潘婷
- 作品数：12 被引量：69H指数：5
- 供职机构：南京林业大学更多>>
- 发文基金：国家林业公益性行业科研专项国家科技支撑计划江苏高校优势学科建设工程项目更多>>
- 相关领域：农业科学生物学文化科学更多>>
- 马尾松转录组测序和分析被引量：26
- 2013年
- 本研究首次构建了马尾松均一化cDNA文库,采用Illumina高通量测序技术对转录组进行了测序,利用生物信息学方法开展基因表达谱的研究、功能基因的预测。EST序列拼接获得83680个contig,其中33772个contig被注释为相应的331669对生物学功能,10647个contig被注释具有酶功能。根据KEGGpathway数据库,对马尾松转录组的contig进行Pathway生物学通路的注释和预测,共识别出10647个contig具有对应的1029种酶功能,并关联到135条生物学通路。SSR查找发现,从83680个contig中找到889个SSR位点,占contig总数的比例为1.06%。其中,三核苷酸重复所占比例最高,达到48.37%,其次是六核苷酸重复,为19.12%,比例最低的是四核苷酸重复,仅为4.72%,二核苷酸重复和五核苷酸重复基本相同,分别为14.62%和13.16%。SSR不同重复基元类型中,出现频率最高的为AT/AT,其次是AGC/CTG和AAG/CTT。
- 王晓锋何卫龙蔡卫佳阮倩倩潘婷季孔庶
- 关键词：马尾松转录组测序SSR
- 不同提取方法对铁线莲属叶片总DNA提取效果的影响
- 以铁线莲属植物的叶片为材料,采用CTAB-SDS法,简易CTAB法,mCTAB法等3种提取方法,比较耗时、纯度、得率、浓度和质量等指标,以期为铁线莲属植物叶片总DNA的提取筛选适宜方法.结果表明,在纯度和浓度方面CTAB...
- 盛璐张逢凯潘婷季孔庶
- 关键词：铁线莲脱氧核糖核酸
- 文献传递
- 马尾松CAD基因的克隆及其编码蛋白质的结构预测被引量：8
- 2014年
- 肉桂醇脱氢酶(cinnamyl alcoholdehy drogenase,CAD)在木质素合成过程中起关键作用。本研究利用CODEHOP设计简并引物,采用RT-PCR和RACE技术,从马尾松中克隆得到CAD基因的cDNA全长(GenBank登入号:KF419291)。此cDNA全长1 450 bp,包括1 074 bp完整的ORF,编码357个氨基酸的蛋白,相对分子质量与等电点分别为38945.1u和5.8。利用ClustalX、DNAMAN、ANTHEPROT软件分析其序列和编码的氨基酸序列。采用RT-PCR方法对CAD基因在根、侧枝、叶、芽四种组织中表达的特异性分析,结果显示,CAD基因在马尾松侧枝中表达量最高,在叶、根和芽中亦有低水平表达。
- 张逢凯潘婷盛璐季孔庶
- 关键词：马尾松肉桂醇脱氢酶基因克隆组织特异性表达
- 马尾松RCA基因的克隆和序列分析被引量：3
- 2015年
- 1,5-二磷酸核酮糖羧化/加氧酶(Rubis CO)活化酶(RCA)是体内活化光合作用限速酶—Rubis CO的重要酶。本研究通过反转录PCR和c DNA末端快速扩增技术,从马尾松中分离得到了Pmrca1(登录号KF420118)和Pmrca2(登录号KF420119)两条RCA基因c DNA序列。两条序列均包含完整的编码区与5'端和3'非翻译区,长度分别为1 816 bp和1 953 bp,编码Pm RCA1和Pm RCA2两个蛋白,长度分别为480和440个氨基酸。序列分析发现两个蛋白质都具有RCA和AAA+蛋白家族(ATPase associated with various cellular activities)特异性结构域和定位于叶绿体的转运肽,Pm RCA1还具有RCA大同工型特有的由两个半胱氨酸(Cys)残基组成的保守结构。多重序列比对显示,这两个蛋白质序列分别与红花槭的RCA大同工型和小同工型的相似性达到78%。将Pm RCA1和Pm RCA2与20种不同物种RCA构建进化树,发现其与地中海松属于同一分支。研究结果为进一步分析马尾松RCA的功能和光合作用机制奠定了基础。
- 潘婷张逢凯王晓锋阮倩倩刘靖盛璐季孔庶
- 关键词：马尾松RCARACEDNA克隆
- 松科树种的离体培养研究进展被引量：20
- 2015年
- 松科树种的离体培养技术相关研究从20世纪70年代开始至今一直备受关注,并取得了不断的突破。笔者综述了松科树种离体培养的研究进展,对松科树种在直接器官发生、间接器官发生、体细胞胚胎发生、原生质体培养等不同离体培养方式所取得的研究结果进行了总结,并介绍了外植体、培养基、激素等影响离体培养的因素和条件,对松科树种离体培养中有待进一步开展的机理性研究、成年母树营养器官离体培养技术、褐化问题、诱导生根和再生植株移栽技术、商业化生产应用、离体材料的超低温保存研究等方面进行了展望。
- 季孔庶王潘潘王金铃阮倩倩潘婷朱沛煌郭天玮刘靖
- 关键词：离体培养器官发生体胚发生原生质体培养超低温保存
- 不同提取方法的铁线莲属叶片总DNA提取效果被引量：5
- 2014年
- 以铁线莲属植物的叶片为材料,采用CTAB-SDS法、简易CTAB法、改良CTAB法等3种提取方法,比较耗时、纯度、得率、浓度和质量等指标,以期为铁线莲属植物叶片总DNA的提取筛选适宜方法。结果表明,在纯度和浓度方面CTAB-SDS法>简易CTAB法>改良CTAB法,在节省提取时间方面改良CTAB法>CTAB-SDS法>简易CTAB法。以CTAB-SDS法所提取的9种铁线莲DNA为模板,进行PCR扩增,CTAB-SDS法提取的DNA得率高、质量好,PCR扩增成功率也较高。综合比较,采用CTAB-SDS法进行铁线莲属叶片总DNA提取效果更佳。
- 盛璐张逢凯潘婷季孔庶
- 关键词：铁线莲
- 马尾松RCA大小同工型基因的克隆和功能分析
- 马尾松(Pinus massoniana)是我国特有的乡土树种，适应性强，生长快，用途广，具有重要经济和环境价值，所以对其功能基因进行研究，尤其是光合作用相关基因进行的研究和利用具有重要意义。核酮糖-1,5-二磷酸羧化酶...
- 潘婷
- 关键词：马尾松RCA克隆表达载体构建
- 文献传递
- 马尾松CAD基因的克隆及序列分析
- 肉桂醇脱氢酶(cinnamyl alcohol dehydrogenase,CAD)是木质素合成过程中关键酶之一.本文利用CODEHOP设计简并引物,采用RT-PCR和RACE技术,从马尾松中克隆得到CAD基因的cDNA...
- 张逢凯潘婷盛璐季孔庶
- 关键词：马尾松肉桂醇脱氢酶基因克隆
- 文献传递
- 马尾松纤维素合成酶基因PmCesA1的克隆及其分析被引量：13
- 2015年
- 植物纤维素合成酶(Ces A)是林木中纤维素合成过程中的重要酶,与木材形成密切相关。本研究以马尾松嫩枝的总RNA反转录得到的c DNA为模板,利用反转录PCR和RACE技术克隆得到马尾松Ces A1基因的全长c DNA序列,命名为Pm Ces A1。序列长度为3 142 bp,包含有一个长为2 955 bp的开放阅读框(open reading frame,ORF),编码984个氨基酸。序列分析表明:Pm Ces A1序列与已报道的火炬松(Pinus taeda)Ces A1基因(AY789650.1)的相似性达99%。对Pm Ces A1所编码蛋白的氨基酸序列聚类分析,结果显示马尾松与松科植物具有较近的亲缘关系。采用实时定量PCR测定了Pm Ces A1在马尾松的嫩枝、叶和根中的表达量,发现以嫩枝中的表达量最高(2.53)。本研究获得的全长基因可以用来构建正义表达载体,再通过遗传转化得到转基因植株,可进一步分析该基因在植株内的表达情况和作用机制,为马尾松纤维素合酶的研究和获得高纤维得率的马尾松良种提供帮助。
- 阮维程潘婷季孔庶
- 关键词：马尾松CDNA克隆
- 抖音短视频中的南京城市形象及传播特征研究
- 2022年
- 新媒体平台迅猛发展,抖音逐步成为城市形象传播的重要载体。通过对抖音中与南京有关的短视频的收集和分析发现,南京软硬实力相辅相成、古都新城和谐共生等形象在抖音中非常凸显,同时南京城市形象在传播过程中呈现出主体话语权让渡、内容情景化等特征。抖音无疑为南京及其他城市进行品牌传播提供了一条全新道路。
- 潘婷
- 关键词：城市形象
