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6-(1-萘甲基)取代S-DABO类逆转录酶抑制剂的3D-QSAR研究被引量：6: 2013年; 以活性化合物15为例,采用分子对接的方法模拟了化合物与HIV-1逆转录酶的作用,从而探讨了系列6-萘甲基取代S-DABO类化合物的作用机制.并基于分子对接后的活性构象,应用比较分子力场分析(CoMFA)和比较分子相似因子分析(CoMSIA)法对该类化合物的三维定量构效关系进行了研究,建立了有较好预测能力3D-QSAR模型,为该类化合物进一步的结构优化提供理论指导.; 王月平陆礼和刘小蜂武道春何严萍; 关键词：分子对接比较分子力场分析

丝氨酸及苯基异丝氨酸类SARS病毒3CL蛋白酶抑制剂HQSAR研究及分子设计被引量：2: 2021年; 采用分子全息定量构效关系(Holographic Quentitative Structure-Activity Ralationship,HQSAR)方法,研究了40个丝氨酸及苯基异丝氨酸类SARS-CoV 3CL蛋白酶抑制剂的构效关系,探讨了分子碎片大小、碎片区分参数及全息长度对模型质量的影响.利用偏最小二乘法建立了一个以30个化合物为训练集的最优模型,其交叉验证相关系数q^(2)为0.604,非交叉验证相关系数r^(2)为0.904,标准偏差SEE为0.125;使用该模型对由9个化合物组成的测试集进行预测,其预测相关系数r^(2) pred为0.723,表明该模型具有良好的预测能力及拟合能力.利用HQSAR色码图探讨了分子中不同结构片段对活性的贡献,在此基础上根据最优HQSAR模型设计了一组具有良好预测活性的苯基异丝氨酸类3CL蛋白酶抑制剂,为新型SARS-CoV 3CL蛋白酶抑制剂的设计和优化提供了参考,也为研发治疗新型冠状病毒肺炎(COVID-19)的3CL蛋白酶抑制剂提供借鉴.; 何安朕张继川何严萍王月平; 关键词：冠状病毒分子设计

苯基氨基吡啶派生物类非核苷类HIV-1逆转录酶抑制剂HQSAR研究及分子设计被引量：1: 2016年; 采用分子全息定量构效关系(HQSAR)方法,研究了21个HIV-1逆转录酶抑制剂苯基氨基吡啶派生物(Phenylaminopyridine,PAP)类化合物的构效关系;探讨了碎片区分参数、分子碎片大小和分子全息长度对模型质量的影响;建立了一组以16个化合物为训练集的最优模型,其交叉验证相关系数q^2为0.801,非交叉验证相关系数r^2为0.963,标准偏差为0.363;对5个化合物构成的测试集进行了预测,其相关系数r_(pred)~2为0.92,表明该模型具有良好的预测能力。最后,通过HQSAR模型色码图对PAP类化合物的活性起重要作用的片段与结构进行了讨论,并根据HQASR最佳模型图设计出了20种PAP派生物类化合物,这些化合物理论上均具有较好的抗HIV-1活性,为PAP派生物类化合物的进一步合成提供理论指导。; 杨军锋赵智东鲁静王月平何严萍; 关键词：HIV-1逆转录酶抑制剂分子设计

5-羧基苯并咪唑类HCV NS5B聚合酶抑制剂的HQSAR研究及分子设计被引量：3: 2017年; 利用分子全息技术研究了129个5-羧基苯并咪唑类HCV NS5B聚合酶抑制剂的结构与活性之间的关系.讨论了分子碎片大小、碎片区分参数及全息长度对模型质量的影响.利用偏最小二乘法(partial least square,PLS)建立了一组以99个化合物为训练集的最优模型,该模型的交叉验证相关系数q^2=0.820,非交叉验证相关系数r^2=0.963,标准偏差SEE=0.213;用最优模型对由30个化合物组成的测试集进行预测,得到其相关系数r_(pred)~2=0.98,表明了该模型具有良好的预测能力及拟合能力.利用色码图对模型中不同原子及不同结构的贡献进行了解释,在此基础上根据最优HQSAR模型设计了几种具有良好抗HCV活性的苯并咪唑类HCV NS5B聚合酶抑制剂分子,为新型HCV NS5B聚合酶抑制剂的设计和优化提供了参考.; 王子恒陈娴张玉芳王月平何严萍; 关键词：HCV 分子设计

S-DABO类非核苷类HIV-1逆转录抑制剂HQSAR被引量：6: 2013年; 采用分子全息定量构效关系(HQSAR)方法,研究了34个HIV-1逆转录酶抑制剂S-DABOs类化合物的结构与活性之间的关系.讨论了分子碎片大小、碎片区分参数以及分子全息长度对模型的影响.以26个化合物构成的训练集所建最优模型的交叉验证相关系数q2为0.755,相关系数r2为0.949.对8个化合物构成的测试集进行了预测,其预测相关系数r2pred为0.95,表明所建模型不仅有较高的拟合能力,还有良好的预测能力.最后,利用HQSAR模型的色码表示,探讨了对S-DABOs类似物的活性起重要作用的结构与片段,为此类化合物的进一步结构改造与优化提供理论指导.; 王月平闫婉露郭琼何严萍; 关键词：HIV-1逆转录酶抑制剂

苯并咪唑-5-羧酸酰胺HCV NS5B聚合酶抑制剂的分子全息QSAR研究及设计被引量：3: 2017年; 采用分子全息定量构效关系(HQSAR)方法,研究54个苯并咪唑-5-羧酸酰胺类HCV NS5B聚合酶抑制剂的结构与活性之间的关系.讨论了分子碎片大小、碎片区分参数以及分子全息长度对模型的影响.以39个化合物构成的训练集所建最优模型的交叉验证相关系数q2为0.779,非交叉验证相关系数r2为0.922,标准偏差SEE为0.251.同时,利用HQSAR模型的色码图探讨了对该类抑制剂的活性起重要作用的结构片段,并根据HQSAR最佳模型图设计了17个新型2-硫乙酰芳胺-苯并咪唑-5-羧酸酰胺类衍生物,经HQSAR模型预测,这些分子理论上对HCV NS5B聚合酶均具有良好的抑制活性.; 陈娴张廉高王子恒王月平何严萍; 关键词：HCV 分子设计

三芳基吡啶酮类新型冠状病毒3CL蛋白酶抑制剂构效关系研究及分子设计: 2022年; 3CL蛋白酶在冠状病毒复制过程中起着极为关键的作用,是重要的药物靶标.采用分子对接的方法产生了38个三芳基吡啶酮类化合物的活性构象.并以此为基础,应用比较分子力场分析(CoMFA)方法对其三维定量构效关系进行了研究:以30个化合物构成的训练集所建立的CoMFA模型,其交叉验证系数q^(2)为0.810,非交叉验证相关系数r^(2)为0.981,标准偏差SEE为0.099.对由8个化合物构成的测试集进行了预测,其预测相关系数r^(2)_(pred)为0.855,表明所建模型具有良好的拟合能力及预测能力.基于CoMFA等势面图,探讨了此类化合物立体场与静电场的有利结构特征,并以此为理论指导设计了一组具有良好预测活性的三芳基吡啶酮类3CL蛋白酶抑制剂,为此类化合物的进一步优化提供了理论指导.; 张继川何严萍王月平; 关键词：冠状病毒定量构效关系分子设计

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王月平