崔菁菁 作品数:4 被引量:8 H指数:2 供职机构: 中国海洋大学海洋生命学院 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 教育部“新世纪优秀人才支持计划” 山东省优秀中青年科学家科研奖励基金 更多>> 相关领域: 生物学 农业科学 更多>>
条斑紫菜基因组Fosmid文库构建 被引量:3 2009年 高分子量基因组文库是开展条斑紫菜基因组学研究的必备工具。构建了由23 040个Fosmid克隆组成的条斑紫菜孢子体无偏倚基因组文库。检测分析表明:文库克隆重组率为100%;插入DNA片段长度为28-40 kb,平均长度为35 kb,文库覆盖率约为条斑紫菜基因组的2.78倍;从超级池中筛查条斑紫菜18S rRNA、atpA、h2A、rbcL基因,至少能得到一个阳性克隆,印证了计算所推测的文库覆盖率;随机选取6个Fosmid克隆经100代传代后插入DNA片段未发生丢失或长度变化,表明克隆传代的稳定性。该文库的构建为开展条斑紫菜基因组特性分析和基因克隆奠定了基础。 茅云翔 崔菁菁 孔凡娜关键词:条斑紫菜 FOSMID文库 基因克隆 基因组学 植物特有的TDY类丝裂原活化蛋白激酶研究综述 被引量:3 2008年 丝裂原活化蛋白激酶(mitogen-activated protein kinase,MAPK),是一组可以被多种细胞外信号激活的蛋白丝/苏氨酸激酶,含有TDY基序的一类MAPK,在植物中存在,为植物所特有。它们有60~80个氨基酸的N端KD区,有些具有C端CD区作为MAPKK、磷酸酶和底物蛋白的停泊位点。TDY类MAPK功能主要与各种环境胁迫相关,如机械性伤害、紫外线胁迫、H2O2胁迫及重金属胁迫等。TDY类相对于其他MAPK在进化上是相对独立的,并且具有多个起源。 崔菁菁 刘玮关键词:MAPK 蛋白激酶 环境胁迫 极大节旋藻(Arthrospira maxima)生物钟基因kaiC的克隆及分析 被引量:1 2008年 以 kaiC 基因簇部分已知序列为引物设计位点,采用 PCR 反应池法从节旋藻基因组 fosmid 文库中筛选到 kaiC 基因克隆,通过步移测序获得了 kaiC 基因全长序列。kaiC基因编码区长1554 bp,基因 GC 碱基含量平均为41.76%,密码子第三位明显偏向于 U。在基因上游385 bp 范围内发现一个可能的启动子序列和一些基因调控元件。KaiC 蛋白分析发现了 Walker A、DXXG、不完整的 Walker B 等重要模体和具有催化作用的功能位点。Southern 杂交的结果证明 kaiC 基因在极大节旋藻中为单拷贝。极大节旋藻 kaiC 基因的特殊结构特征为研究 kai 基因簇的进化提供了重要的启示。 刘玮 茅云翔 凌娜 王孟强 崔菁菁关键词:节旋藻 生物钟基因 分子进化 条斑紫菜基因组FOSMID文库构建及MAPK基因克隆与表达分析 条斑紫菜(Porphyra yezoensis)由于具有较高的经济价值和科学研究价值,已经成为海洋生物学基础和应用研究的模式物种。本研究构建了由23040个fosmid克隆组成的条斑紫菜孢子体基因组文库。检测分析表明:文... 崔菁菁关键词:条斑紫菜 基因组文库 基因克隆 基因表达 文献传递