仝磊光
- 作品数：3 被引量：5H指数：1
- 供职机构：河北农业大学更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：自动化与计算机技术生物学更多>>
- CLARA算法聚类蛋白质序列的实现被引量：1
- 2010年
- 随着基因工程产生大量新序列,导致蛋白质序列数据库的迅速增长,巨量蛋白质数据的功能组和族谱分析使蛋白质序列聚类分析成为结构和功能基因组学重要的研究目标,应用数据挖掘技术对生物数据进行聚类分析成为生物信息学研究的热点。聚类分析算法中的CLARA划分算法已广泛应用于其它领域,但在大数据量蛋白质序列聚类分析中应用很少,文章应用CLARA算法对在基准数据库中选取的蛋白质序列进行聚类分析,并将结果与其它几种蛋白质聚类算法进行了比较。
- 仝磊光谢景新高明亮
- 关键词：数据挖掘聚类蛋白质序列
- 改进的免疫算法在函数优化中的应用被引量：4
- 2009年
- 针对遗传算法群体多样性保持能力不足,易陷入局部最优等缺点,提出了一种改进的免疫算法(Im-proved Artificial Immune Algorithm,IAIA),并将其与函数优化相结合,用于解决多模函数优化问题.用个体的实数值根据欧式距离进行适当的聚类分析,认为类内个体均具有相同的浓度值,用个体的二进制编码计算类的平均信息熵,进而得到浓度值,用以取代了标准人工免疫算法(Artificial Immune Algorithm,AIA)中计算任意两个体间信息熵的算法;根据个体适应值和浓度控制个体的繁殖率,该算法在保持与AIA相近的多样性和收敛性的同时,达到减少算法的时间复杂性,提高计算效率的目的.测试实验表明,对单模和多模函数优化问题,以及在高维的情况下,IAIA有较高的解质量及较短的运算时间,显示出良好的性能.
- 谢景新程春田仝磊光
- 关键词：聚类分析
- 生物信息学中序列比对方法的研究
- 序列比对是生物信息学中基本的信息处理方法,对于发现核酸和蛋白质序列上的功能、结构和进化的信息具有非常重要的意义。随着生物序列数据库中数据的快速增长,开发具有高度敏感性和效率的算法就显得非常迫切。免疫遗传算法将遗传算法与免...
- 仝磊光
- 关键词：生物信息学遗传算法免疫遗传算法
- 文献传递
