杨淑慧
- 作品数：37 被引量：87H指数：5
- 供职机构：东北林业大学更多>>
- 发文基金：中央高校基本科研业务费专项资金黑龙江省自然科学基金公益性行业(农业)科研专项更多>>
- 相关领域：生物学农业科学轻工技术与工程经济管理更多>>
- 黑鹳微卫星位点的筛选及遗传特点分析被引量：4
- 2019年
- 黑鹳是重要的濒危物种,在我国动物园中已经建立了稳定的人工饲养种群,成为这一个物种的活体基因库。当前,该种群需要开展精准的遗传管理,微卫星是达到精准管理的重要遗传标记,但是,黑鹳的微卫星位点尚未有报道。本研究从白鹳、东方白鹳、林鹳和大蓝鹭4个物种中,选择29个扩增效果较好、具有多态性的微卫星位点,通过交叉扩增,测试在黑鹳的可用性。结果显示,共有18个位点能够成功扩增,其中1个位点( Cc01 )分型困难,10个位点( Cc05、Cc06、WSμ13、WSμ14、Cbo102、Cbo121、Cbo133、Cbo151、Cbo168和Ah208 )不具多态性,3个位点( Cc03、Cc37和 Cc42 )仅有2个等位基因,4个位点( Cc02、Cc04、Cc07、Cc10 )显示出较高的多态性,等位基因数( NA )为4—10个,多态信息含量( PIC )为0.497—0.784,都符合H-W平衡( P =0.088—0.601 )。可用于黑鹳的群体遗传学分析和遗传管理。上述结果表明,系统关系越近的物种之间,微卫星成功交叉扩增率越高,但位点的多态性取决于种群的进化历史,而与亲缘关系无关。
- 仲光启由玉岩徐艳春刘学锋刘学锋贾婷郭爱霞郭爱霞张丽霞
- 关键词：黑鹳微卫星
- 发情期蓝狐卵泡发育的显微结构观察(英文)
- 2012年
- [目的]对发情期蓝狐卵巢的组织结构和卵泡发育过程的变化进行研究.[方法]采集10只发情期蓝狐的左侧卵巢共计10枚，利用光学显微镜对卵巢的组织结构和卯泡的发育过程进行观察，同时利用目镜测微尺和显微照相技术分别对30个原始卵泡、30个初级卵泡、15个生长卵泡、15个囊状卵泡、15个成熟卵泡及各级卵泡中的卵母细胞进行测量和拍照。[结果]蓝狐卵巢由生殖上皮、白膜、皮质和髓质构成。皮质内分布着大量的间质细胞及不同发育阶段的卵泡，位于卵巢的外周；髓质位于皮质下层，分布着较多的血管。卵泡发育过程中，各级卵泡和卯母细胞的直径差异较大（卵泡为45．45～974．55μm，卵母细胞为30．23～147．27μm），在初级卵泡阶段出现透明带物质。卵泡闭锁发生于卵泡生长的各个时期，主要表现为卵母细胞的皱缩，细胞核固缩；颗粒细胞松散、退化。[结论]为揭示雌性蓝狐的生殖机理提供了组织学依据。
- 崔凯田明宇马泽芳梁玉颖李延鹏高善颂牛树田王海涛梁俊文杨淑慧
- 关键词：发情期蓝狐卵泡显微结构
- 兽毛形态结构功能的相关性与整体论的指导作用
- 在构建整体论作为指导毛皮学的方法论初步框架的基础上，通过在已有研究中所揭示的狍、马鹿、北极狐、黄鼬、豹猫等动物毛因生活季节、纬度和身体部位等差异所表现的功能形态学特征，以及毛的形态、结构与功能间的内在联系，反映了毛的形态...
- 张伟孙珠红徐艳春华彦杨淑慧
- 关键词：整体论
- 文献传递
- 微卫星复杂结构对分型的影响:以熊UamD116和UamB1为例被引量：2
- 2012年
- 目的:微卫星是基因组上的短串联重复序列,具有高度多态性,表现为核心序列中重复单位的重复次数的变化,这种变化造成不同等位基因核心序列的长度不同。因此,其基因型主要依靠PCR扩增片段长度来判定。在各类研究中,人们更倾向于使用4碱基重复的微卫星以减少2碱基微卫星的stutter等问题的影响。但是4碱基微卫星核心序列结构复杂时,就会对分型的正确性产生影响,从而影响到下游分析的正确性。在很多野生动物的研究中,这一问题常常被忽略。本文以亚洲黑熊(Ursus thibetanus)的2个四碱基微卫星位点UamD116和UamB1为例,揭示内部结构对分型的影响。方法:我们选用96份亚洲黑熊样品(包括血液、肌肉组织和毛发等样品)进行微卫星分型研究,通过荧光标记的PCR扩增和毛细管电泳分型,比较了基于扩增片段长度的分型和基于序列核心结构的分型效果的差异。结果:UamD116核心序列结构除了含有多种不同的重复单位外,还在重复单位之间有碱基插入,出现单碱基T、二碱基TC和三碱基AAG插入;并在一类等位基因下游侧翼序列有1个GA缺失。基于序列结构的分型中可以将不同的等位基因分开,而在基于片段长度的分型中,容易将不同的等位基因合并为1个等位基因。在位点UamB1共发现两种类型的等位基因,在一类等位基因中出现一个3bp的插入,使等位基因之间的差异不再是4bp,而是1bp。在仅依据片段长度分型时,相差1bp的等位基因被认定为1个。此外,还有不同等位基因核心序列不同,但是二者长度完全一致。依据片段长度分型共发现8个等位基因,而经过序列分型确定的等位基因数为12个,相应地基因频率及其他遗传学参数都发生相应的改变。结论:对于核心序列结构复杂的微卫星必须通过等位基因测序来矫正片段长度分型的结果,才能得到可靠的群体遗传学结论。
- 张小芳杨淑慧马跃徐艳春宋伟杰
- 关键词：微卫星亚洲黑熊
- 水解单宁酸对育成期仔貉腹泻指数、腹泻率和生长性能的影响被引量：4
- 2018年
- 貉子是食肉目犬科貉属的动物，其毛皮绒厚，柔软美观，是我国所特有的珍贵毛皮动物饲养品种，在我国有较大的饲养量。育成期是决定体型大小的关键时期，仔貉随着日龄增加，采食量逐渐提高，
- 苗芷若苗芷英魏来杨淑慧
- 关键词：育成期仔貉单宁酸腹泻率水解毛皮动物
- 鹿类微卫星遗传标记的研究现状(英文)被引量：5
- 2001年
- 微卫星DNA在染色体上随机即分布，是十分有效的遗传标记。目前，在鹿类发现约有200 多个微卫星位点，除了极少数位点是直接从DNA文库中筛选的以外，绝大多数都是将牛、羊 的微卫星位点“借用”到鹿类。这些位点被广泛应用到父权鉴定、遗传多样性和种群结构分 析、种群基因渗入的检测、孕期长短及越冬存活率等的遗传标记等方面的研究中。然而，微 卫星DNA的数量目前还远不能满足研究需要。将来要在以下方面开展工作：1）分离更多的鹿 类特异的微卫星位点，2）构建微卫星位点的遗传和物理图谱。这样，微卫星DNA才能在鹿类 研究中发挥更大的作用。
- 徐艳春潘紫辰许志茹杨淑慧金煜白素英
- 关键词：鹿科动物微卫星
- 黑斑侧褶蛙Temporin基因内含子在PCR扩增、克隆和Sanger测序过程中的复制跳跃
- 2018年
- 利用DNA聚合酶进行DNA体外复制时,模板上的多种回文结构可能导致复制跳跃,表现为较大的片段缺失。本文在研究黑斑侧褶蛙抗菌肽Temporin基因结构时,对一个1126 bp的内含子片段进行PCR扩增、扩增产物的T-A克隆和Sanger测序,在这3个阶段都遇到了在同一位置出现564 bp的缺失。根据实验数据和文献报道,我们推测这一复制跳跃的产生与一段6 bp的同向重复单元有关,并提出跳跃可能发生的机制:模板上两个重复单位下相互靠近,形成特定的高级结构,使DNA聚合酶脱落下来,新链延伸被阻断。下一个循环中新链的第一个重复单位与模板第二个重复单位互补配对并退火,形成引物,DNA聚合酶结合后继续延伸,形成缺失的PCR产物。这一发现显示,复制跳跃不仅可以发生在PCR和Sanger测序等体外复制过程中,而且可以发生在细菌体内质粒复制的过程中。如果研究中不能准确判定跳跃的发生,DNA上丢失一个片段就会被误读为新的等位基因。
- 崔杰林煜徐艳春杨淑慧
- 关键词：聚合酶链式反应克隆黑斑侧褶蛙
- 利用肝脏指数鉴别人工饲养和野生王锦蛇的研究被引量：1
- 2018年
- 蛇类养殖可以缓解野外资源的开发压力,起到积极的保护作用。但是从野外非法捕捉的蛇类以人工养殖之名混入合法市场的现象也十分常见。由于缺乏有效鉴别野生和人工饲养蛇类的方法,给监管市场和打击盗猎、非法贩卖等违法犯罪行为带来困难。本研究以养殖量和盗捕量较大的王锦蛇为例,建立了肝-头指数(I_(lh))和肝-体指数(I_(lb))两个肝脏指数来鉴别野生和人工饲养蛇类。利用这两个指标,采用Fisher's判别将已知来源的个体进行来源回判时,两个指标的正确判别率相同,在野生组均为96.9%,饲养组均为74.1%,整体正确率为86.4%。但是两个指标在野生组和饲养组都有显著的性别差异,而且饲养组的雄性与野生组的雌性数值比较接近,当这两组同时进行判别时,I_(lh)和I_(lb)对饲养组雄性的错判风险均高达36.4%。但是,在性别明确时,I_(lh)对野生和饲养的雄性判别正确率在野生组为100%,饲养组为90.4%,整体达到94.1%,对于两组雌性判别正确率野生组依然达到100%,饲养组为81.3%,整体92.9%。I_(lb)的情形与Ilh也是一致的,同一性别的正确判别率高达90.5%(雌性)和94.1%(雄性)。因此,在实际应用中最好有性别信息。这两个指标测量方便,适用完整和不完整的死体鉴别,也可能适用于其他蛇类。
- 林煜田静茹崔杰李力徐艳春杨淑慧
- 关键词：王锦蛇
- 毛干DNA提取中四种细菌清除方法的比较研究
- 2020年
- 毛发(无根)作为一种非损伤性的生物样本,在保护遗传学和分子生态学研究中发挥着十分重要的作用。以毛干中提取的DNA为模板做PCR扩增时,mtDNA片段扩增效果较好,但核基因的扩增成功率极低。人们将其归因于核DNA质低量少所致。然而我们在前期研究中发现,从毛干中得到的总DNA混有大量的细菌DNA,是导致核基因扩增困难的主要因素之一。为此我们尝试建立一种高效、快速、低成本,而且不影响DNA提取的清除毛干细菌的方法。本研究以蓝狐被毛为材料,经过普通清洗后,以4种方法处理毛干,随后使用磁珠法进行总DNA提取,并通过荧光定量PCR检测总DNA中细菌DNA的含量,以此评估4种方法的有效性。结果表明,未经处理的毛干(V#1—V#3样本)总DNA中,mtDNA和细菌pDNA的Ct值分别为(15.53±0.15)和(16.82±0.03),二者的比值为(0.923±0.009)。以SDS和NaOH(方案I)、溶菌酶(方案II)和triton X-100(方案III)处理的毛干样本,细菌DNA的含量没有明显降低。用65℃的4 mol/L NaOH溶液处理毛干样本20 s(方案IV),可把pDNA的拷贝数降低近1000倍,而动物DNA的拷贝数没有明显降低。延长处理时间至35 s以上会降低DNA的提取效果甚至提取失败。因此,我们推荐在提取毛干总DNA之前,采用方案IV处理毛干样品。
- 周永恒马跃崔靓玉徐艳春徐艳春
- 关键词：DNA提取细菌DNA
- 一种高效的提取毛干中DNA的方法
- 一种高效的提取毛干中DNA的方法,属于分子生物学技术领域。为了提高毛干DNA回收效率，减少色素等污染物对下游实验的干扰，扩大毛干适用范围，本发明用1％SDS和4M NaOH溶液处理样本，然后按一定比例加入SDS、DTT、...
- 徐艳春周永恒杨淑慧
- 文献传递
