李瑶
- 作品数：163 被引量：678H指数：13
- 供职机构：苏州大学更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金国家高技术研究发展计划上海市自然科学基金更多>>
- 相关领域：医药卫生生物学农业科学电子电信更多>>
- 用基因芯片检测单核苷酸多态性反应原理被引量：16
- 2005年
- 基因芯片技术因其高通量、高效率的特点被用于第三代遗传标记单核苷酸多态性位点的筛选。近几年SNP芯片研究在反应原理方面取得了重大进展,其中包括基于核酸杂交反应的芯片、基于单碱基延伸反应的芯片、基于等位基因特异性引物延伸反应的芯片、基于“一步法”反应的芯片、基于引物连接反应的芯片、基于限制性内切酶反应的芯片、基于蛋白DNA结合反应的芯片,及基于荧光分子DNA结合反应的芯片。比较了上述各种芯片技术方法的优劣,为进一步科研工作的开展提供了参照,并综述了SNP芯片在疾病基因组学、药物遗传学和个体识别等科研领域的应用,且对其今后的发展方向进行了阐述。
- 张小燕左明雪张占军王忠李瑶
- 关键词：基因芯片单核苷酸多态性
- 脑膜瘤病理级别基因诊断芯片数学模型的建立被引量：1
- 2006年
- 目的根据脑膜瘤基因表达谱,寻找脑膜瘤病理分级(WHO2000标准)的分子生物学依据,并建立脑膜瘤病理级别基因诊断芯片的数学模型。方法利用cDNA芯片技术建立24例脑膜瘤基因表达谱数据库,应用生物信息学分析软件GeneMaths2.0对脑膜瘤基因表达谱数据进行“非监督”样本聚类分析(Hierarchical聚类),将聚类结果与脑膜瘤样本的病理级别进行相关性分析;应用SAS9.0软件,用“贝叶斯判别法”建立脑膜瘤病理级别诊断的判别函数方程;对于脑膜瘤基因表达谱的数据可靠性,应用点杂交(DotBlot)实验进行了验证。结果脑膜瘤基因表达谱样本聚类结果与其样本的病理级别存在高度相关性;筛选出5条基因,建立了3个判别函数方程,根据它们的表达情况可以较准确的判断脑膜瘤的病理级别。结论脑膜瘤目前的病理分级标准有分子生物学基础;根据脑膜瘤基因表达谱可建立判断脑膜瘤病理分级的诊断芯片数学模型。
- 陶英群卢亦成骆纯魏庆李瑶白如林蔡如珏董艳楼美清陈志刚丁学华候立军
- 关键词：脑膜瘤表达谱芯片基因聚类
- 基于微滴式数字PCR检测肠癌病人游离环状DNAKRAS突变的新方法被引量：3
- 2018年
- 基于微滴式数字聚合酶链式反应(Droplet digital polymerase chain reaction,dd PCR)设计一种检测肠癌游离循环DNA(Circulating cell free DNA,cf DNA)中KRAS(V-Ki-ras2 Kirsten ratsarcoma viral oncogene homolog)基因突变的新方法并评估其灵敏度和准确性。根据肠癌病人KRAS基因的突变类型设计并合成,采用dd PCR扩增并评估其灵敏度和准确性;根据AMRS-PCR引物设计原理设计KRAS基因的实时定量PCR扩增引物并评估其准确性,进而比较dd PCR和q PCR二者之间的优缺点;最后针对52例肠癌病人的cf DNA采用dd PCR进行检测,研究dd PCR在cf DNA KRAS基因突变检测的应用。成功使用dd PCR和q PCR两种方法对KRAS野生型及7种突变型建立检测方法,使用质粒标准品及实际样品验证该两种方法可行并对其假阳性率、线性范围及检测下限等性能进行了评价,最后成功对52例临床患者和20例正常人的血浆cf DNA样本进行检测,临床灵敏度为97.64%,临床特异性为81.43%。dd PCR的检测性能优于q PCR,LOD达到个位数DNA拷贝,最低可确认突变浓度达到0.01%–0.04%。样本提取效率在方法学建立中也十分重要,直接影响到灵敏度和Cut Off值的判定。临床患者检测结果显示其KRAS突变率接近报道水平。
- 罗宇文李瑶
- 关键词：KRAS
- 农杆菌介导将雪莲凝集素(GNA)基因转入籼稻单倍体微芽的初步研究被引量：54
- 1998年
- 以含有双元载体（携带GNA基因，npt－Ⅱ基因）的根癌农杆菌菌系LBA4404转化籼稻单倍体无性系微芽Hu18，经共培养后在含G418的保存培养基中连续筛选G418抗性芽，抗性芽经生根培养基中壮苗获得单倍体转化植株。PCR分析证明GNA基因已进入到Hu18细胞中，抗虫鉴定表明转基因植株具有白背飞虱抗性。并探明了G418对单倍体微芽的致死浓度和时间，共培养时间对G418抗性芽产生的影响。
- 杨长登唐克轩吴连斌李瑶赵成章刘光杰沈大棱
- 关键词：单倍体根癌农杆菌籼稻
- 基因指纹法预测鼻咽癌放射敏感性初步研究被引量：3
- 2007年
- 目的:研究放射敏感与放射抵抗的鼻咽癌组织基因表达差异,寻找预测鼻咽癌放射敏感性基因指纹。方法:采用BioStarH-141s(2004)型含14112点的人类全长基因cDNA表达谱芯片,对19例不同放射敏感性鼻咽癌组织进行检测,其中放射敏感8例,放射抵抗11例,用T-test检验、聚类、LOOCV等方法进行生物信息分析。结果:放射抵抗组与放射敏感组比较,表达差异的基因P<0.5有923条,P<0.01有164条,P<0.001有17条;与慢性炎症组织相比,放射敏感组70%以上病例有2倍以上表达差异的基因267条,明显高于放射抵抗组106条。这些基因包括已知的与放射敏感性密切相关的基因PRKD,DCK等;还有大部分以前没有描述与放射敏感性相关的基因,如SIRT1,RABAC1,PPP1CC,ZNF638,APPBP1,RABAC1等,它们主要与细胞周期、S期和M期调控点、细胞凋亡、细胞生长、DNA绑定,RNA绑定等功能有关;还有一些新发现的,功能尚未明确的基因,如CUTA,ZNF148,Sep15,TMTC3,TOP1等。取P<0.01的差异表达基因98条进行聚类分析,19例患者能分成放射敏感与抵抗二类,除1例外,所有病例敏感性的分类均与临床结果相符。用LOOCV验证,准确率100%。结论:不同放射敏感性的鼻咽癌组织,基因表达存在明显差异,与炎症组织比较,放射敏感组的基因表达差异更大,可利用差异基因簇进行放射敏感性分类,提示可利用基因指纹法进行鼻咽癌放射敏感性预测。
- 陈甲信郭懿李瑶张政司勇锋冯国生程金建邓卓霞
- 关键词：鼻咽癌基因表达谱
- 数字PCR检测cfDNA中KRAS突变的灵敏度研究
- 2018年
- 目的该文旨在研究一种适用于数字PCR在KRAS基因突变液态活检中的灵敏度评价方法 ,并通过临床样本的检测结果验证灵敏度算法的可行性。方法 2016年11月基于微滴式数字PCR平台设计引物探针建立KRAS检测方法,确定其检测下限、定量下限、变异系数。2017年1月比较了数字PCR 3种不同检测下限统计算方法。结果成功建立微滴式数字PCR对KRAS突变检测方法。在3种检测下限计算方法结果对比后选择了保守性居中的算法。结论数字PCR是一种灵敏精确的基因突变检测方法,其检测下限可使用基于假阳性率的泊松分布算法进行量化评价,且综合检测性能适用于临床液态活检的需求。
- 罗宇文李瑶景奉香
- 关键词：KRAS
- 高血压易感基因的rs4846085位点的检测方法及检测试剂盒
- 本发明属于分子生物学和医学领域，涉及一种检测高血压易感性基因的方法及其检测试剂盒。本发明提供了一种检测原发性高血压易感性基因的方法，它包括检测线粒体融合基因2(Mfn2)/增殖抑制基因(HSG)rs4846085位点的基...
- 温绍君李瑶刘洁琳谢毅李志忠吴海楼煜清罗毅刘雅王佐广刘阔柳景华文杰李婷
- 应用寡核苷酸芯片并行检测肝细胞癌p53基因突变类型
- 2003年
- 目的 :并行检测原发性肝癌 p5 3基因突变类型。方法 :参照国际公共 p5 3突变数据库资料发生频率最高的 7个突变类型作为检测探针设计寡核苷酸芯片 ,应用该项技术检测肝癌抑癌基因 p5 3上对应的 7个常见突变位点的突变频率及形式。结果 :检测高发区及低发区肝癌石蜡包埋标本各 14例 ,p5 3突变发生率分别为 64.3 %及 14 .3 %(P <0 .0 5 ) ,高发区组 p5 3突变热点为 2 4 9编码区 ,占该组突变的 77.8%,突变形式为 2 4 9ser突变。结论 :本研究发现高发区组肝癌 p5 3基因突变热点为 2 4 9ser突变 ,应用寡核苷酸芯片技术可并行、高效。
- 张法灿陈可和刘三震丁志敏陈振祥李瑶
- 关键词：肝细胞癌P53基因突变原发性肝癌
- “人肉搜索”的法律规制
- “人肉搜索”作为新兴的网络行为模式，在受到网民追捧的同时，也遭到了各界的贬评。“人肉搜索”存在有着一定的合理性，对改变社会舆论环境产生了深远影响，也为人们开辟了新的舆论监督途径，但其负面作用同样巨大，从其诞生之日起就不可...
- 李瑶
- 关键词：人肉搜索网络隐私权法律规制立法规制
- 文献传递
- 农杆菌转化水稻系统的研究被引量：13
- 1994年
- 自1988年以来,水稻基因转化技术已取得显著进展,建立了转化水稻原生质体(电击法和PEG法)和完整细胞(基因枪法)的有效方法,得到外源基因稳定整合的转化植株及后代,但双子叶植物中最普遍使用的农杆菌介导法,却不能很好地应用于水稻,虽有几篇报道,但未得到转化植株,也未有转化目的基因的报道.我们尝试用农杆菌介导,将人工合成的抗菌肽基因转化水稻不定芽,得到表达外源基因的工程植株,建立了一种转化水稻的有效方法.
- 李瑶沈大棱潘小舟任大明叶鸣明刘祖洞秦瑞珍
- 关键词：农杆菌抗菌肽
