张菊
- 作品数:111 被引量:323H指数:9
- 供职机构:第四军医大学药学系药物基因组学教研室更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金国家高技术研究发展计划陕西省科技攻关计划更多>>
- 相关领域:医药卫生生物学自动化与计算机技术文化科学更多>>
- 模板指导末端延伸法检测内皮型一氧化氮合酶基因多态性研究被引量:4
- 2004年
- 焦凯江华张菊王香玲
- 关键词:内皮型一氧化氮合酶基因多态性研究ENOS基因TDI-FP
- 宫颈癌与HLA等位基因DQB1*03、DR15的相关性研究被引量:9
- 2004年
- 目的 :探讨我国陕西地区宫颈癌的发生与人类白细胞抗原 (HLA) DQB1 0 3、DR15等位基因的相关性 .方法 :采用序列特异性引物的聚合酶链式反应 (PCR SSP)方法 ,扩增HLA等位基因DQB1 0 3、DR15的目的DNA片段 (分别为 79、197bp) ,分析两对等位基因在陕西地区宫颈癌患者和正常人中分布频率的差异 .结果 :4 5名宫颈癌患者组中DQB1 0 3等位基因频率显著高于 5 0名健康对照组 ,DR15等位基因频率在两组中的分布无显著差异 .结论 :HLA等位基因DQB1 0 3可能与宫颈癌的发生具有相关性 ,DR15可能与宫颈癌的发生不存在关联 .
- 夏琳张菊陈中灿白玉杰罗进杨浩阎小君
- 关键词:宫颈肿瘤HLA抗原
- 乙肝治疗耐药基因突变的焦磷酸测序技术诊断被引量:3
- 2011年
- 目的:建立焦磷酸测序技术检测拉米夫定和阿德福韦酯治疗乙肝所致乙肝病毒基因耐药突变的定量检测方法,为临床乙肝耐药诊断和治疗提供依据。方法:针对乙肝病毒DNA聚合酶基因序列上4个常见基因突变位点的6种突变形式,分别克隆构建野生型和突变型质粒作为标准品,应用生物信息学手段设计目标基因通用PCR引物和各突变点的焦磷酸测序引物,建立焦磷酸测序的突变检测方法。对接受拉米夫定、阿德福韦酯治疗的慢性乙型肝炎患者血清标本进行检测。结果:构建了乙肝病毒四种常见耐药性突变的标准株和变异株克隆,建立了分别或同时检测拉米夫定、阿德福韦酯耐药突变的焦磷酸测序方法,对68例临床耐药或疑似耐药的患者血清标本进行检测,双脱氧测序验证,检出拉米夫定耐药突变32例,阿德福韦酯耐药突变5例,其中焦磷酸测序检出20例为混合突变,而双脱氧测序显示为6例。结论:成功建立了焦磷酸测序定量检测拉米夫定、阿德福韦酯耐药基因突变的方法,构建了乙肝病毒耐药基因突变的标准质粒,为临床动态监测乙肝病毒变异病毒株、指导合理用药奠定了基础。
- 汪钦郭晏海李勇年刘永兰包晗赵锦荣梁平雷小英张菊颜真
- 关键词:乙肝耐药基因焦磷酸测序阿德福韦酯
- PIK3CA基因突变的MassARRAY分子量阵列分析
- 2011年
- 目的:利用MassARRAY分子量阵列分析系统检测胃癌组织PIK3CA基因突变。方法:从胃癌石蜡包埋组织中提取基因组,PCR反应扩增目的基因片段,MassARRAY分子量阵列分析系统检测PIK3CA基因突变;焦磷酸测序验证检测结果。结果:中国西部地区144例胃癌组织样本中PIK3CA_E542K(1624G>A)突变携带率为77.6%,PIK3CA_E545K(1633G>A)突变携带率为84%。MassARRAY分子量阵列分析系统检测结果与焦磷酸测序结果达到100%吻合。结论:建立了MassARRAY分子量阵列分析系统检测基因突变的方法,初步建立了中国西北地区汉族人群胃癌组织PIK3CA基因PIK3CA_E542K(1624G>A)和PIK3CA_E545K(1633G>A)位点突变频数。
- 梁平赵锦荣惠延平孙建斌王伟汪钦包晗刘永兰金天博郭晏海张菊颜真
- 关键词:胃癌基因基因分型基因突变
- 荧光偏振检测血清中HBV多聚酶基因突变被引量:1
- 2003年
- 目的 建立简便、多重HBV多聚酶基因序列中拉米呋啶耐药性相关的基因突变的检测方法。方法 采用终点终止法和偏振光检测技术进行点突变的检测。对HBV多聚酶基因进行PCR扩增 ,然后用特异探针与扩增产物中待测核苷酸的下游序列杂交 ,使探针的 3′可以在DNA聚合酶的作用下 ,依据其互补链上的待测核苷酸连接上一个标有特定荧光素的ddNTP ,然后检测该 3′端带有荧光素的探针 ,根据检测到的荧光素种类和偏振光的强度判定待测点是何种核苷酸。结果 该方法可以检测出HBV多聚酶基因序列中特定位置的核苷酸类型 ,能检测 1× 1 0 1 个拷贝的模板量。对 30例经过 6个月以上拉米呋啶治疗的患者血清进行检测 ,检测出其中有 3例是甲硫氨酸 (M)密码子ATG中的A→G变异 ;2例是ATG中的G→C变异 ;1例是ATG中的G→T。
- 郭晏海吕贯庭赵锦荣张菊白玉洁闫小君
- 关键词:荧光偏振血清HBV多聚酶基因突变乙型肝炎
- 宫颈癌组织高危HPV18 L1基因的克隆及序列分析被引量:5
- 2006年
- 目的克隆和分析人乳头瘤病毒18型晚期表达基因L1序列,为HPV感染的检测和基因工程疫苗研制提供基础。方法采用PCR技术扩增了1例HPV18阳性宫颈腺癌患者癌组织中HPV18L1基因,并对其进行了克隆及全序列分析。结果本例宫颈癌临床标本HPV18L1基因与GenBank收录的原型比较有12个碱基变异,推导其编码的氨基酸也发生了变化。结论本例中国人宫颈癌HPV18L1基因有一定的变异。
- 高艳娥杨会平张菊郭金珠刘宁侠阎小君
- 关键词:人乳头瘤病毒18型L1基因宫颈癌
- 非小细胞肺癌患者外周血ERCC1单核苷酸多态性与顺铂化疗疗效的相关性被引量:8
- 2010年
- 目的:探讨非小细胞肺癌(NSCLC)患者外周血中ERCC1第118位密码子单核苷酸多态性(SNPs)及与顺铂化疗疗效的相关性。方法:应用荧光偏振(FP)法检测60例NSCLC患者外周血ERCC1118位密码子SNPs,并分析其与顺铂化疗疗效的关系。结果:ERCC1第118位密码子SNPs与NSCLC患者年龄(P=0.25)、性别(P=0.95)、吸烟史(P=0.75)、TNM分期(P=0.45)及组织学类型(P=0.70)无关。GP、NP、DP三种铂类基础化疗方案化疗疗效组间差异无统计学意义,P=0.99。ERCC1第118位密码子C/C基因型组的化疗有效率为48.6%(17/35),而变异型C/T+T/T有效率仅为20%(5/25),χ2=5.27,P=0.02。结论:ERCC1118位密码子SNPs与顺铂化疗疗效相关。
- 李晓惠蒋蔚峰张贺龙张菊
- 关键词:顺铂
- HPV6晚期表达基因L1的克隆并在杆状病毒表达系统的表达及其抗血清制备
- 2002年
- 目的 获得具有正确序列的人乳头瘤病毒 HPV6型晚期表达基因 L1 ,并获得其高活性表达 L1基因特异性抗血清 ,为进一步研究及临床检验应用奠定物质基础。方法 用 PCR法从感染人乳头瘤病毒患者尖锐湿疣组织中获得 HPV6晚期表达基因 L1 ,测序验证后 ,将正确的 HPV6晚期表达基因 L1序列 ,插入 Bac- to- Bac杆状病毒表达系统 ,转染昆虫细胞 Sf9,表达外壳蛋白 L 1 ,并以之作为抗原免疫兔 ,获得特异性抗血清。结果 获得了正确序列 HPV6晚期表达基因 L1 ,在 Bac- to- Bac杆状病毒系统活性表达并获得其特异性抗血清。结论 获得 HPV6晚期表达基因 L1 ,及有抗原活性的表达和相应抗血清。
- 张菊闫小君陈蕤赵锦荣段杰苏成芝
- 关键词:克隆抗血清
- 免疫金渗滤法检测Hp CagA抗体试剂盒的研制被引量:2
- 2002年
- 侯瑜张菊韩丰产阎小君
- 关键词:幽门螺杆菌细胞毒素相关蛋白A胶体金抗体
- 滴金法检测幽门螺杆菌细胞毒素相关蛋白A抗体试剂盒的研制及应用
- 2003年
- 目的 建立一种快速、简易的检测血清中抗幽门螺杆菌 (Hp)细胞毒素相关蛋白A(CagA)抗体的胶体金免疫渗滤法 (DIGFA)。方法 采用柠檬酸三钠还原法制备胶体金颗粒 ,标记葡萄球菌A蛋白 (SPA) ,将重组的CagA抗原固定于硝酸纤维素膜上 ,制成免疫渗滤试剂盒。血清中抗CagA抗体与试剂盒上金标记物及硝酸纤维素膜上的固相抗原结合后 ,形成肉眼可见的红色斑点。结果 用DIGFA与酶联免疫吸附试验 (ELISA)试剂盒对比检测了 32 6份血清标本中抗CagA抗体 ,本方法的特异性为 95 .8% ,敏感性为 97.3% ,两种方法符合率为 96 .6 %。结论 DIGFA检测血清中的抗CagA抗体特异性强、灵敏度高、简便快速 ,无需特殊仪器设备 。
- 侯瑜张菊李质馨田洪艳刘晓冬徐冶
- 关键词:幽门螺杆菌细胞毒素相关蛋白A抗体胶体金免疫渗滤法