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唐凯临

作品数:17 被引量:20H指数:3
供职机构:同济大学生命科学与技术学院生物信息学系更多>>
发文基金:国家自然科学基金教育部“新世纪优秀人才支持计划”国家科技重大专项更多>>
相关领域:医药卫生生物学理学自动化与计算机技术更多>>

文献类型

  • 8篇期刊文章
  • 5篇会议论文
  • 2篇学位论文
  • 2篇专利

领域

  • 7篇医药卫生
  • 3篇生物学
  • 3篇理学
  • 2篇自动化与计算...
  • 1篇化学工程
  • 1篇环境科学与工...
  • 1篇文化科学

主题

  • 3篇药物
  • 3篇网络
  • 3篇疾病关系
  • 3篇核函数
  • 2篇得分
  • 2篇毒副作用
  • 2篇药理
  • 2篇治疗药
  • 2篇治疗药物
  • 2篇生物过程
  • 2篇中药
  • 2篇网络分析
  • 2篇纤维化
  • 2篇纤维化作用
  • 2篇抗肝纤维化
  • 2篇抗肝纤维化作...
  • 2篇化瘀
  • 2篇活血
  • 2篇活血化瘀
  • 2篇基因

机构

  • 14篇同济大学
  • 8篇上海生物信息...
  • 6篇华东理工大学

作者

  • 17篇唐凯临
  • 7篇曹志伟
  • 7篇叶浩
  • 6篇李通化
  • 5篇杨琳琳
  • 5篇陈开
  • 4篇李亦学
  • 2篇刘雪平
  • 2篇黄金艳
  • 1篇姚微佳
  • 1篇何园
  • 1篇叶立
  • 1篇张璐
  • 1篇张清晨
  • 1篇付鹏

传媒

  • 3篇科学通报
  • 2篇计算机与应用...
  • 1篇中华微生物学...
  • 1篇生物物理学报
  • 1篇华东理工大学...
  • 1篇2005中国...
  • 1篇2006年全...
  • 1篇第二十次全国...
  • 1篇第九届全国计...

年份

  • 1篇2017
  • 1篇2014
  • 6篇2012
  • 1篇2011
  • 1篇2008
  • 3篇2007
  • 2篇2006
  • 1篇2005
  • 1篇2002
17 条 记 录,以下是 1-10
排序方式:
多肽保留时间预测的研究被引量:2
2008年
多肽保留时间预测有助于提高多肽鉴别的可信度以及增加正确鉴别的数目。本文利用氨基酸保留时间之和,范德华体积以及辛醇-水分配系数对多肽保留时间进行预测,采用KPLS进行建模预报,经过交叉验证得到很好的预测结果。
唐凯临李通化陈开
关键词:多肽核函数
活血化瘀类中药抗肝纤维化作用的计算药理探讨被引量:5
2012年
如何防治肝纤维化是目前备受关注的问题,活血化瘀类中药治疗肝纤维化有良好的效果。研究发现,虽然活血化瘀类中药有效组分结构相似性不高,但是理化性质比较相似。与实验阶段药物和中药数据库中全部活性成分相比,活血化瘀类中药有效组分的化学空间分布更接近已知药物,约90%的有效组分符合Lipinski五规则。基于靶点蛋白作用通路的研究发现,活血化瘀中药通过直接作用或间接影响纤维化相关蛋白,并且多靶点多通路协同作用于多条生物路径,直接抑制TNF或间接调控NF-kappaB是其中典型的两条途径。这些研究结果可为阐明活血化瘀类中药的作用机制提供更多信息,有助于进一步筛选抗肝纤维化作用药物。
刘雪平杨琳琳付鹏唐凯临曹志伟
关键词:活血化瘀肝纤维化
一种基于生物过程预测药物新疗效的方法及应用
本发明涉及一种基于生物过程预测药物新疗效的方法,以疾病为导向,基于生物过程谱的药物-疾病关联性来预测药物的潜在的新治疗功能,包括以下步骤:(1)构建疾病生物过程谱以及药物生物过程谱;(2)在生物过程谱层面上计算药物-疾病...
曹志伟叶浩唐凯临李亦学
基于pathway谱对药物重定位的探讨被引量:6
2012年
新药开发一直面临着高投入低产出的困境.药物重定位(drug repositioning)是解决这一问题的有效方法,因而成为现今药物研究的热点之一.目前流行的方法主要是基于药物小分子的相似性或关联性(化学结构、副作用、表达谱和小分子-蛋白作用关系等),预测药物的新功能.由于仅仅依赖药物-药物之间的关系,这些新功能限制在现有药物的功能空间之内.本研究中提出一种以疾病为导向,基于pathway谱的药物-疾病关联性评估方法来预测药物的新功能.考虑到药物在临床应用中除了作用于预先设定的主要治疗靶点以外,还能作用于其他一些额外的靶点,而这往往是产生副作用或是新的治疗功能的原因.该方法充分利用药物的已有靶点信息,认为药物通过作用于多条疾病相关蛋白影响的pathway,达到调节疾病的病理过程的目的.以2010年全球最热销的8个药做测试,美国食品药品监督管理局(Food and Drug Administration,FDA)批准的主治功能排在前10的位置,超过60%的预测功能可以得到文献的直接支持.它可以作为以往方法的有效补充,为药物的重定位以及毒副作用评估提供一种新的视角.
叶浩杨琳琳曹志伟唐凯临李亦学
关键词:药理功能
基于靶基因比较microRNAs与HBV蛋白的作用模式被引量:1
2012年
乙型肝炎病毒(hepatitis Bvirus,HBV)感染是当前严重威胁人类健康的病毒性疾病之一.近年来许多研究证实microRNA(miRNA)可以介导宿主与病毒之间的相互作用,阐明miRNA在HBV感染中的作用有助于新型治疗策略的提出.然而,miRNA的多靶点特性限制了其功能研究.为了研究miRNA对HBV的调节机制,本文在靶基因水平上比较了HBV相关miRNA和HBV蛋白的功能谱、采用半定量手段进行分析并从网络层面挖掘其潜在作用模式.结果表明,在靶基因上,miRNA功能较为集中,HBV蛋白的作用效应可能更为广泛;在网络拓扑结构上,miRNA主要通过直接作用于HBV蛋白的靶基因及其邻居节点达到其调节作用;在生理效应上,miRNA在凋亡、细胞周期以及体液免疫的调节上呈现出拮抗HBV蛋白效应的趋势.本研究不仅为miRNA的功能研究提供了一种良好的方法,而且miRNA在HBV感染中的作用模式有助于今后基于miRNA的乙肝治疗方案的提出.
杨琳琳叶浩唐凯临曹志伟
关键词:乙肝MICRORNA靶基因GO网络
用于癌症诊断的基因芯片数据的降维和分类方法
基因芯片技术的发展,使生物医学领域的研究进入了崭新的时代。利用癌症病人样本制得的基因芯片,可将不同种类的癌症进行快速准确地分类,这对于癌症的早期诊断和及时治疗都有重要意义。本文既采用了经典的显著性检验方法 t 检验进行重...
姚微佳李通化唐凯临唐育虹陈开
关键词:基因芯片核映射自组织映射癌症诊断
文献传递
一种基于生物过程预测药物新疗效的方法及应用
本发明涉及一种基于生物过程预测药物新疗效的方法,以疾病为导向,基于生物过程谱的药物-疾病关联性来预测药物的潜在的新治疗功能,包括以下步骤:(1)构建疾病生物过程谱以及药物生物过程谱;(2)在生物过程谱层面上计算药物-疾病...
曹志伟叶浩唐凯临李亦学
文献传递
Kernel PLS用于多氯联苯气相色谱保留行为的预测
<正>多氯联苯是对人类健康和自然环境特别有害的持久性有机污染物之一,根据氯原子取代数目及位置的不同,由209个同系物所组成。对多氯联苯的检测和分析一直是环境分析的研究热点, 其中,对多氯联苯所有同系物在不同色谱条件下保留...
陈开李通化唐凯临
关键词:气相色谱有机污染物
文献传递
核方法在SELDI-TOF蛋白质组学数据分类中的应用(英文)被引量:1
2007年
高解析质谱目前应用于疾病分类和治疗,然而海量数据的分析却遇到相当大的挑战。本文使用结合预处理的Kernel-PLS方法,可用于SELDI-TOF蛋白质组学数据分类。留一法交叉验证得到了敏感性0.9833和特异性1.0000的结果。
唐凯临李通化陈开黄金艳
基于分子指纹相似性的药物-药物网络被引量:1
2012年
根据分子指纹相似性构建了FDA批准的小分子药物的药物-药物网络,结合药物ATC分类系统中定义的药物治疗功能信息,提出了一种基于网络的药物功能预测方法。预测了1 277个药物-治疗功能关系对,其中有59.44%得到了文献的证实;337个已知ATC分类的药物(占ATC药物的55.89%)的预测功能与已知功能相符;那些尚未有文献支持的药物-治疗功能关系对,很可能暗示了药物潜在的新功能。
叶浩唐凯临李亦学
关键词:分子指纹
共2页<12>
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