您的位置： 专家智库 > >

张涛涛

作品数：4 被引量：43H指数：3
供职机构：哈尔滨工业大学计算机科学与技术学院更多>>
发文基金：国家自然科学基金黑龙江省杰出青年科学基金黑龙江省留学归国人员基金更多>>
相关领域：生物学自动化与计算机技术更多>>

合作作者

文献类型

  • 3篇期刊文章
  • 1篇学位论文

领域

  • 3篇生物学
  • 3篇自动化与计算...

主题

  • 2篇二级结构预测
  • 2篇RNA二级结...
  • 2篇RNA二级结...
  • 1篇多序列比对
  • 1篇英文
  • 1篇神经网
  • 1篇神经网络
  • 1篇生物信息
  • 1篇生物信息学
  • 1篇网络
  • 1篇关键字
  • 1篇分子
  • 1篇RNA分子
  • 1篇AHO-CO...
  • 1篇DNA
  • 1篇HOPFIE...

机构

  • 4篇哈尔滨工业大...

作者

  • 4篇张涛涛
  • 3篇邹权
  • 3篇郭茂祖
  • 1篇王晓凯

传媒

  • 2篇电子学报
  • 1篇生物信息学

年份

  • 1篇2009
  • 2篇2008
  • 1篇2007
共 4 条 记 录，以下是 1-4
全选 清除 导出
排序方式：
基于比较序列分析的RNA二级结构预测算法研究
RNA（ribonucleic acid）二级结构预测是分子生物学中的关键问题。利用X射线晶体衍射和核磁共振（Nuclear Magnetic Resonance）等实验方法测定RNA分子的立体结构，可以得到比较精确、可...
张涛涛
关键词：RNA分子HOPFIELD神经网络
文献传递
参数序列比对算法研究(英文)被引量：4
2008年
序列比对是生物信息学中的一项重要任务,通过序列比对可以发现生物序列中的功能、结构和进化的信息。序列比对结果的生物学意义与所选择的匹配、不匹配、插入和删除以及空隙的罚分函数密切相关。现介绍一种参数序列比对方法,该方法把最佳比对作为权值和罚分的函数,可以系统地得到参数的选择对最佳比对结果的影响。然后将其应用于RNA序列比对,分析不同的参数选择对序列比对结果的影响。最后指出参数序列比对算法的应用以及未来的发展方向。
张涛涛郭茂祖邹权
RNA二级结构预测方法综述被引量：29
2008年
RNA二级结构预测是计算分子生物学中的一个重要领域.本文介绍了RNA二级结构的预测方法,包括该问题的数学模型、主要算法思想以及每种算法对应的软件.在tRNA和RNase P RNA数据库中随机选取了几组样例对目前主要的7种软件进行测试,同时对每种软件的优缺点进行了详细比较.实验证明,当存在同源序列时,Pfold的效果优于其它软件.最后,在总结分析现有算法的基础上探讨了该领域进一步的研究方向.
邹权郭茂祖张涛涛
关键词：RNA二级结构预测
基于关键字树的DNA多序列星比对算法被引量：9
2009年
在构建进化树、比较单体型序列等生物信息学研究中,需要比对多个相似程度很高的DNA序列.对于数量多、序列长的多序列比对问题,通常使用时间复杂度较低的星比对算法.然而在处理大规模数据时,星比对的平方时间复杂度依然不能满足需要.因此,在星比对思想的基础上,本文结合关键字树理论,先找出完全匹配的区域,然后比对剩余区域,以达到降低期望时间复杂度的目的.两组实验证明了本文算法的有效性,在取得相同比对效果的情况下,本文算法运行时间小于其他方法.
邹权郭茂祖王晓凯张涛涛
关键词：多序列比对AHO-CORASICK算法生物信息学
全选 清除 导出
共1页<1>
聚类工具0