芦佳
- 作品数:3 被引量:7H指数:2
- 供职机构:北京市农林科学院农业生物技术研究中心更多>>
- 发文基金:北京市科技计划项目国家自然科学基金北京市农林科学院科技创新能力建设专项更多>>
- 相关领域:生物学农业科学更多>>
- 番茄黄化曲叶病毒基因间区缺失突变体在北京的发现与证实被引量:1
- 2015年
- 在北京发现两种致病性有差异的番茄黄化曲叶病毒(Tomato yellow leaf curl virus,TYLCV)毒株,得到两个不同的TYLCV分离物BJ03和BJ04,并对它们进行了全长扩增测序。TYLCV-BJ03全长为2 781 bp,TYLCV-BJ04全长为2 740 bp。进化树分析显示,这两个毒株分别属于以色列株系TYLCV-IL进化分支下中国的两个不同亚群。二者核酸序列的同源性为99.15%,主要差异在基因间区(intergenic region,IR)。BJ04比BJ03的IR区在互补链方向TATA-box与保守的9核苷酸序列之间缺失41个碱基。通过针对缺失片段设计的特异引物验证,进一步证实了TYLCV的IR区缺失突变体的存在。在对温室中不同发病番茄样本的检测中,同时检测到被两种毒株单独侵染和复合侵染的植株。
- 赵宇楠程晓龙赵萍萍陈亚萍芦佳李常保姚磊
- 关键词:番茄番茄黄化曲叶病毒
- 番茄黄化曲叶病毒北京分离物的全基因组序列测定及进化分析被引量:4
- 2014年
- 番茄黄化曲叶病(tomato yellow leaf curl disease,TYI.CD)在我国危害日益严重.为了对该病进行深入有效的了解,根据已知的番茄黄化曲叶病毒(tomato yellow leaf curl virus,TYLCV)基因组DNAA序列的保守区段,设计两对背向引物;针对北京地区的3个TYLCV分离物进行分子鉴定.结果显示该分离物为单组分病毒,不含DNA—B和卫星DNA—G,是TYLCV的2个新分离物.TYLCV—BJ1与BJ2基因组全长分别为2781bp和2779bp,同源性为99.8%,都编码6个开放阅读框.对TYLCV的分子进化分析表明,国内现已发现的TYLCV株系亲缘关系都很接近,同源性在97.1~99.9%,属于以色列TYLCVIL株系进化下的一个近代分支.从全基因组和各基因的逐个比对结果看,TYLCV的AV1和AV2保守性最高,其次是AC2和AC3.当TYLCV—Mid进化成TYLCV-IL时,ACl和AV4基因发生了较大的变化,IR区的同源性更是从小于70%上升到94.3%.国内的TYLCV株系分成2个亚群,但在地理分布上没有形成严格的区域限定,北京分离物属于CNI亚群.
- 芦佳刘健王慧肖雅文李常保曹鸣庆徐杰姚磊
- 关键词:番茄黄化曲叶病毒分子检测进化
- 四个抗草甘膦基因的抗性比较被引量:2
- 2015年
- 草甘膦抗性是当代农业重要的农艺性状。为了选择最佳的抗性基因用于植物筛选标记,通过选取cp4-epsps、GR79-epsps、gat4621和GAT四个草甘膦抗性基因进行比较,在拟南芥中验证各基因对草甘膦的抗性。4个基因的转化苗经4个浓度的草甘膦喷施检测,结果显示,GAT类基因的抗性明显高于epsps类基因,基因间的差异达到了极显著水平。gat4621基因对草甘膦的抗性最好,在各浓度下存活率均表现为最高值,且抗性稳定。国内发掘的GAT基因对草甘膦也表现出良好的抗性。GAT类基因的拟南芥转化苗在喷施高浓度草甘膦条件下出现严重抽苔抑制;但在停施草甘膦后抑制解除,且可以开花结实。转epsps类基因可以获得高抗草甘膦植株,但在花期喷施草甘膦将造成败育。从基因大小及抗性强弱考虑,GAT类基因作为筛选标记基因应该更为适合。
- 刘健肖雅文芦佳吴忠义张中保徐杰姚磊
- 关键词:草甘膦抗性基因