王洪
- 作品数：10 被引量：29H指数：3
- 供职机构：广西医科大学更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金广西壮族自治区自然科学基金国家科技重大专项更多>>
- 相关领域：医药卫生更多>>
- 广西地区人类免疫缺陷病毒-1流行毒株gag基因系统进化和基因变异特征分析被引量：2
- 2015年
- 目的了解广西壮族自治区HIV-1流行毒株gag基因分子进化及遗传变异特征。方法收集2011年10月至2012年3月广西地区HIV-1感染者血液样本158份，采用反转录／套式PCR对HIV-1gag基因片段进行扩增并测序。运用MEGA5．03构建系统进化树，并计算gag区及各编码区段的基因离散率和选择压力（globleω）。两样本基因离散率的比较采用两独立样本t检验，多个样本的基因离散率比较采用单因素方差分析。结果158份样本中获得140条gag基因序列，存在4种亚型：CRF_01AE80份（57．1％），CRF08BC46份（32．9％），CRF07BC10份（7．1％），B（B’）4份（2．9％）。gag基因离散率在CRF01AE亚型为0．036±0．001，CRF08BC亚型为0．031±0．002，CRF07-BC亚型为0．043±0．003，B（B’）亚型为0．102±0．006，差异有统计学意义（F=220．62，P〈0．01）。p17和p24编码区均受到负向选择压力作用，globlem〈1。各亚型p17编码区的globleω值相近，差异无统计学意义（F-0．761，P=0．469），p24编码区的globlem值差异也无统计学意义（F=0．037，P=0．964）。结论广西地区HIV-1亚型以CRF_01AE为主，gag基因各编码区段在进化上相对保守，但HIV-1流行特征的变化可能会影响gag基因的遗传变异，应继续追踪检测。
- 陈荣凤梁冰玉周波赵芳凝刘洁王洪王敏连李旭叶力梁浩
- 关键词：人类免疫缺陷病毒-1基因GAG
- 对奈韦拉平耐药的HIV-1毒株诱导研究被引量：1
- 2016年
- 目的探讨对NVP耐药的I型艾滋病病毒（HIV-1）毒株的诱导方法，获得能够产生连续稳定传代的对NVP高度耐药的HIV-1毒株。方法MT4细胞中先后加入终浓度为100TCID50的HIV-1实验室毒株89．6与终浓度为10倍Ic，。的NVP药物溶液，在药物浓度不变的条件下传代，培育HIV-1病毒。提取每代培养液上清病毒RNA，逆转录后使用巢式PCR扩增HIV-1pol区基因，收集目标片段并进行测序分析。结果诱导培养所得耐药株由第5代开始与野生株相比，出现NVPIC。变化，倍数约为3倍，培养11代后，变化倍数高达178倍。此外，发生Y181C和Y188Y位点突变。结论本实验中在体外经诱导所得耐药株对NVP具有较高的耐药性，并可获得稳定传代。
- 赵芳凝梁冰玉刘洁陈荣凤王敏连王洪蒋俊俊孟思润梁浩叶力
- 关键词：HIV-1耐药
- 用于扩增HIV‑1B亚型病毒env基因的引物及其应用
- 本发明公开了用于扩增HIV‑1 B亚型病毒env基因的引物，包括上游引物env‑H3和下游引物env‑B3，它们分别具有序列表SEQ.ID.No.1和SEQ.ID.No.2的碱基序列。本发明的引物可能够明确地扩增出带有H...
- 黄颉刚梁浩叶力王洪梁冰玉蒋俊俊黄春湲宁传艺臧宁廖艳研
- 文献传递
- 检测艾滋病治疗药物非核苷类逆转录酶抑制剂主要耐药突变位点的引物及其应用
- 本发明涉及用于检测艾滋病治疗药物非核苷类逆转录酶抑制剂主要耐药突变位点的引物，包括检测HIV‑1病毒pol基因的突变位点K103N、V108I、E138A、Y181C、Y188C、G190A、G190R和M230I的AS...
- 蒋俊俊梁浩叶力梁冰玉陈荣凤臧宁黄颉刚周波刘洁赵芳凝王洪王敏连
- 文献传递
- 广西HIV-1流行株env基因C2V3区序列特征和亚型研究被引量：11
- 2015年
- 目的研究广西艾滋病病毒1型流行株的亚型及env基因C2V3区序列变异特征。方法 2009-2012年共收集138份广西HIV-1感染者血浆样本,提取病毒RNA,用巢式聚合酶链反应对env基因C2V3区序列进行扩增,并测序,用MEGA、Hy Phy等软件对序列信息进行分析。结果 138份样本中,CRF01_AE亚型72例;CRF08_BC亚型40例;B亚型13例;CRF07_BC亚型8例;C亚型2例。各亚型基因离散率分别为:CRF01_AE(0.052±0.053);CRF08_BC(0.044±0.048);CRF07_BC(0.030±0.041);B亚型(0.024±0.044)。各亚型之间基因离散率差异无统计学意义(F=1.260,P=0.291)。CRF01_AE的负向选择压力比CRF08_BC大(t=10.060,P<0.001)。共发现7种V3环顶端四肽,其中CRF01_AE有6种,CRF08_BC亚型有2种,两者均以GPGQ为主;B(B’)亚型有2种,以GPGR为主,CRF07_BC仅出现了1种。在CRF01_AE亚型和B亚型中分别发现了新的V3环顶端四肽GPGM和GTGR。各亚型辅助受体均主要为CCR5。结论 CRF01_AE亚型在广西HIV-1流行株中占优势,其V3环顶端四肽以GPGQ为主。CRF01_AE亚型和B亚型V3环序列出现了新的变异特征。广西HIV-1流行株主要为巨噬细胞嗜性的非合胞体诱导型。
- 王敏连梁冰玉叶力潘沛江陈荣凤赵芳凝蒋俊俊黄颉刚王洪刘洁周波梁浩
- 关键词：HIV-1
- 基于WB条带灰度值的HIV-1新发感染的检测方法
- 本发明涉及一种基于WB条带灰度值的HIV-1新发感染的检测方法，对HIV-1感染者的血浆/血清HIV-1特异性抗体进行检测，将结果扫描成图像，导入灰度值分析软件进行灰度值分析，并将数据进行转换；利用矩形方框选取目标区域，...
- 梁浩叶力黄颉刚蒋俊俊王敏连梁冰玉臧宁廖艳研周波王洪陈荣凤刘洁
- 文献传递
- 酒精对丙型肝炎病毒复制的影响及机制研究
- 2014年
- 目的：探讨酒精对丙型肝炎病毒（HCV）复制以及肝细胞Ⅰ型干扰素及其信号通路因子的影响。方法将原代肝细胞用不同浓度的酒精进行处理，再用HCV感染细胞，并在感染后收集细胞测定HCV RNA；用酒精处理原代细胞后用实时荧光定量PCR、ELISA和蛋白免疫印迹法测定细胞内HCV Core、IFN-α、IFN-β、干扰素调节因子7（ IRF-7）、细胞因子信号抑制物（ SOCS ）-2和SOCS-3的mRNA和蛋白表达。结果当酒精浓度高于10 mmol／L时，可增强HCV在原代肝细胞的感染和复制（P＜0．05），且呈现剂量依赖性；用40 mmol／L酒精处理肝细胞，可使细胞IFN-α、IFN-β和IRF-7的mRNA和蛋白表达显著降低，而显著增加SOCS-2和SOCS-3的mRNA和蛋白表达。结论酒精可下调肝细胞Ⅰ型干扰素（ IFN-α和IFN-β）和IRF-7的表达，上调负向调节因子SOCS-2和SOCS-3的表达，对宿主细胞天然抗病毒免疫造成损害，促进HCV复制，表明酒精滥用者肝细胞的固有免疫受损可能是HCV慢性感染增强以及IFN-α疗效降低的原因之一。
- 陈晖苏锦明李彧陈荣凤刘洁王敏连赵芳凝王洪曾锦荣
- 关键词：丙型肝炎病毒酒精固有免疫
- 阿片类物质使用与HIV-1原发性耐药的横断面研究及表型耐药检测假病毒的构建
- 第一部分:阿片类物质使用与HIV-1原发性耐药的横断面研究 目的:调查未经抗病毒治疗的Ⅰ型人类免疫缺陷病毒(HumanImmunodeficiency Virus typeⅠ，HIV-1)感染者体内HIV-1原发性耐药...
- 王洪
- 关键词：原发性耐药耐药检测
- 文献传递
- 2009-2012年广西HIV-1耐药状况调查被引量：6
- 2015年
- 目的调查2009-2012年广西HIV-1感染者的耐药状况，同时探讨耐药与亚型的关系。方法在广西各地随机募集HIV／AIDS患者，提取患者血液样本的HIVRNA，逆转录后扩增pol基因并测序，使用在线分析工具Genotyping结合MEGA 5．03软件进行亚型分型，使用斯坦福大学的HIV耐药数据库确定耐药突变位点及药物耐受情况。结果获得196份pol区序列，其中接受抗病毒治疗样本103例（52．55％），未经治疗样本93例（47．45％）；亚型分布为95例CRF01-AE（48．47％）、88例CRF08_BC（44．90％）、12例CRF07_BC（6．12％）以及1例B亚型（0．51％）；接受抗病毒治疗患者耐药率为10．68％，未经治疗患者耐药率为7．53％；在196例研究对象中发现低度耐药14例，中度耐药3例，高度耐药4例；1例针对核苷类逆转录酶抑制剂（NRTIs）和非核苷类逆转录酶抑制剂（NNRTIs）发生二重耐药；不同类型药物耐药结果：蛋白酶抑制剂（PIs）、NRTIs、NNRTIs及整合酶抑制剂（INs）相关耐药率分别为6．63％、3．06％、11．22％、8．67％；CRF01_AE、CRF07_BC和CRF08_BC亚型发生PIs相关突变的频率分别为6．32％、41．67％和2．27％；A71V／T在CRF07_BC毒株中出现最多（75％），E138A仅出现在CRF08_BC毒株中（100％）。结论广西HIV-1患者耐药发生率高于全国水平，不同亚型HIV-1流行株的耐药发生率不同。
- 刘洁梁冰玉周波王敏连赵芳凝陈荣凤王洪潘沛江蒋俊俊黄颉刚梁浩叶力
- 关键词：耐药性
- 2010~2012年广西壮族自治区HIV-1流行株pol基因亚型的分布情况被引量：9
- 2016年
- 目的分析广西壮族自治区（广西）HIV-1流行株poz基因亚型的分布情况。方法于2010年1月1日至2012年12月31日，采用方便抽样的方法，在广西11个城市开展调查，通过问卷调查收集调查对象的流行病学资料。纳入标准为：Westernblot确证HIV-1阳性、病毒载量〉1000拷贝／ml、〉18岁及无特殊重大疾病。共招募到调查对象152例。采集每例调查对象5ml外周血并提取病毒基因组RNA，采用巢式RT—PCR扩增病毒pol区全长基因并测序；对所得序列修正后用Genotyping进行初步分型；采用MEGA5．03软件构建系统进化树对pol序列分型进行验证；采用RIP及jpHMMatGOBICS程序分析未知重组毒株的重组断点。结果152例HIV-1感染者共成功扩增出137例pof区全长基因，共获得127例HIV一1亚型判定，其中CRF01_AE占55．9％（71例），CRF08-BC占29．9％（38例），CRF07-BC占10．2％（13例），B（B’）占2．4％（3例），未知重组型占1．6％（2例）。广西11个城市以CRF01-AE亚型流行为主；异性性传播和注射毒品传播感染HIV-1者间CRF01_AE亚型分布差异有统计学意义（X2=15．07，P〈O．001），其比例分别为67．4％（58／86）和34．1％（14／41）；21～35、36～60和〉60岁HIV．1感染者中，CRF01_AE亚型所占比例分别为43．6％（17／39）、57．6％（38／66）、77．3％（17／22），CRF_08BC亚型所占比例分别为43．6％（17／39）、28．8％（19／66）、9．1％（2／22），差异有统计学意义（X2=8．48，P=0．014）。2株未知重组型毒株的模式分别为CRF01_AE／B（B’）和CRF01_AE／C／B（B’）重组型。结论2010--2012年广西HIV-1流行株pol基因主要流行亚型为CRF01_AE，以异性性传播为主；出现的未知重组型毒株是由CRF01_AE与CRF_BC重组产生的。
- 王洪梁冰玉周波蒋俊俊黄颉刚陈荣风赵芳凝王敏连刘洁李汶蔚叶力梁浩
- 关键词：HIV-1基因
