杨银凤
- 作品数：6 被引量：1H指数：1
- 供职机构：大连理工大学化工学院(石油化工学院)更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：理学农业科学医药卫生更多>>
- 基于糖皮质激素受体调节剂波尼松龙的定量构效关系研究
- 2013年
- 为了探讨糖皮质激素受体调节剂波尼松龙系列的结构和活性之间的关系,首次使用比较分子力场(CoMFA)和比较分子相似性指数分析(CoMSIA)方法对77个靶标分子建立三维定量构效关系(3D-QSAR)模型.在基于配体叠合的基础上,得到了最好的CoMSIA模型(Q2=0.504,R2ncv=0.849,SEE=0.283,F=56.365和R2pred=0.792).模型的三维等势线图分析说明了疏水性基团在R1取代基位置有利于提高活性,亲水性基团在R2取代基位置有利于提高活性.此外,分子对接分析结果显示了与波尼松龙形成一些氢键的氨基酸Asn564,Gln642,Thr739在糖皮质激素受体调节剂中有重要作用.本文得到的结果能够更好地帮助理解糖皮质激素受体调节剂作用机理,并为今后的药物设计与合成提供了新思路.
- 王景辉王斌李燕杨银凤杨凌
- 关键词：糖皮质激素受体分子对接
- EP1受体抗拮剂定量构效关系
- 2012年
- 为辅助开发高活性EP1受体抗拮剂,探讨和研究EP1受体拮抗活性的关键影响因素,选取103个EP1受体抗拮剂分子作为数据集,采用多元线性回归(MLR)法和主成分分析(PCA)法分析每个分子的254个参数进行模拟建模.结果表明,应用MLR和PCA方法都得到了具有良好预测能力的定量构效关系模型.MLR法所建模型结果为:训练集R2=0.77,SEE=0.83,检验集R2=0.74,SEP=0.33.PCA所建模型为:训练集R2=0.72,SEE=0.45,检验集R2=0.71,SEP=0.38.两种方法相比,MLR法所建模型较优,可靠性及预测性强.这些模型及其确定的活性影响参数有助于辅助研发和筛选新型EP1受体抗拮剂.
- 闫玉莲李燕杨银凤卢晓伟张述伟
- 关键词：定量构效关系多元线性回归主成分分析
- 5-HT_6受体拮抗剂三维定量构效关系研究
- 2012年
- 为指导合成高效的5-HT6受体拮抗剂,采用比较分子场分析(CoMFA)和比较相似性指数分析(CoMSIA)对143个5-HT6受体拮抗剂数据进行了三维定量构效关系(3D-QSAR)研究,分别得到了具有良好可靠性和预测能力的CoMFA(Q2=0.513,R2ncv=0.864,R2pre=0.731)和CoMSIA模型(Q2=0.515,R2ncv=0.844,R2pre=0.777).由模型的等势线图分析,可得如下结论:大体积及/或电负性较大的R2取代基、疏水性R3和疏水性苯环R1位取代基、可作氢键受体的R2取代基、可作氢键供体的R3取代基有助于增大活性.这些结论能够更好地帮助理解5-HT6受体拮抗剂的抑制机理,并为今后的药物设计与合成提供新思路.
- 刘晶李燕杨银凤张述伟杨凌闫玉莲
- 关键词：三维定量构效关系拮抗剂
- 广谱沙粒病毒抑制剂的3D-QSAR分析
- 2014年
- 沙粒病毒(Arenaviruses)遍布全球,其中的拉沙热病毒可引起致命的拉沙热.通过应用比较分子场分析(CoMFA)和比较相似性指数分析法(CoMSIA)对47个广谱沙粒病毒抑制剂进行了三维定量构效关系(3D-QSAR)分析.使用立体场、静电场、疏水场和氢键受体场组合获得最优模型CoMSIA的统计结果为Q2=0.518,R2ncv=0.972,R2pre=0.911,说明该模型的可靠性和较好预测能力.此外,模型等势线图直观地解释了分子结构与其活性的关系,为进一步设计新型高效的沙粒病毒抑制剂提供了理论依据.
- 杨银凤王斌王景辉李燕杨凌
- 关键词：苯并咪唑衍生物三维定量构效关系
- 基于吲哚类的ROCK激酶抑制剂定量构效关系的研究
- 2015年
- 基于计算生物学方法对61个ROCK激酶靶标分子建立三维定量构效关系(3DQSAR)模型.在基于配体叠合的基础上,发现CoMSIA中2个场组合(位阻场和疏水场)为最好的模型(Q2=0.509,R2ncv=0.987,SEE=0.131,F=287.999和R2pre=0.837).基于此模型基础上的三维等势线图形象地说明了在各个位置增加疏水性的大取代基或者亲水性基团有利于提高分子的生物活性.此外,分子对接模拟结果显示了氨基酸Glu170,Met172和Asp232在受体调节剂中发挥着重要作用.这些结果能够帮助深入了解ROCK激酶的作用机理,并且能够为今后的药物设计提供新的方向.
- 肖元春李燕杨银凤王景辉杨凌
- 关键词：分子对接
- 广谱沙粒病毒抑制剂的三维定量构效关系研究
- 沙粒病毒又名砂粒样病毒（Arenavirus），是一种遍布全球的具有包膜的RNA病毒，包括10种形态相似、血清学相关的病毒。根据基因型、血清型和出现地区可系统地分为两种类型：旧世界型（the Old World Line...
- 杨银凤
- 关键词：三角帆蚌三维定量构效关系药物设计
- 文献传递
