杨娥
- 作品数：20 被引量：48H指数：4
- 供职机构：西安交通大学医学部更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金国家高技术研究发展计划国际科技合作与交流专项项目更多>>
- 相关领域：医药卫生生物学文化科学更多>>
- 志贺氏菌属鲍氏(S.boydii)亚群基因组组成与进化分析被引量：1
- 2005年
- 利用比较基因组杂交法(comparativegenomichybridization,CGH)对志贺氏菌属鲍氏(S.boydii)亚群共18个血清型代表菌株的基因组结构组成进行比较分析,结果显示,该亚群基因组的“共有骨架”包含2552个与非致病性大肠杆菌K12同源的ORFs.比对K12基因组,该亚群所有菌株基因组共同缺失ORFs为199个,主要涉及外膜蛋白编码基因和O-抗原合成相关基因,而属于亚群特异性的ORFs主要以噬菌体基因和未知功能ORFs为主,一些参与铁离子代谢、运输和Ⅱ型分泌系统基因在大多数的鲍氏菌株中存在.以比较基因组杂交法得到的进化分析显示:鲍氏亚群18个血清型代表菌株可分为4组,其中13型与其他菌株有较大的差异.这种分组结果与某些代谢相关的基因分布情况存在对应关系.通过对该亚群“共有骨架”、缺失基因和株特异基因,以及进化分类等方面的分析,以期探索该亚群基因组的进化规律,并为志贺氏菌属鲍氏亚群的致病机理、疫苗研制和药物开发等方面的研究提供重要线索.
- 张笑冰王璟彭俊平杨娥宾文杨剑董杰孙立连徐星晔金奇
- 关键词：比较基因组杂交比较基因组进化分析志贺氏菌亚群
- 宏基因组学及其技术的研究进展被引量：13
- 2008年
- 宏基因组学是研究生态群体基因功能和其相互作用的新科学领域,以特定生态环境中微小生物遗传物质的总和作为研究对象,基本研究策略是通过克隆、异源表达,筛选出有用的新基因及其产物。宏基因组学为生命学科和药学研究提供了一个强有力的新技术,并在包括医学在内的许多领域取得了新成就。本述评对宏基因组学的概念、技术和应用作了简要介绍。
- 楚雍烈杨娥
- 关键词：宏基因组学宏基因组文库构建文库筛选
- 《生物信息学》教学实践探讨被引量：8
- 2011年
- 从教学实际出发,总结了医学院校《生物信息学》教学实践中的一些体会,探讨了提高学生生物医学信息处理能力的教学模式、教学内容和方法。期望通过《生物信息学》课程的讲授,使学生了解到生物信息学发展的前沿,掌握生物信息学的基本分析方法,最终达到能够在科研中独立应用生物信息学进行分析的目的。
- 寻萌陈艳炯杨娥邵明明李薇宋娟楚雍烈
- 关键词：生物信息学教学实践教学方式
- 宫颈癌组织中人乳头瘤病毒16型细胞类型特异性增强子的变异及序列分析
- 人类乳头瘤病毒16型是高危肿瘤病毒,与宫颈癌密切相关.本文探讨该病毒的细胞类型特异性增强子的变异及序列分析.
- 刘文康楚雍烈曹春霞杨娥
- 关键词：宫颈癌人乳头瘤病毒细胞类型
- 文献传递
- 痢疾志贺氏菌亚群的比较基因组学研究与进化分析被引量：1
- 2005年
- 利用大肠杆菌K12MG1655株全基因组ORFs和痢疾志贺氏菌A1型Sd51197株特异性ORFs探针制备的芯片,研究了痢疾志贺氏菌13个血清型代表株的基因组组成.结果显示,该血清群成员的基因组中包含有2654个保守的源于大肠杆菌ORFs;共同缺失了219个涉及前噬菌体基因、分子伴侣、特异性O抗原合成等大肠杆菌原有的基因;并通过水平转移获得了一些特异性基因,如Ⅱ型分泌系统相关组分、铁转运相关因子等.根据基因组组成所作的进化树,发现A1,A2,A8和A10这四型菌与其他痢疾志贺氏菌亲源关系较远.研究所得结果为进一步深入探索痢疾志贺氏菌的生理过程、致病性和进化奠定了基础.
- 宾文杨娥彭俊平张笑冰王璟杨剑董杰楚雍烈张景海金奇
- 关键词：痢疾志贺氏菌比较基因组学进化分析亚群特异性基因进化树
- 医学微生物学课堂教学新模式的实践与探索被引量：2
- 2005年
- 突破传统的教育思想,确立学生是主体,能力素质是核心,提高质量是关键的教学理念,结合医学微生物学课程特点,以课堂教学改革为突破口,开展"以问题为中心"讨论式教学模式的探索,促进学生主动学习的兴趣和综合能力的提高.
- 董晓慧臧伟进楚雍烈杨娥陈瑛
- 关键词：教学理念课堂教学改革教学模式
- 人杀菌渗透增强性蛋白N末端片段在大肠杆菌中的表达被引量：3
- 2006年
- 目的构建表达人杀菌渗透增强性蛋白(BPI)N-端193个氨基酸的重组表达质粒,诱导表达BPI193重组蛋白。方法应用RT-PCR的方法从HL-60细胞内扩增出BPI氨基端1-193个氨基酸的基因序列,克隆入T载体。将BPI193基因片段定向克隆入原核表达载体PET-28a中,构建重组的原核表达质粒PET-BPI193,转化大肠杆菌BL21菌株,用IPTG诱导表达蛋白。应用SDS-PAGE检测蛋白表达情况,计算机薄层扫描分析蛋白占菌体总蛋白百分比;Western-blot技术检测表达蛋白的特异性。结果从HL-60细胞中扩增得到579bp的BPI193基因片段,构建了T-BPI193亚克隆和PET-BPI193重组表达质粒。转化大肠杆菌BL21,通过IPTG诱导,经SDS-PAGE检测表明,成功表达了6His-BPI193融合蛋白。计算机薄层扫描分析表达量占菌体总蛋白的12%。Western-blot检测显示表达产物具有特异性。结论成功构建了PET-BPI193重组表达质粒。在大肠杆菌BL21内,诱导获得了BPI193与组氨酸融合表达的重组蛋白。
- 董伟董晓慧楚雍烈杨娥胡刚郑建武
- 关键词：基因表达大肠杆菌
- 尿脱落细胞6号染色体长臂的微卫星改变诊断膀胱肿瘤被引量：2
- 2003年
- 目的 :探讨尿脱落细胞 6q的微卫星改变 (MA)在膀胱肿瘤早期诊断中的应用价值 ,并研究 6q的杂合性缺失(LOH)与膀胱肿瘤的关系 .方法 :应用 6q2 1区域附近D6S4 0 4 ,D6S4 3 4微卫星标志 ,以PCR SSLP 银染法对 3 1例膀胱肿瘤的尿脱落细胞与肿瘤组织进行微卫星分析 .结果 :64 5 %的肿瘤组织和 5 8 1%的尿脱落细胞发生MA ;10例非膀胱肿瘤对照未出现MA ;检出率与肿瘤分期 ,分级无相关性 ;肿瘤组织D6S4 0 4LOH发生率 3 5 5 % ,D6S4 3 4LOH发生率 2 2 6% .结论 :尿脱落细胞微卫星分析有早期诊断意义 ;6q2
- 成凡楚雍烈贺大林杨林陈萍杨娥
- 关键词：膀胱肿瘤尿脱落细胞微卫星改变
- 参与国家大学生创新性实验计划的实践体会被引量：4
- 2012年
- "国家大学生创新性实验计划"是高等学校本科教学"质量工程"的重要组成部分,旨在探索并建立以问题和课题为核心的教学模式,调动学生的主动性、积极性和创造性,激发学生的创新思维和创新意识,从而全面提升学生的创新实验能力。本文根据作者所参与国家级大学生创新实验计划项目——《西安地区结核分枝杆菌rpsL基因突变情况与链霉素耐药性的相关性分析》,阐述了对实验计划项目顺利实施的因素的认识和理解,并介绍了从实际工作中获得的收获和体会。
- 王芳雨张文娟马舒婷秦琪杨娥
- 关键词：大学生创新性实验
- 人乳头瘤病毒16型E5转化基因的克隆及原核表达被引量：1
- 2001年
- 目的建立人乳头瘤病毒16型E5基因的无性繁殖系为进一步研究其致癌机理作准备。方法用PCR技术从HPV16质粒DNA中扩增出E5基因序列连接到pGEM-T载体,将阳性的重组pGEM-T用BamHⅠ/EcoRⅠ双酶切并回收目的片段连接到原核表达载体pGEX-2T,转化DH5α菌株。取工程菌,IPTG诱导表达,SDS-PAGE电泳鉴定。结果①经PCR、测序和双酶切鉴定认为HPV16E5正确插入上述表达载体,建立了该转化基因的无性繁殖系。②经IPTG诱导的pGEX-2T-E5质粒表达出约42KD的融合蛋白,分析含有约16KDHPV16E5蛋白,与预期含HPV16E5的融合蛋白分子量相符。结论①采用PCR克隆技术,扩增HPV16E5转化基因目的片段,将其克隆到pGEM-T载体在国内首次建立了HPV16E5转化基因的无性繁殖子。②成功构建HPV16E5基因的原核表达质粒,并表达出GST-E5融合表达蛋白。
- 曹春霞楚雍烈刘文康杨娥
- 关键词：HPV16克隆原核表达乳头瘤病毒
