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聂凯: 作品数：66 被引量：136H指数：7; 供职机构：中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所更多>>; 发文基金：艾滋病和病毒性肝炎等重大传染病防治专项国家自然科学基金国家科技重大专项更多>>; 相关领域：医药卫生生物学农业科学轻工技术与工程更多>>

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黑龙江省桦南县2020年蜱媒病毒调查被引量：2: 2022年; 目的调查黑龙江省佳木斯市桦南县蜱及蜱媒病毒种类。方法于2020年5月在桦南县采集蜱标本,并进行形态学鉴定。利用实时荧光定量PCR方法对采集的蜱标本进行蜱传脑炎病毒(TBEV)、发热伴血小板减少综合征病毒、鄂木斯克出血热病毒、兰加特病毒、波瓦森病毒、阿龙山病毒核酸检测,并使用高通量测序法获得阳性病毒基因组序列。结果共采获890只蜱,包括全沟硬蜱475只(雄蜱210只、雌蜱265只),森林革蜱360只(雄蜱260只、雌蜱100只),嗜群血蜱55只(雄蜱5只、雌蜱50只)。1批(10只蜱混合)标本(JMS20)TBEV核酸阳性,由雌性全沟硬蜱携带。其他病毒核酸全部阴性。系统进化显示,该株蜱传脑炎病毒与远东型TBEV亲缘关系较近。结论佳木斯地区蜱媒样本仍携带蜱传脑炎病毒,研究结果为该地区蜱传病毒病的防控提供了基础数据。; 李樊刘凤明冯盼盼王东强付士红聂凯殷启凯何英殷佳宇许松涛包名家王环宇; 关键词：蜱传脑炎病毒

GeXP多重基因表达遗传分析系统在手足口病病原分型检测中的应用: 本发明属于生物技术应用领域，涉及各级疾病预防控制机构，哨点医院等用于手足口病患者咽拭子和粪便等标本的多种肠道病毒(包括HEV71，CVA16，CVA4，CVA5，CVA9，CVA10，CVB1，CVB3和CVB)感染的同...; 马学军胡秀梅许文波张勇聂凯李瑾; 文献传递

环介导逆转录等温扩增技术检测中东呼吸综合征冠状病毒基因被引量：6: 2015年; 建立了基于浊度仪和羟基萘酚蓝(Hydroxy naphthol blue,HNB)颜色变化的简单、快速和灵敏的环介导逆转录等温扩增技术(RT-LAMP)检测方法,应用于中东呼吸综合征冠状病毒(Middle East respiratory syndrome coronavirus,MERS-CoV)的检测。针对MERS-CoV的核衣壳蛋白基因(Nucleocapsid,N)设计6条特异引物,在等温条件下(63℃)进行60min扩增反应。通过实时浊度仪记录扩增曲线和扩增前在反应体系中加入HNB观察颜色变化两种方式进行检测结果判定。本文对不同人类冠状病毒及常见呼吸道病毒进行了特异性验证,对梯度稀释的体外转录MERS-CoV全N基因RNA进行了定量和检测限分析,同时与已发表的实时荧光定量PCR(rRT-PCR)进行比较。结果显示,本研究建立的RT-LAMP方法特异性高,对于每反应管103至106的拷贝数RNA,出峰时间与每反应管N基因RNA拷贝数对数值有稳定的线性关系。基于浊度仪和颜色判定的RT-LAMP检测方法检测限分别为500拷贝和1 000拷贝。因此,该方法有望应用于MERS-CoV感染的快速筛选,具有在基层医疗卫生机构和现场推广和应用的潜力。; 关丽聂凯张丹李鑫娜王延群谭文杰马学军

西藏环状病毒TaqMan反转录聚合酶链式反应方法的建立: 2021年; 目的建立一种灵敏、特异的实时荧光定量TaqMan反转录聚合酶链式反应(RT-PCR),用于快速、准确地检测西藏环状病毒(Tibet orbivirus, TIBOV)。方法收集GenBank数据库中全部TIBOV基因序列,利用Clustal X 2.1软件进行比对,根据分析结果选择TIBOV VP4基因保守区域设计特异性引物、探针;以体外转录的RNA为标准品,建立检测TIBOV的TaqMan RT-PCR方法,绘制荧光定量标准曲线;对该方法的特异性、灵敏度、重复性进行评价。结果引物与探针具有良好的特异性,对多种虫媒病毒无交叉反应。检测反应灵敏度为1.0×10^(2)拷贝/反应,在1.0×10^(2~8)拷贝/反应模板范围内具有良好的扩增曲线,同一样品重复检测循环阈值(Ct)的变异系数均小于1.5%。对西藏自治区、云南省、湖南省和广东省采集的蚊虫样本进行筛查,结果均为阴性。TIBOV模拟样本检出率为100%。结论该方法灵敏度高、特异性强,可用于TIBOV的常规监测。; 冯盼盼殷启凯赵洁荣付士红李樊何英许松涛梁国栋聂凯王环宇; 关键词：实时荧光定量RT-PCR 分子检测

托斯卡纳病毒的研究进展: 2023年; 托斯卡纳病毒(Toscana virus,TOSV)是一种在地中海地区流行的白蛉传播病毒,该病毒感染可引发脑膜炎和脑炎,严重危害人体健康。疑似感染者可通过病毒分离、核酸检测和血清学检测等多种实验室检测方法进行诊断。本文将从TOSV的基因构成与分型、流行概况、传播媒介与增殖宿主、临床表现和实验室诊断等方面进行综述,为我国白蛉传播病毒研究和TOSV感染预防控制提供理论依据。; 郑宇珂聂凯李樊李浩王环宇; 关键词：白蛉

环介导等温扩增技术研究进展及其在病原检测中的应用被引量：6: 2013年; 环介导等温扩增技术（100p—mediatedisothermalamplification，LAMP）是日本学者Notomi于2000年建立的一种新型的核酸扩增技术。近年来该技术在不断的改进和完善过程中被广泛应用于各种病原检测，本研究就LAMP技术进展和病原检测应用这两方面研究进展进行综述如下。; 聂凯滕智平曾毅马学军; 关键词：环介导等温扩增技术病原检测核酸扩增技术 LAMP

SARS-CoV-2污染的进口冷链产品导致的一起大连本土新冠疫情被引量：5: 2021年; 2020年12月15日,大连市报告了4名码头冷链货物搬运工人SARS-CoV-2核酸检测呈阳性,在此之前,大连市已经连续136天没有报告本土病例。在这次大连COVID-19疫情(简称"大连新冠疫情")中,我们收集了2020年12月15日至2021年1月8日期间大连新冠疫情中全部感染者(83)及部分接触的轮船货物样本,其中确诊病例占61.45%(51/83),无症状感染者占38.55%(32/83)。通过高通量测序,共获得76条SARS-CoV-2全基因组序列,其中72条(86.75%,72/83)来自临床样本,4条来自R国籍A货船上的冷链食品外包装样本。基因组分析数据显示,与武汉参考株(NC;45512)相比,76条全基因组分别存在12~16个核苷酸突变位点,共享12个核苷酸突变位点,符合B.1.1进化分支突变特征。结合病毒基因组学和现场流行病学调查结果综合分析表明,大连新冠疫情是一起由SARS-CoV-2污染的进口冷链产品感染码头工人导致的本土疫情,在传播过程中至少形成了3个病毒代际和3个相对独立的传播链。; 王佶薄志坚薄志坚毛玲玲杨世宏鲁茁壮聂凯赵翔赵翔孙英伟姚文清孙英伟孙海波王越向妮娟王越宋洋马会来陈操马学军; 关键词：冷链基因组学现场流行病学分子流行病学

喀什边境口岸陆运卡车及集装箱污染的新冠病毒基因特征分析被引量：6: 2021年; 新疆维吾尔自治区喀什地区作为我国与中亚和欧洲的重要陆路货运口岸,来往货物运输频繁,引入新型冠状病毒(SARS-CoV-2)风险大,对我国新型冠状病毒肺炎(COVID-19)疫情防控造成压力。2020年11月我国新疆维吾尔自治区喀什地区发生输入SARS-CoV-2导致的本土聚集性COVID-19疫情。为明确货物运输载体携带SARS-CoV-2的基因特征以及边境快速物流系统作为SARS-CoV-2传播载体的可能性,本研究对2020年11月6日-2020年11月10日期间在喀什边境口岸货运卡车及运输的集装箱采集的35份SARS-CoV-2核酸阳性样本进行SARS-CoV-2全基因组序列测定和比对分析。结果显示,35份样本ORF1ab基因Ct值的中位数(最小值~最大值)为37.64(28.91~39.81),N基因Ct值的中位数(最小值~最大值)为36.50(26.35~39.30),Reads数匹配率的中位数(最小值~最大值)为51.95%(0.86%~99.31%),病毒载量较低;35份样本中基因组覆盖度达到70%以上的共计18份。基于Pango命名法,18条SARS-CoV-2基因组序列分别属于B.1、B.1.1、B.1.9、B.1.1.220、B.1.153和B.1.465共6个不同的基因型,其中3个基因型(B.1、B.1.1和B.1.153)在喀什边境接壤或邻近的四个国家同期采集的病例样本中也有发现。核苷酸突变位点和系统进化树分析显示,同一个地点采集的样本病毒基因组相似程度高;18条序列中的4条与喀什COVID-19疫情毒株代表序列处在同一个进化分支;其中1条序列与喀什COVID-19疫情毒株基因组存在1个或2个核苷酸突变位点差异,高度同源。本研究证实喀什COVID-19疫情期间边境货运卡车和集装箱存在境外多种基因型病毒的污染,其中存在喀什COVID-19疫情毒株的祖父代病毒,高度提示边境快速物流系统卡车及集装箱作为载体携带SARS-CoV-2病毒入境造成了本土疫情,这些数据为我国边境口岸地区的新冠防控策略制定及后续疫情溯源提供了关键的参考依据。; 冯晔囡崔燕陈志肖郜振国梦遥马鑫赵翔赵俊赵俊聂凯张璇王佶陈媛王佶王希江陈媛许文波陈操王大燕

等温扩增技术检测手足口病病原的研究: 手足口病自2004年以来在国内迅速传播,于2008年引起疫情暴发并在全国范围内大规模流行。据卫生部疫情数据显示,自2009年以来全国手足口病年报告病例人数均为百万以上,每年因该病死亡的儿童数以百计。手足口病已经成为我国的...; 聂凯; 关键词：手足口病肠道病毒人肠道病毒71型柯萨奇病毒A16型; 文献传递

2021年1月-2021年5月中国大陆入境人群新型冠状病毒的基因型分析被引量：1: 2022年; 为了解输入中国大陆的新型冠状病毒(新冠病毒,SARS-CoV-2)基因组型别和分布特征,本研究收集了采样日期在2021年1月1日至2021年5月31日间239例境外输入中国大陆的SARS-CoV-2核酸检测阳性人员病毒基因组序列,采用Pangolin在线分型平台(https://pangolin.cog-uk.io/)进行SARS-CoV-2基因组分析。结果显示,2021年1月1日至2021年5月31日间,中国大陆23个省份报告了SARS-CoV-2核酸检测阳性人员病毒序列,广东省报送的SARS-CoV-2基因组序列数最多(42.68%),其次为江苏省(12.13%)。有序列报告的病例来自5个大洲的59个国家(或地区),主要以亚洲(55.23%)和非洲(25.10%)为主,居前3位的国家为肯尼亚、菲律宾和阿联酋,均为14例。依据Pango命名法,239例感染者SARS-CoV-2基因组序列可划分为53个基因型,包括4种关切变异株(Variant of Concern,VOC):Alpha(B.1.1.7)、Beta(B.1.351)、Gamma(P.1和P.1.1)和Delta(B.1.617.2),占比分别为31.80%、14.23%、1.26%和9.62%,分别在14、8、2和6个省份监测发现。输入SARS-CoV-2的基因型以Alpha、Beta和Delta变异株为主。广东省监测发现的输入SARS-CoV-2基因型种类最多(36种),且包括4种VOC(Alpha、Beta、Gamma和Delta)和2种曾经定义的关注变异株(Epsilon和Eta)。本研究数据表明,2021年1月1日至2021年5月31日期间输入中国大陆的SARS-CoV-2基因型呈多样性,多个省份监测发现了国际流行变异株VOC,发现时间与占比与同期国际流行趋势相似,多数省份面临着较大的由输入病例引起本土疫情的风险。建议继续加强入境核酸检测阳性人员SARS-CoV-2基因组测序、感染者的隔离管控以及对重要流行变异株的研究,从而为我国新型冠状病毒肺炎疫情的防控和免疫策略的调整提供科学依据。; 冯晔囡赵翔夏影陈志肖聂凯聂凯牛培华王佶王世文许文波韩俊王大燕; 关键词：新型冠状病毒输入病例基因型

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