梁志超
- 作品数：38 被引量：261H指数：9
- 供职机构：北京市疾病预防控制中心更多>>
- 发文基金：国家科技重大专项北京市自然科学基金北京市科技计划项目更多>>
- 相关领域：医药卫生农业科学文化科学更多>>
- 一种检测新型冠状病毒的变异位点的引物组合物
- 本发明涉及分子生物学检测技术领域，具体提供了一种检测新型冠状病毒的变异位点的引物组合物及其应用。本发明还提供了一种SARS‑CoV‑2的变异位点的检测方法，所述的检测方法将特异性引物组合物、单碱基延伸反应以及基质辅助激光...
- 张代涛黄瑛张新沈玲羽潘阳梁志超冯兆民李夫吕冰崔淑娟刘医萌赵佳琛彭晓旻卢桂兰石伟先杨鹏王全意
- 北京市入托体检健康儿童肠道病毒71型和柯萨奇病毒A组16型感染状况及就诊行为调查被引量：6
- 2015年
- 目的：了解北京市入托儿童肠道病毒71型（EV71）和柯萨奇病毒A组16型（Cox A16）感染状况及其相关的就诊率，为估算手足口病疾病负担参考。方法2013年8月20－31日对北京市东城区、朝阳区和怀柔区进行入托体检的健康儿童开展血清学调查，采用ELISA方法检测血清中EV71和Cox A16的IgG和IgM抗体。结果共调查813名儿童，平均年龄为（3.5＆#177;1.0）岁。Cox A16 IgG阳性率为61.9%，IgM阳性率为4.4%；EV71 IgG阳性率为9.3%，IgM阳性率为1.1%；各种抗体阳性率在不同性别中的分布差异无统计学意义（P＞0.05），在不同年龄组中的分布差异有统计学意义（P＜0.05）。Cox A16抗体阳性者中7.8%有皮疹，EV71抗体阳性者中10.7%有皮疹。Cox A16或EV71抗体阳性者中，仅7.1%在父母陪伴下到医院就诊，而有皮疹的抗体阳性病例中，80.5%去医院就诊。结论北京市健康入托儿童中，既往感染Cox A16的比例较大，EV71抗体阳性率明显低于Cox A16，提示托幼儿童对EV71普遍易感，应是手足口病防控重点人群。
- 王小莉林长缨张海艳马建新李超李洁贾蕾杨扬杜轶威梁志超王全意贺雄
- 关键词：手足口病肠道病毒71型柯萨奇病毒A组16型
- 牡蛎中诺如病毒检测的前处理方法比较及应用被引量：9
- 2015年
- 目的 对牡蛎中诺如病毒检测的三种前处理方法进行比较并探讨应用策略.方法 2014年8月-2015年3月采集160只市售牡蛎,每组5只,共32组样品,取其肠腺组织采用直接处理法（M1）、PEG 8000沉淀法（M2）和蛋白酶K消化-PEG 8000沉淀法（M3）三种方法进行前处理,提取核酸后荧光定量RT-PCR检测诺如病毒核酸.应用串并联法对三种前处理方法的样品阳性率进行分析,利用x2检验比较不同方法的阳性率差异,应用一致性检验比较不同方法的一致性,对荧光RT-PCR所得到的Ct值进行ANOVA检验.结果 M1、M2、M3三种前处理方法诺如病毒阳性率依次为15.63％（5/32）、34.38％ （11/32）和37.50％ （12/32）;M1/M2/M3并联使用的阳性率最高,为50.00％ （16/32）;其次为M2/M3并联法,阳性率为46.88％ （15/32）;M1＋ M3串联或M1＋ M2＋ M3串联的阳性率最低,均为9.38％ （3/32）.M2/M3与M1/M2/M3的阳性率经x2检验比较,差异无统计学意义（P＞0.05）,两种方法经一致性检验,kappa=0.931（P＜0.05）,一致性较高.M1、M2、M3三种方法检测阳性样品的Ct值依次为33.44±0.66、33.70±1.88和33.42±2.44.经ANOVA检验,差异无统计学意义（P＞0.05）.结论 常规监测时推荐使用M2或M3,暴发疫情溯源时可考虑使用M2/M3并联法.
- 严寒秋霍达刘白薇高志勇李伟红杜轶威梁志超杨扬陈丽娟王全意
- 关键词：牡蛎诺如病毒前处理荧光定量RT-PCR
- 基于肠道病毒A71型基因组研究其毒力相关位点被引量：2
- 2018年
- 目的基于肠道病毒A71型（EV-A71）基因组探索研究其毒力相关位点。方法计算来源于轻症、死亡病例的EV-A71各段基因的遗传距离，分析基因同源性；对轻症、死亡病例来源的EV-A71的5′UTR区核苷酸、结构蛋白编码区和非结构蛋白编码区氨基酸进行比对，分析与EV-A71毒力相关的位点。结果来源于轻症和死亡病例的2株EV-A71均属C4a基因型，基因组同源性为96.2%～97.5%、5′UTR的第ⅴ结构域核苷酸相同，结构一致；结合从GenBank上下载的C4a型EV-A71的全基因组序列开展分析，结果显示在EV-A71蛋白编码区共发现4个氨基酸位点与病毒毒力相关，是潜在毒力位点，分别为非结构蛋白编码区的2 A区R68M、2C区K41R、3 A区T/V47A及3C区I158V。结论死亡病例和轻症病例来源的EV-A71非结构蛋白编码区部分氨基酸位点的变异可能与病毒毒力相关。
- 李洁杜轶威霍达杨扬梁志超贾蕾陈丽娟王全意
- 关键词：基因组毒力
- 食品和加工材料表面SARS-CoV-2存活规律研究被引量：3
- 2022年
- 目的分析新型冠状病毒在不同食品和加工材料表面存活规律,为制定预防病毒通过食品和加工材料传播的防控措施和风险评估提供参考。方法将病毒培养物接种至常见进口食品和加工材料表面,使用荧光定量PCR方法测定在不同温度和时间条件下样本表面病毒核酸载量;使用半数组织培养感染剂量实验测定病毒滴度,观察病毒存活时间。使用线性回归模型计算病毒半衰期。结果食品和加工材料表面病毒核酸载量随时间下降,且温度越高病毒核酸载量下降越快。不同种类食品和加工材料表面病毒存活时间不同,室温条件下,猪肉和车厘子表面病毒存活24 h;其次为带鱼和鲜橙表面。加工材料表面病毒存活时间均较短,小于24 h。4℃条件下,病毒在猪肉表面至少存活1周,其次为车厘子和带鱼。-20℃条件下,病毒在猪肉和塑料包装表面的活性下降缓慢,8周后病毒滴度仍然较高,而在带鱼和纸板表面的活性下降明显。结论不同食品和加工材料表面的病毒核酸存续时间和存活规律不同,且温度越低病毒存活时间越长,应根据食品、加工材料类型,以及生产环境条件制定针对性预防和消毒措施。
- 李夫徐柯潘阳刘培培冯兆民张靖雷雯雯杨梦婕梁志超张代涛杨鹏武桂珍王全意
- 关键词：新型冠状病毒食品病毒活性
- 病毒载量对SARS-CoV-2测序准确性的影响
- 2023年
- 目的评估病毒载量对严重急性呼吸综合征冠状病毒2型(severe acute respiratory syndrome coronavirus 2,SARS-CoV-2)全基因组测序准确性的影响,为新冠病毒基因监测提供技术支撑。方法提取3例新冠病毒阳性病例的核酸进行4个梯度稀释处理,同时提取83例新冠病毒阳性病例的核酸进行验证,通过测序深度、基因组覆盖率和测序深度均一性等指标对测序结果进行评价。结果病毒载量的改变不能影响原始测序数据的质量,病毒载量对测序数据的准确性具有一定的影响:当Ct值≤32时,病毒载量变化对测序深度和基因组覆盖率的影响并不显著,能够达到全基因组测序目的;当Ct达到38时,覆盖率急剧下降至50%以下,无法测到病毒的基因组全长。结论通过评估病毒载量对SARS-CoV-2的测序准确性的影响,我们建议选取Ct值≤32的样本,产生的测序数据的全基因组覆盖率能够满足后续分析要求。
- 徐晖张漫刘平平潘阳李夫冯兆民崔淑娟吕冰梁志超沈玲羽王全意张代涛
- 关键词：新型冠状病毒病毒载量高通量测序数据分析
- 北京市2011-2020年6岁及以上人群手足口病流行特征分析被引量：14
- 2022年
- 目的分析2011-2020年北京市≥6岁人群手足口病流行特征。方法资料来源于中国疾病预防控制信息系统传染病报告信息管理系统2011-2020年北京市手足口病报告病例以及北京市16个区(县)的29家哨点医院的手足口病病原学监测。采用描述性流行病学方法分析北京市≥6岁人群手足口病病例的三间分布以及病原学构成和变化。结果2011-2020年,北京市≥6岁人群累计报告手足口病38183例,其中重症46例(占0.12%),年均报告发病率19.04/10万,男女性别比为1.37∶1(22064∶16119),≥6岁人群手足口病构成比由2011年的7.56%(2606/34488)增加至2020年的24.54%(546/2225)。顺义区、延庆区和通州区≥6岁人群手足口病平均发病率较高。哨点监测肠道病毒阳性率为66.78%(1976/2959),2014年肠道病毒A组71型(EV-A71)构成比为45.29%(101/223),2020年无检测出EV-A71阳性,柯萨奇病毒A组6型(CV-A6)构成比从2016年的15.11%(34/225)提高到2020年的81.08%(60/74)。结论2011-2020年北京市≥6岁人群手足口病患者构成比逐年升高,EV-A71阳性构成基本呈下降趋势。2016年以来,CV-A6已逐渐成为优势毒株。应重视≥6岁人群手足口病疫情以及病原学动态变化。
- 董帅兵王小莉霍达李仁清杨扬梁志超王全意贾蕾
- 关键词：手足口病
- 2015年北京一起鼠伤寒沙门菌暴发流行的病原学检测分析被引量：3
- 2016年
- 2015年5月北京一家大型企业发生聚集性腹泻疫情,流行病学调查后收集现场样本,经过实验室检测确认该次疫情为鼠伤寒沙门菌暴发流行。分离到的18株鼠伤寒沙门菌脉冲场凝胶电泳(PFGE)图谱带型一致,在北京市沙门菌PFGE数据库中未发现相同带型。药物敏感试验结果显示有一株菌株对12种抗生素耐药。这种耐药模式的出现提示需加强耐药监测。
- 吕冰贾蕾张新曲梅张海艳严寒秋黄瑛李洁林长缨高志勇梁志超王全意
- 关键词：鼠伤寒沙门菌脉冲场凝胶电泳耐药
- 滤膜驱动分离培养法在一起空肠弯曲菌腹泻疫情中的应用被引量：5
- 2019年
- 目的应用滤膜驱动分离培养法对一起腹泻疫情的系列样本进行空肠弯曲菌的检测和培养,并对该方法及其增菌效果进行评价。方法收集一起腹泻疫情的18份粪便标本,采用实时荧光PCR方法为疫情定性为空肠弯曲菌感染,应用滤膜驱动分离培养法对粪便标本进行空肠弯曲菌增菌和分离培养,并对增菌效果进行比较分析。结果采用荧光PCR方法检测到18份标本中有11份空肠弯曲菌核酸阳性,阳性率为61.11%(11/18);应用滤膜驱动分离培养法,对18份标本进行空肠弯曲菌的分离和鉴定,共分到8株菌,分离率为44.44%(8/18);其中3份核酸阳性标本,由于菌液含量低,无法用培养方法检出。11份核酸阳性粪便标本经增菌培养后,Ct平均值由原来的27.44变为23.50,增菌效果显著(P<0.05)。结论采用滤膜驱动分离培养法对粪便标本尤其是冻融粪便进行空肠弯曲菌的增菌和分离培养,能有效提高菌株的分离率,避免资源浪费,可做为常规监测或大规模样本筛检的可行性检测方法。
- 张新曲梅梁志超林长缨贾蕾王全意
- 关键词：空肠弯曲菌实时荧光PCR腹泻
- 北京地区宋内志贺菌分子流行病学特征分析被引量：5
- 2013年
- 目的了解北京地区宋内志贺菌毒力基因分布及分子流行病学特征。方法采用实时荧光PCR方法检测毒力基因、脉冲场凝胶电泳(PFGE)分型,多位点序列分型(MLST)及多位点可变数目串联重复序列分析(MLVA)等方法对北京地区2001～2009年50株志贺菌菌株进行分子流行病学特征分析。结果 50株菌中,ipaH、set1、sen三种毒力基因的携带率分别为98%,18%和78%。选取19株流行病学和遗传背景无关的菌株,进行MLST、MLVA与PFGE分型方法的比较,MLST为1个序列型ST152 complex:adk(11)、fumC(63)、gyrB(7)、icd(1)、mdh(14)、purA(7)、recA(7);MLVA被分成15个型别,D值为0.9708;PFGE分成12个型别,D值为0.9532。MLVA初筛得到的8个可变数目串联重复(VNTR)位点用于扩大菌株分析,发现50株志贺菌被分为21个MLVA的型别,TS002和TS001为主要型别。结论北京地区近年来流行的宋内志贺菌存在毒力基因的丢失,MLVA分子型别复杂,存在多克隆来源,提示需要进行连续系统的分子流行病学监测。
- 刘桂荣曲梅张新吴晓娜李锡太贾蕾严寒秋梁志超王全意
- 关键词：宋内志贺菌分子分型多位点序列分型
