焦典
- 作品数：4 被引量：1H指数：1
- 供职机构：东南大学生物科学与医学工程学院更多>>
- 发文基金：江苏省自然科学基金国家自然科学基金国家高技术研究发展计划更多>>
- 相关领域：生物学医药卫生自动化与计算机技术更多>>
- 基于特征的基因组序列数据库的搜索方法
- 基于特征的基因组序列数据库的搜索方法，是一种根据序列的统计特征在数据库范围内搜索近似序列的方法搜索方法为：根据序列统计特征间的距离来搜索相似序列，即把不同物种的基因组序列数据的基本信息——即序列在基因库的数据库登录号、序...
- 孙啸焦典
- 文献传递
- 基于特征的核酸序列数据库搜索系统被引量：1
- 2006年
- 随着后基因组时代的到来,建立生物数据库并且在其上开发各种分析工具进行数据分析和挖掘,已经成为了生物学研究的一种新方法。目前国际上流行的通过序列比对搜索相似序列的方法主要是针对短的序列,将这样的方法应用于大规模基因组序列时搜索速度很慢。针对基因组序列搜索的特点,从提高序列搜索效率出发,提出了一种新的、速度更快的搜索方法,其核心是通过序列特征的分析和比较搜索相似序列。在此基础上,建立了基于特征的序列数据库搜索系统,并利用序列的碱基关联性特征搜索人类基因组序列,结果表明,新搜索方法具有较高的命中率,并且搜索速度非常快,适合于大规模基因组序列的搜索。
- 焦典顾珉傅静李石法谢建明孙啸
- 关键词：基因组数据库
- 基因组序列特征分析
- 随着后基因组时代的到来，建立生物数据库并且在其上开发各种分析工具进行数据分析和挖掘，已经成为了生物学研究的一种新方法。 我们讨论的序列特征分析主要目的是为了序列的比较，传统的基于比对的序列比较方法由于受到其算法本身的限制...
- 焦典
- 关键词：基因组序列生物数据库水平基因转移生物进化
- 文献传递
- 利用序列统计特征分析基因组序列
- 本文从一个新的角度来分析DNA序列，探索DNA序列的统计特征，研究基于特征的序列分析方法。利用序列的两个统计特征，即核苷酸单词频率特征(WF)和碱基关联性特征(BBC)，分析基因组序列，发现核苷酸单词频率特征可用于辨别基...
- 孙啸傅静焦典胡弘周士新谢建明
- 关键词：生物信息学
- 文献传递
