从设计序列到设计结构
- 蛋白质设计即根据预先设定的结构和/或功能目标去设计氨基酸序列，是根据序列去预测结构和功能的逆问题.如何保证人工设计的蛋白质能够象天然蛋白那样自发折叠形成稳定三维空间结构，是最基本的蛋白质设计问题.我们可以把该问题分解为两...
- 刘海燕熊鹏初环宇
- 关键词：蛋白质
- 生物分子和调控网络的模拟与设计:现状与实例
- 目前，以全新结构功能为目标的生物序列从头设计方法还没有成熟，但基于相关研究所积累的方法和总结的规律已经可用于大幅度缩小生物分子设计改造中序列的可能变化范围，与定向进化结合，可以实质改变我们创建新功能生物分子的能力。数学模...
- 刘海燕
- 基于T7 RNA聚合酶构建光诱导的基因开关
- 本研究基于T7RNA聚合酶(T7RNAP)构建了一种可直接受外界信号控制的基因开关。构建这种基因开关采用的策略是:将T7RNAP在指定氨基酸位置拆分成两个片段,然后与可诱导结构域融合,促使T7RNAP拆分体系的重组装和活...
- 韩悌云陈泉刘海燕
- 关键词：基因开关
- 重要细胞活动和生物分子识别的结构生物学基础
- 施蕴渝牛立文滕脉坤吴缅姚雪彪周丛照吴季辉刘海燕
- 分子水平的细胞生物学研究是生命科学的前沿。细胞是生命活动的最基本单元。三年来我们围绕细胞增殖，分化，凋亡；细胞黏附，细胞极性形成；胞吞，胞吐；以及真核基因表达调控等重要细胞活动过程开展研究。我们用生物化学，分子生物学，细...
- 关键词：
- 关键词：细胞活动结构生物学
