李兵 作品数:24 被引量:46 H指数:5 供职机构: 中国医学科学院北京协和医学院药用植物研究所 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 “重大新药创制”科技重大专项 更多>> 相关领域: 医药卫生 农业科学 文化科学 生物学 更多>>
猪苓糖苷水解酶家族基因及其差异表达 2023年 猪苓与蜜环菌建立共生关系时,猪苓菌丝会反侵染并消解蜜环菌菌索,以获取营养物质,糖苷水解酶是参与这一过程的主要酶类之一。本研究从猪苓转录数据库中获得糖苷水解酶家族基因42类、309个;其编码的糖苷水解酶蛋白含各类结构域344个,以糖苷水解酶结构域glyco_hydro为主,共计35类173个。对猪苓糖苷水解酶进行的gene ontology(GO)功能注释结果表明,这些蛋白参与的生物学过程以物质代谢及分解过程为主,特别是多糖等大分子物质代谢;181个猪苓糖苷水解酶具有水解酶活性,这些水解酶活性呈多样性分布。与未被蜜环菌侵染的猪苓部位相比,43个糖苷水解酶基因在蜜环菌侵染的菌核部位中差异表达,编码包括glyco_hydro_48、cellulase和polysacc_deac_1等功能结构域,可能发挥水解几丁质、纤维素酶活性及免疫调节等活性,这为猪苓与蜜环菌互作关系的研究提供了候选基因及蛋白。 李兵 刘柳 郭顺星关键词:猪苓 促生小菇属菌株M23对黑果腺肋花楸光合作用的影响 被引量:1 2021年 以黑果腺肋花楸为试验材料,设置5个处理组,分别为阴性对照(CK)、阳性对照(PCK)、大田条件下根施低剂量T1(每株50 g)、中剂量T2(每株100 g)和高剂量T3(每株200 g)3个水平的小菇属菌株M23,分析各处理组黑果腺肋花楸的农艺性状、叶绿素含量和生理指标,并利用Li-6400便携式光合仪测定光合特性日变化。结果表明:黑果腺肋花楸净光合速率(Pn)呈双峰曲线,在13:00时叶片的气孔导度(gs)和蒸腾速率(Tr)均明显下降,而胞间CO2浓度(Ci)却显著升高,出现由非气孔限制因素引起的光合"午休"现象。加菌处理可成功避免光合"午休"现象,与13:00时对照组黑果腺肋花楸的平均值相比,加菌组的平均Pn、gs、Tr、水分利用率(WUE)和光能利用率(LUE)提高了113%、91%、50%、48%和117%,且日均Pn、gs、Tr和LUE显著高于对照组,分别约是对照组平均值的1.5、1.9、1.4和1.5倍。在加菌处理组中,高剂量的作用效果显著优于中、低剂量,株高是中、低剂量组的1.2倍。高剂量组黑果腺肋花楸的所有生长指标、光合参数和抗性指标均优于其他组。表明菌株M23可以通过提高黑果腺肋花楸的光合特性、增强对外界环境的适应能力等促进植株生长,且以每株200 g作用效果最佳。 单婷婷 周丽思 李兵 陈晓梅 郭顺星 李菲 卢玮关键词:黑果腺肋花楸 小菇属 光合参数 蜜环菌菌索分化的差异蛋白质组学研究 被引量:3 2021年 菌索是蜜环菌与宿主互作的组织结构,蜜环菌菌丝形成菌索的分子机制尚不清楚。本研究采用SWATH-MSALL非标记定量蛋白质组学技术,首次对Armillaria mellea菌丝形成菌索过程的蛋白质组学进行了系统研究。在蜜环菌菌丝和菌索中共鉴定蛋白1 724个(global FDR 1%),定量蛋白1 179个。与菌丝相比,蜜环菌菌索差异表达蛋白640个(上调表达256个,下调表达384个)。差异表达蛋白GO注释结果表明,蜜环菌菌索分化的生物学过程较复杂,差异蛋白参与的主要生物学过程包括有机含氮化合物代谢、有机物生物合成、小分子代谢、氧化还原反应等。分子功能富集结果提示,电子转运活性的富集因子最高,而氧化还原反应的富集P值最显著,这与KEGG注释的氧化磷酸化代谢活跃的结果一致。进一步的推测分析表明,蜜环菌菌丝形成菌索可能是受到氧化应激所致,菌索的形成可能促使诸如硫氧还蛋白样等毒力蛋白和富马酸的合成和释放增多,抑制宿主免疫而有利于蜜环菌侵染和定植于宿主。因此,对差异蛋白质组的进一步研究和深入解析不仅有利于揭示蜜环菌菌索形成的蛋白分子机制,同时也具有较强的理论和现实意义。 李兵 刘柳 郭顺星关键词:蜜环菌 蛋白质组学 富马酸 蜜环菌糖苷水解酶家族基因在菌索与菌丝间的差异表达分析 被引量:5 2021年 蜜环菌是一种兼性腐生和寄生的真菌,通过降解伴栽基质并为药用植物(天麻)或菌物(猪苓)提供营养物质,而糖苷水解酶是这一过程的主要酶类。本研究从蜜环菌Armillaria mellea 541菌株转录数据库中共获得糖苷水解酶家族基因170个,分布于39个亚家族。进一步分析发现,这些家族基因编码的糖苷水解酶家族蛋白(glycoside hydrolase family,GHF)结构域多达48种181个,以Aamy、Glycohydro、MelibiaseC、Nod B homology和PA14等结构域为主。对糖苷水解酶家族蛋白进行了系统的Gene Ontology(GO)功能注释和Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes(KEGG)代谢通路分析,其功能以结合、水解和催化细胞壁成分为主。编码GHF3(A0A2H3D3T6)、GHF78(A0A2H3D8T6)、GHF51(A0A2H3E4X4)、GHF47(A0A2H3EK71)和GHF5(A0A2H3EBW7)等5个糖苷水解酶家族蛋白的基因在A. mellea541菌索与菌丝间差异表达,其结构域依次为PA14、Bacrhamnosid6H/C、Alpha-L-AFC、Glycohydro47和Glycohydro5,可能发挥结合碳水化合物和催化鼠李糖苷、阿拉伯呋喃糖苷、甘露糖残基和纤维素等水解的功能,这为研究蜜环菌与天麻或猪苓的相互作用提供了理论依据。 李兵 刘柳 单婷婷 郭顺星关键词:蜜环菌 临床药师参与藤黄微球菌致骨组织感染2例的诊疗过程并文献复习 2024年 藤黄微球菌又称八叠球菌,属于细菌微球菌科微球菌属,是一种革兰阳性球菌,该菌主要分布于泥土、水等外界环境及正常人和动物的皮肤表面,一般不致病,但当人体抵抗力下降或患严重疾病时,可转为条件致病菌,可引起心内膜炎、败血症、颅内感染、隧道感染、肾盂肾炎等[1-5],但其致骨组织感染的案例较少见。本研究报告临床药师参与2例藤黄微球菌致骨组织感染诊疗过程,并复习相关文献资料,以期为此类病例的诊治提供参考。 田晓芳 张晓红 史宗新 李兵关键词:临床药师 藤黄微球菌 头孢菌素 螺光黑壳菌酮A腹腔注射对昆明小鼠半数致死量的测定 被引量:1 2013年 目的用寇氏法测定螺光黑壳菌酮A腹腔注射对昆明小鼠的半数致死量(median lethal dose,LD50)。方法实验动物为啮齿昆明小鼠,雌雄各半,体重(20±2)g。用序贯法摸索出受试物的全死剂量,而后设置5个剂量组,剂量比值r=1.25(或0.80)。一次性腹腔注射黑壳菌酮A后,连续观察10 d,统计各组死亡情况并计算半数致死剂量。结果各组小鼠均出现不同程度的腹腔刺激反应,雌性比雄性反应更强烈且呈剂量依赖性,30 min后刺激基本消失;受试物腹腔注射LD50为5.35 mg/kg,其95%可信区间为4.69~6.11 mg/kg。结论螺光黑壳菌酮A的LD50为5.35 mg/kg,死亡率呈剂量依赖性。 李兵 陈晓光 陈晓梅 郭顺星 王春兰关键词:急性毒性 半数致死量 蛹虫草原基分化的差异蛋白质组学研究 被引量:3 2021年 蛹虫草子实体形成及发育的蛋白分子机制尚不清楚,本研究引入SWATH非标记定量蛋白质组学技术,对蛹虫草Cordyceps militaris 905菌株的菌丝体(mycelium,My)、原基(primordium,Po)、生长期子实体(developmental fruiting body,DF)和成熟期子实体(mature fruiting body,MF)进行了比较蛋白质组学分析。经搜库比对,从蛹虫草的My、Po、DF和MF中依次鉴定蛋白1136个、1090个、1018个和997个(global FDR 1%),经维恩分析后获得C.militaris 905蛹虫草表达蛋白1578个。在此基础上,SWATH非标记技术定量蛋白1109个。本研究获得了蛹虫草Po期与My期、DF期与Po期、MF期与DF期的差异表达蛋白,依次为115个、352个和104个,并对菌丝体分化形成原基的差异表达蛋白进行了重点解析。GO注释结果表明,Po期与My期差异表达蛋白以有机含氮类化合物代谢为主,其中AMP(活性成分虫草素合成的中间产物)从头生物合成途径富集最为显著。约1/5的差异表达蛋白参与氧化还原反应,还原酶活性的蛋白在原基中几乎都上调表达,而氧化功能的蛋白受到抑制,表明蛹虫草原基分化可能受到氧化应激的诱导。蛋白互作网络分析结果进一步表明,氧化还原反应与核苷类物质代谢相关联,可能通过影响AMP从头生物合成途径来调控虫草素的生物合成。对蛹虫草子实体系统的蛋白质组学研究和解析有利于揭示子实体形成的蛋白分子机制,为蛹虫草的基础和栽培研究提供了理论支撑。 刘柳 李兵 郭顺星 王弘 王志刚关键词:蛹虫草 原基 一种抑制人类免疫缺陷病毒的真菌提取物的制备方法 一种抑制人类免疫缺陷病毒(HIV-1)的真菌提取物的制备方法,所依赖的菌株是炭团菌属真菌Q-s-4(Hypoxylon sp.)。真菌Q-s-4经液体发酵培养,制备发酵产物的提取物。该方法可用于真菌Q-s-4的大规模工业... 郭顺星 梁寒峭 陈晓梅 张大为 王春兰 邢咏梅 李春艳 李兵文献传递 一株提高中药猪苓产量和质量的优质蜜环菌 本发明公开了一株提高中药猪苓产量和质量的优质蜜环菌(Armillaria sp.),它的保藏编号是:CGMCC No.21080。本发明提供的蜜环菌能够提高猪苓菌核产量,并能提高菌核中猪苓多糖、麦角甾醇和猪苓酮A的含量,... 郭顺星 邢咏梅 李兵 陈晓梅 孟志霞 周丽思 曾旭促生菌株Mycena sp.MF23对黑果腺肋花楸光合作用的影响 单婷婷 周丽思 李兵 陈晓梅 郭顺星