李喆
- 作品数：1 被引量：6H指数：1
- 供职机构：南开大学更多>>
- 发文基金：国际科技合作与交流专项项目国家高技术研究发展计划国家科技重大专项更多>>
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- 中国HIV-1 B′亚型毒株不同基因区与全长基因组系统进化比较被引量：6
- 2012年
- 本研究旨在探索不同基因区的使用对HIV-1B′亚型毒株系统进化分析结果的影响。首先利用既往研究中已发表的共计47条来自泰国,缅甸和中国多个地区不同传播途径的B′毒株近全长基因组序列,将其按基因区分为不同的数据集(gag,pol,vif,vpr,vpu,env,nef),并分别进行系统进化分析研究。比较不同基因区系统进化分析的结果发现,B′亚型毒株pol基因在分析的基因区中,具有最低的复杂度和进化速率,可以较好的区分B′TH和B′YN毒株,重复近全长基因组序列的分析结果;尽管env基因则具有最高的复杂度和进化速率,但无法获得类似结果。本研究比较了不同基因区对HIV-1B′亚型毒株系统进化分析结果的影响,对进一步开展HIV分子流行病学调查,分析我国B′毒株在我国的传播奠定了基础。
- 李喆杨尧魏静冯毅邢辉何翔邵一鸣
- 关键词：HIV-1
