窦永超
- 作品数：2 被引量：2H指数：1
- 供职机构：大连理工大学更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：自动化与计算机技术生物学理学更多>>
- 基于最优分割位点的蛋白质亚细胞位点预测方法被引量：2
- 2011年
- 蛋白质的亚细胞位点信息有助于我们了解蛋白质的功能以及它们之间的相互作用,同时还可以为新药物的研发提供帮助。目前普遍采用的亚细胞位点预测方法主要是基于N端分选信号或氨基酸组分特征,但研究表明,单纯基于N端分选信号或氨基酸组分的方法都会丢失序列的序信息。为了克服此缺陷,本文提出了一种基于最优分割位点的蛋白质亚细胞位点预测方法。首先,把每条蛋白质序列分割为N端、中间和C端三部分,然后在每个子序列和整条序列中分别提取氨基酸组分、双肽组分和物理化学性质,最后我们把这些特征融合起来作为整条序列的特征。通过夹克刀检验,该方法在NNPSL数据集上得到的总体精度分别是87.8%和92.1%。
- 王伟郑小琪窦永超刘太岗赵娟王军
- 关键词：蛋白质序列
- 预测蛋白质功能位点的几种新数学模型
- 近年来,生物信息学逐渐渗透到生物学的各个研究领域,悄然改变着传统生物学的研究方式。其作用主要体现在两个方面：(1)借助计算机和数学方法处理海量的生物数据,通过数据挖掘发现其中隐藏的生物学规律。(2)通过数学建模的方法对传...
- 窦永超
- 关键词：生物信息学序列保守性机器学习方法ROC分析
- 文献传递
