童金苟 作品数:67 被引量:466 H指数:12 供职机构: 中国科学院水生生物研究所 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 国家重点基础研究发展计划 淡水生态与生物技术国家重点实验室开放课题基金 更多>> 相关领域: 生物学 农业科学 医药卫生 轻工技术与工程 更多>>
三个鲤品种微卫星丰度与遗传多样性分析 被引量:8 2013年 鲤(Cyprinus carpio)是世界上分布最广的淡水鱼类,由于地理隔离、突变、自然和人工选择等原因,在我国历史上形成了许多鲤鱼品种,如分布于江西省婺源县的荷包红鲤( Cyprinus carpio var. wuyuanensis)和兴国县的兴国红鲤(Cyprinus carpio var. singuonensis),它们都有近千年的养殖历史。这两个红鲤品种是我国优良的鱼类遗传育种材料,曾作为亲本生产了许多有较高经济价值的杂交种。 曾繁振 俞小牧 童金苟关键词:微卫星 丰度 基于mtDNA Cyt b基因全序列探讨岩扇贝与3种扇贝的遗传变异水平及其亲缘关系 被引量:2 2018年 为探讨新引进种岩扇贝Crassadoma gigantea与国内3种主要经济扇贝(虾夷扇贝Patinopecten yessoensis、栉孔扇贝Chlamys farreri和海湾扇贝Argopecten irradians)的遗传变异水平及其之间的亲缘关系,通过PCR扩增及测序获得4种扇贝的mtDNA Cyt b基因全序列,并对其序列组成、遗传多样性、遗传距离和系统发育等进行了分析。结果表明:4种扇贝的单倍型数、多态性位点数、单倍型多样性指数、核苷酸多样性指数和平均核苷酸差异数,分别在3~4、2~15、0.545~0.800、0.001 00~0.005 72和0.788~6.545之间,表现出较低的遗传变异水平;4种扇贝的种间遗传距离为0.255~0.429,其中,岩扇贝与虾夷扇贝的遗传距离最近(0.255),与海湾扇贝的遗传距离最远(0.429);系统进化树分析显示,岩扇贝与虾夷扇贝独自聚为一支,表明二者之间的亲缘关系较近。本研究结果将为岩扇贝的引种与养殖以及今后的遗传育种研究工作提供基础信息。 廖德杰 童金苟 曹善茂 周颖 俞小牧 付北德 刘阳 王潇关键词:线粒体DNA 细胞色素B 亲缘关系 一种用于翘嘴鳜亲子鉴定的SSR荧光标记引物及应用 本发明公开了一种用于翘嘴鳜亲子鉴定的SSR荧光标记引物及应用,本发明成功筛选并合成9对荧光标记微卫星引物,该引物可以用于建立翘嘴鳜亲子鉴定技术,并且公开了所使用的亲子鉴定的试剂盒。将所合成的不同荧光颜色的PCR产物混合后... 成为为 童金苟 杨凯 俞小牧 王青云 曾可为 付北德 夏儒龙 程颖红 邓国乔 郑翠华文献传递 鲤鱼不同品种(系)红血球抗原特异性的初步研究 1987年 用血球凝集和血清吸收试验的方法,对若干个鲤鱼品种及鲤鱼人工雌核发育系的红血球中的某些同种异型抗原纯合性进行了初步研究。①以抗雌核发育红鲤抗血清(abs/R)为试剂,三个雌核发育系(R_(8305),R_(8413),RMGF_1)的RBC反应值分别为1521—2360,1521—2028,853—1521,普通红鲤、镜鲤、白鲢的反应值在80—782。②abs/8305与abs/8413经靶细胞相互吸收后的残留活性显著降低(均为320),而以自鲢RBC吸收后抗血清活性不变。作者认为这部分抗原在鲤鱼种以下的品种和品系中具有特异性,可考虑将其作为鱼类品系鉴定的一种手段。 童金苟 陈荣德 吴清江关键词:鲤鱼 雌核发育 白鲢 镜鲤 红鲤 红血球 一种获得鳙性别特异分子标记及其筛选方法和应用 本发明公开了一种获得鳙性别特异遗传标记及其筛选方法和应用。筛选步骤包括:首先使用2b‑RAD技术对5雌5雄鳙鱼进行简化基因组测序,从中鉴定雄性特异序列。然后对其中一尾雄鳙进行基因组重测序与基因组组装,将雄鳙2b‑RAD特... 童金苟 刘海洋 付北德 俞小牧鱼类和水生动物基因组作图研究的现状及前景 被引量:15 2001年 童金苟 朱嘉濠 吴清江关键词:鱼类 水生动物 基因组作图 NPY和POMC基因在生长差异与饥饿再摄食鳙个体中的表达分析 2023年 为研究摄食促进基因和摄食抑制基因对鱼类生长调控和饥饿再摄食过程的影响,研究克隆了鳙神经肽Y(HynNPY)基因和前阿黑皮素原(HynPOMC)基因cDNA序列,采用qRT-PCR技术分析它们在生长显著差异鳙个体下丘脑、肠中的基因表达变化;设置对照组(连续投喂4周)、饥饿组、饥饿再摄食组,分析NPY和POMC在不同处理组鳙的下丘脑、肠中的基因表达变化。鳙NPY和POMC基因cDNA全长分别为839和799 bp,开放阅读框有291和657 bp,分别编码96和218个氨基酸。系统进化分析结果表明,鳙NPY和POCM基因具有高度保守性。鳙NPY在下丘脑的表达量最高,其次为肠和脑;POMC在肠道中的表达量最高,其次为下丘脑和肝脏。在相同环境下生长差异鳙个体的下丘脑和肠中,NPY在极大个体的表达量高于极小组个体,POMC在极小个体中的表达量高于极大个体。饥饿导致NPY在下丘脑表达上升,在肠表达量显著上升,恢复摄食后,NPY在下丘脑和肠中表达量下降;POMC在饥饿组下丘脑和肠中都表现为表达量呈显著上升,复投喂后POMC表达量逐步下降至接近对照组水平。肠组织学观察显示,极大个体的肠腔直径、肠绒毛长度、肠壁厚度均优于极小个体;饥饿胁迫导致的肠绒毛断裂、黏膜白细胞浸润等损伤能在再摄食后逐步恢复。研究结果表明,NPY促进摄取更多食物,POMC抑制食欲,二者共同参与鳙中枢神经和外周组织摄食调控,并可能通过影响摄食行为、营养吸收和GH分泌从而直接或间接调控鳙生长。研究结果对加深鳙生长调控分子机制的理解及遗传改良具有较大的理论和现实意义。 张一帆 高一凡 王俊如 俞小牧 张正 童金苟关键词:饥饿 基因表达 一种鳜性别特异标记的开发方法与应用 本发明提供一种鳜性别特异标记的开发方法与应用,包括如下步骤,(1)利用基于2b‑RAD技术的高通量测序方法获得雄性和雌性鳜特异短序列,所述雄性鳜特异短序列为SEQ ID NO.1;(2)利用高通量从头测序的方法获得雄性鳜... 周颖 童金苟 俞小牧 廖德杰 刘雪丽 付北德文献传递 三峡库区5个鲢群体遗传变异的微卫星分析 被引量:12 2015年 研究利用10个高度多态的微卫星标记对三峡水库秭归、巫山、云阳、忠县、木洞等5个库区鲢(Hypophthalmichthys molitrix)的野生群体进行了遗传多样性分析。检测到161个等位基因,群体共有等位基因84个,每个微卫星位点的等位基因数7—29不等。平均观测杂合度Ho为0.784—0.846,平均期望杂合度He为0.828—0.847,平均多态信息含量PIC为0.797—0.817。Fst值为–0.001—0.009,表明5个鲢群体间没有遗传分化。Hardy-Weinberg平衡检验表明巫山、云阳、木洞群体在一些位点上偏离遗传平衡。Bottleneck分析显示长江三峡库区江段的鲢群体可能在历史上经历了遗传瓶颈。5个群体间的遗传相似系数为0.891—0.950,遗传距离为0.050—0.115,根据Nei’s遗传距离所绘制的聚类图,表明鲢群体间的遗传距离与其地理距离基本一致。贝叶斯分析结果也证实三峡库区5个鲢群体可视为一个类群。尽管没有检测到遗传分化,数据清晰地表明三峡库区的鲢群体仍有很高的遗传多样性,研究结果为三峡地区和长江上游的鲢种质资源保护和种群评估提供了参考。 庞美霞 俞小牧 童金苟关键词:微卫星 野生群体 三峡水库 获得雌核发育鳙畸形性状相关分子标记的方法及其应用 本发明公开了一种获得雌核发育鳙畸形性状相关分子标记的方法及其应用。所述的分子标记由雌核发育鳙的2b‑rad简化基因组中得到,位于rgs7a基因的3’UTR中,该分子标记的核苷酸序列如SEQ ID NO:2所示,在该序列的... 罗微微 童金苟 俞小牧 王俊如 周颖