王慎骄
- 作品数：47 被引量：328H指数：10
- 供职机构：江苏省疾病预防控制中心更多>>
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- 相关领域：医药卫生农业科学生物学轻工技术与工程更多>>
- 2011年苏州地区诺如病毒GⅡ组变异株的分子特征研究被引量：7
- 2013年
- 目的了解苏州地区诺如病毒的感染状况及其变异株的分子特征。方法收集苏州市儿童医院疑似病毒性腹泻粪便标本419例，采用荧光定量PCR方法检测粪便中诺如病毒RNA及其基因组别，并对部分阳性标本测序分析。结果419份粪便标本中，GⅡ组诺如病毒为122例，阳性率为29％，未检测出GI组诺如病毒，对本地区部分诺如病毒阳性标本进行测序，A区（RdRp区）测序的25份GII标本中25株均为G11．4型；C区（N-s区）测序的26份G11标本中17株为GII．4型，8株为GⅡ．3型，1株为G11．2型；D区（P区）测序的25份GII标本中16株为G1I．4型，9株为GⅡ．3型。结论诺如病毒是本地区婴幼儿病毒性腹泻的重要病原体，以诺如病毒GII．4-2006b亚型为主，此外发现有Gtl．4-2010亚型（GII．4NewOrleans株）的流行，这是国内首次对该亚型毒株进行报道，同时还检测到部分重组毒株，提示诺如病毒在本地区的遗传变异日趋复杂。
- 付建光嵇红单军王慎骄李志锋靳淼刘成秦圆方田华鲍倡俊朱叶飞汤奋扬祁贤
- 关键词：诺如病毒分子特征
- 江苏省首例人感染H9N2禽流感病毒分子溯源研究被引量：5
- 2021年
- 目的近年来,H9N2亚型禽流感对人类健康的危害越来越受到关注。文中旨在对1例人感染H9N2禽流感病毒进行分子溯源研究。方法选取2019年3月18日江苏省疾病预防控制中心1份禽流感病毒感染患者的咽拭子标本及从患者住处附近的农贸市场采集禽类和外环境样本共40份。标本的流感病毒分型检测采用荧光定量PCR法,病毒分离采用SPF鸡胚,用特异性引物对病毒分离物进行全基因组测序,利用Blasts、ClustalX和Mega 6.1等软件进行序列比对和系统进化分析。结果标本中的病毒为A型H9N2亚型流感病毒。分子进化分析表明,4株病毒的HA和NA都属于H9N2禽流感Y280-like基因型。HA和NA进化树显示,人分离株和3株农贸市场分离病毒同处于一个进化分支上,遗传关系较近。HA蛋白的受体结合位点有4个氨基酸位点(包括I155T、H183N、A190T/V和Q226L)发生突变,增强了病毒对人类SAα2-6Gal受体的结合力。NA蛋白274(H→Y)位点没有发生突变。结论江苏省首例人感染H9N2禽流感病毒属于Y280-like基因型,对人类SAα2-6Gal受体的亲和力增加,跨种传播感染人的能力增强,病毒的进化值得关注。
- 邓斐祁贤余慧燕王慎骄许可黄昊頔鲍倡俊
- 关键词：禽流感病毒H9N2亚型
- 江苏省苏州及南京地区2010年婴幼儿腹泻中诺如病毒分子流行病学研究被引量：9
- 2011年
- 目的 了解江苏地区婴幼儿腹泻患者中诺如病毒的感染情况,明确该地区诺如病毒的主要基因型别和流行病学特征.方法 收集2010年江苏省苏州市婴幼儿医院及南京市婴幼儿医院疑似病毒性腹泻粪便标本498例,采用荧光定量PCR方法检测粪便中诺如病毒RNA及其基因组别,并对部分阳性标本测序以明确基因型.结果 498份粪便标本中,GⅠ组诺如病毒阳性标本为2例,阳性率为0.4％,GⅡ组诺如病毒为190例,阳性率为38％,对本地区部分诺如病毒阳性标本进行测序,2份GⅠ标本中,一株为GⅠ1型,另一株为GⅠ3型；测序的23份GⅡ标本中21株为GⅡ4型,2株为GⅡ3型.结论 诺如病毒是本省婴幼儿病毒性腹泻的重要病原体,以诺如病毒GⅡ4型为主,同时也存在其他型别的感染流行.
- 付建光吴斌嵇红李亮祁贤秦圆方王慎骄邓斐李志锋汤奋扬祖荣强鲍昌俊
- 关键词：诺如病毒基因型系统进化树
- 江苏省2013年甲型H1N1(09pdm)流感病毒血凝素和神经氨酸酶分子特征分析被引量：14
- 2015年
- 目的 ：分析江苏省2013年甲型H1N1（09pdm）流感病毒血凝素（hemagglutinin,HA）和神经氨酸酶（neuraminidase,NA）变异情况,分析其遗传进化特征。方法 ：按照流感样病例定义,收集江苏省各哨点医院流感样病例标本,阳性样本经病毒分离培养及亚型鉴定。选取2013年不同时间段、不同地区具有代表性的14株甲型H1N1（09pdm）阳性毒株,利用特异性引物扩增HA、NA基因,测序并分析其遗传进化特征。结果 ：14株分离毒株与疫苗株A/California/07/2009（H1N1）的HA基因核苷酸和氨基酸同源性分别为97.6%~98.4%和96.5%~98.0%。NA基因核苷酸和氨基酸同源性分别为98.4%~98.9%和97.0%~98.5%。遗传进化分析表明,14株分离株HA和NA基因分属于不同的进化谱系。分子特征表现为HA氨基酸序列出现D114N、K300E、E516K的变异,NA分子特征表现为N44S位点变异。从2013年左右开始甲型H1N1（09pdm）流感基因多样性增加;通过FEL模型得到一个正向压力选择HA氨基酸位点310,一个正向压力选择NA氨基酸位点4,通过REL模型得到9个正向压力选择HA氨基酸位点179、180、239、301、303、310、311、312、313（含位点310）,5个正向压力选择NA氨基酸位点4、23、52、287、374（含位点4）。HA蛋白具有9个潜在糖基化位点,7个位于HA1上,2个位于HA2上;NA蛋白共有9个潜在糖基化位点。14株分离毒株在NA蛋白酶活性中心及周围辅助位点上均未发现变异。结论：2013年江苏省甲型H1N1（09pdm）流感HA、NA基因变异加快,遗传多样性增加,未来的遗传进化值得进一步关注。
- 资海荣郭艳邓斐余慧燕王慎骄汤奋扬祁贤卫平民
- 关键词：血凝素神经氨酸酶分子特征
- 1例人感染H7N4禽流感病毒分子溯源研究被引量：5
- 2018年
- 目的 对1例人感染H7 N4禽流感病毒进行分子诊断和溯源.方法 通过荧光定量PCR法对标本进行流感病毒分型检测.在下一代测序平台上对原始标本和病毒分离物进行全基因组测序,利用BLASTs、ClustalX和MEGA 6.1等软件进行序列比对和系统进化分析.结果 2018年1月检测到1例人感染H7 N4亚型禽流感病毒病例.从患者家养的鸡鸭中分离到7株高度同源的病毒.病毒是一种新的基因重配H7 N4亚型禽流感病毒,其8基因节段来源于欧亚大陆的野生水禽.病毒HA蛋白的裂解位点含有1个碱性氨基酸精氨酸（R）,属于低致病性禽流感病毒.HA蛋白的受体结合位点226-228位氨基酸是谷氨酰胺-丝氨酸-甘氨酸（Q-S-G氨基酸排序按照H3亚型HA序列）,保留了对禽类受体 α2-3半乳糖苷唾液酸（SAα2-3Gal）的结合活性.与禽分离病毒PB2蛋白627E不同,人病毒的PB2蛋白627位氨基酸为赖氨酸（K）,增强了该病毒对人的适应力.结论 报道了一起人感染H7 N4禽流感病毒病例,揭示中国南方庭院式养殖模式为禽流感病毒的跨种传播提供了便利.
- 邓斐彭杰夫崔仑标祁贤王慎骄余慧燕许可霍翔鲍倡俊
- 关键词：禽流感病毒
- 江苏省肠道病毒71型分离株的分子遗传演化特征被引量：3
- 2011年
- 肠道病毒71型（EV71）是小RNA病毒科肠道病毒属成员,其感染主要引起患者手足口病（handfoot-mouth disease,HFMD）,个别患者可引起无菌性脑膜脑炎等并发症.自1998年EV71在中国台湾暴发以来,EV71病毒在亚洲的流行呈上升趋势.流行病学资料表明,不同地区不同症状的EV71病毒性疾病的暴发可能与毒株间的差异等因素有关[1].为了解EV71病毒的遗传和变异特征,本实验室对2009年在江苏手足口病流行地区分离到的一株EV71型病毒株（Jiangsu01,GenBank：FJ600325.1）的基因组核苷酸序列进行了遗传进化分析,从分子水平为EV71病毒的流行以及所致疾病的防控提供理论基础.
- 吴斌闫强汤奋扬李亮徐飞海葛胜祥崔仑标王慎骄付建光田华秦圆方邓斐祁贤朱凤才羊海涛汪华
- 关键词：肠道病毒71型分子遗传分离株EV71病毒小RNA病毒科无菌性脑膜脑炎
- 新冠病毒感染者病毒RNA脱落时间的影响因素研究
- 2023年
- 目的了解新冠病毒感染者病毒RNA脱落时间与病毒单核苷酸突变和感染者人口、基础疾病等因素的关系,为新冠病毒感染动力学的研究提供更多线索。方法收集江苏省2021年7月至9月暴发的一起新冠肺炎聚集性疫情感染者流行病学、临床表现、基础疾病等资料,采集病例鼻咽拭子样本,采用二代测序技术对样本进行病毒全基因组测序。利用在线分析平台判断病毒型别、分析突变位点,利用Cox比例风险模型分析新冠病毒RNA脱落时间与各研究因素的关系。结果本起新冠疫情最终获得病毒全基因组序列的人员350例,其中女性占60.3%,年龄中位数49岁[四分位数间距(IQR,37~65岁)],中位病毒RNA脱落时间33天(IQR,26~44天)。全基因组测序分析显示,同武汉参考株序列相比,感染者序列存在34~41个核苷酸突变位点,属于VOC/Delta变异株(B.1.617.2进化分支),C346T、C1060T、T2803C、T7513C、A29681C为本起疫情350例病例新冠病毒基因组序列主要单核苷酸变异位点(SNP)。单因素Cox回归分析显示,年龄、基础疾病、临床分型、疫苗接种情况、SNP T2803C和T7513C对新冠病毒RNA的脱落时间存在影响;调整后的多因素Cox回归结果显示,年龄[HR=0.73,95%CI(0.55,0.95)]及T7513C[HR=0.37,95%CI(0.18,0.77)]仍然是新冠病毒RNA脱落时间延长的危险因素。结论本研究从病例个体因素和病毒单核苷酸变异两个角度分析了对病毒RNA脱落时间的影响,发现年长、患有高血压、较重临床症状、未接种或未全程接种疫苗,感染病毒存在T7513C突变者,存在新冠病毒RNA脱落时间较长的风险,应给予重点关注和康复后随访。
- 邹鑫许可戴启刚付建光丁松宁王寅王慎骄黄昊頔胡建利周扬霍翔尚庆香鲍倡俊
- 关键词：新型冠状病毒突变
- 一种生物实验室门脚踏式感应开关
- 本实用新型涉及一种生物实验设备，尤其涉及提供一种生物实验室门脚踏式感应开关，包括壳体、感应器、挡板，所述的感应器位于壳体两侧，所述的壳体开口处设有挡板；所述的壳体内部接口处边角为圆弧形，所述的壳体外部底部为漫弯形。可以避...
- 余慧燕祁贤邓斐王慎骄霍翔鲍昌俊汤奋扬
- 华东地区高致病性H5N6禽流感病毒血凝素蛋白分子特征分析被引量：5
- 2021年
- 目的分析2017年以来中国华东地区高致病性H5N6禽流感病毒的HA基因分子特征。方法 H5N6核酸阳性标本采用9~11日龄鸡胚进行病毒分离,病毒基因测序采用下一代测序技术,相关的参考序列下载自GISAID或NCBI网站,序列比对和进化树构建采用ClustalX、Blasts及Mega 6.1等生物信息学软件。结果 2017年以来,在江苏省活禽市场和禽流感患者的标本中,成功分离出43株H5N6禽流感病毒,对33株病毒进行了基因组测序。选择其中的27株H5N6病毒的HA基因进行分子进化分析,clade 2.3.4.4h有20株,clade 2.3.4.4e有3株,另外4株归类于clade 2.3.4.4b;多个碱性氨基酸出现在病毒HA蛋白的裂解位点,是高致病性禽流感病毒的典型分子特征;HA蛋白受体结合位点的222和224位氨基酸分别是Q和G,具有结合禽类受体α2-3半乳糖苷唾液酸(SAα2-3Gal)的特性,158位点糖基化位点丢失,但新的糖基化位点出现在124位点上。结论 2017年HA基因clade 2.3.4.4h是我国华东地区H5N6病毒优势基因型,病毒处于持续动态进化中,需要继续对病毒进化进行监测。
- 程晓庆祁贤余慧燕王慎骄黄昊頔许可鲍倡俊
- 关键词：高致病性禽流感病毒血凝素分子特征
- 2017年江苏省H3N2流感病毒血凝素与神经氨酸酶分子特征及耐药性分析被引量：9
- 2019年
- 目的流行性感冒(简称流感)耐药性监测目前已成为流感防控中的一项重要组成部分。文中旨在分析江苏省2017年H3N2亚型流感病毒基因变异及耐药性情况。方法从江苏省13个流感监测点流感毒株中选取17株H3N2亚型毒株,其中12株为2017年夏季高峰期分离株,4株为非高峰期分离株,1株为2016年度分离株(作为1株参考株)。采用逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)对H3N2亚型流感毒株进行序列测定,从全球共享流感序列网站GISAID下载构建甲型H3N2亚型流感毒株HA(血凝素)系统进化树的骨架参考序列,使用MAGE7.0软件进行序列比对和系统进化分析。通过神经氨酸酶(NA)抑制试验,分析病毒耐药情况。结果16株病毒HA和NA基因核苷酸相似性分别为98.9%~99.6%、99.2%~99.3%,同源性较高。HA进化树分析显示,16株分离株中15株位于3C.2a分支,13株病毒3个C3.2a1分支关键位点(N171K、I406V和G484E)未发生变化,另外3株毒株关键位点发生变异,1株毒株发生该标志性氨基酸变异,1株毒株发生(N121K、T135K)的免疫相关突变。与2017-2018年度疫苗株推荐株A/HongKong/4801/2014相比,16株分离株抗原位点突变包括:A138S 1株,R142K 2株,R142K、R261Q 9株,R142KS144R、R261Q 1株,R142K、S144K、R261Q 1株。16株病毒的NA片段分析未发现NA耐药位点。基因型和表型分析表明,16株H3N2亚型流感毒株对抗流感药物奥司他韦及扎那米韦均敏感,均发现与M2基因耐药有关A30T、S31N分子位点的改变。结论2017年江苏H3N2亚型流行株HA和NA基因表现出异质性特点及发生基因重配现象,随着H3N2流感病毒变异持续发生,应密切监测病毒遗传进化和耐药基因的变化情况。
- 王慎骄祁贤邓斐彭杰夫余慧燕秦圆方戴启刚鲍倡俊
- 关键词：流感病毒H3N2亚型血凝素神经氨酸酶基因特性耐药性分析
