肖勇
- 作品数：61 被引量：157H指数：8
- 供职机构：中国热带农业科学院椰子研究所更多>>
- 发文基金：海南省自然科学基金国家自然科学基金中央级公益性科研院所基本科研业务费专项更多>>
- 相关领域：农业科学生物学轻工技术与工程更多>>
- 油棕基因组DNA 3种提取方法的比较研究被引量：8
- 2013年
- 采用CTAB小样提取法、PVP法和SDS-CTAB改良法,分别从油棕嫩叶和老叶中提取基因组DNA,并通过紫外分光光度计、琼脂糖凝胶电泳和PCR反应进行检测。研究结果表明:用CTAB小样提取法提取的油棕嫩叶总DNA的质量最好,纯度最高;用其他2种方法提取的DNA的质量均较差。
- 周丽霞肖勇杨耀东马子龙
- 关键词：油棕基因组DNA
- 一种用于香水椰子种苗纯度的鉴定的特异SSR引物及鉴定方法
- 本发明涉及香水椰子种苗栽培技术领域，公开了一种用于香水椰子种苗纯度的鉴定的特异SSR引物及其鉴定方法，先提取出香水椰子种苗的DNA，再用以上的特异SSR引物进行PCR扩增，扩增产物经聚丙烯酰胺凝胶电泳分离条带，染色，即可...
- 杨耀东吴翼沈雁肖勇夏薇李静周立霞
- 椰子CESA基因家族鉴定及生物信息学分析
- 2024年
- 中国加工椰糠与椰壳纤维所需的椰衣、椰壳主要从国外进口,国内原材料供给不足,市场潜力巨大,因此培育椰子高品质深加工新品种具有重要意义。本研究利用已发表的椰子基因组数据,共鉴定出10个椰子CESA基因家族成员并对其进行了基因结构分析、蛋白理化性质分析、亚细胞定位预测、蛋白质保守结构域预测、超二级结构预测分析、三级结构同源建模、蛋白跨膜螺旋预测、系统进化树构建及表达谱分析。蛋白理化性质与亚细胞定位分析显示,椰子CESA成员蛋白多为酸性蛋白,且主要定位于细胞质膜上。进化分析显示,椰子CESA基因家族成员可分为5组,组内基因同源性较高,组间差异较小,所有家族成员均含有N端锌指结构域和纤维素合酶结构域,基因结构相似。聚类及表达谱分析显示,CoCESA3、CoCESA4、CoCESA6、CoCESA8与已报道的拟南芥、水稻初生细胞壁合成相关CESA基因聚类在一起,并在成熟叶片、幼叶、胚、胚乳和愈伤组织中都有较高的表达量,其可能参与了初生细胞壁合成且在整个植物生长发育过程中发挥作用。本研究鉴定了10个椰子CESA基因家族成员并对其进行了生物信息学分析,为椰子CESA基因家族功能的进一步研究提供基础,并为高质量深加工椰子新品种的分子育种提供候选基因。
- 孙熹微杨耀东弓淑芳王永肖勇
- 关键词：生物信息学
- 油棕CBF基因的克隆及与禾本科植物CBF基因的进化关系被引量：10
- 2013年
- 本研究致力于克隆油棕低温相应转录因子基因CBF。以NCBI网站上公布CBF基因设计引物,对油棕的基因组进行扩增,并对其进行回收,转化和测序。总共测了11个克隆,测序结果显示这11个克隆中有3个不同拷贝的CBF基因序列,它们序列之间的同源性分别是99%,92%和91%。将克隆的CBF基因与不同物种的CBF基因进行了聚类分析,分析结果显示:这些不同物种的CBF基因可以分为3类,克隆的油棕的3个CBF基因被聚在一块,此外,油棕CBF基因与HvCBF1,OsDREB1E,HvCBF11以及TaCBF11的同源性较高。采用同源序列法,克隆了3个拷贝的CBF基因,通过Blast比对发现,克隆的CBF基因与NCBI数据库现有的CBF基因具有很高的同源性。这些工作将为油棕抗寒的分子选育奠定基础。
- 肖勇杨耀东曹红星范海阔雷新涛乔飞
- 关键词：油棕CBF基因抗冷性
- 大薯ERF基因家族的挖掘与特征被引量：1
- 2019年
- 大薯属于薯蓣科薯蓣属,是热带和亚热带地区的一种重要的粮食作物,但其基础研究还较为薄弱。本研究基于公布的大薯转录谱序列和基因组序列,开展了对大薯ERF家族基因的挖掘和特征分析。共找到DaERF基因41个,其中14个DaERF有一个以上的外显子,其余的均为一个外显子。进一步的blastx分析发现30个DaERF基因具有保守的AP2结构域,依据AP2序列构建系统进化树,可将其分成5个亚家族。通过对AP2结构域的两个保守motif的位置和结合位点的分析,发现相同家族的ERF蛋白具有相似的结构特征。根据大薯转录谱分析DaERF在不同组织中的表达,发现一些DaERF的表达具有组织特异性,并且属于同一亚家族基因的表达具有相似性。我们对在块茎中具有高表达的DaERF-DaERF24基因,使用RT-qPCR验证其在不同组织的表达,结果与转录谱数据一致。本研究通过对大薯ERF转录因子家族特性的初步挖掘,为以后研究ERF家族全基因分布、ERF基因功能验证和薯块生长发育机理提供依据。
- 张金兰张博黄东益肖勇吴文嫱许云黄小龙夏薇
- 关键词：ERF基因家族
- 参薯miR172基因与靶基因AP2特征分析被引量：1
- 2022年
- 参薯是热带和亚热带的重要薯类作物,其块茎中富含淀粉。由于miR172是调控马铃薯块茎形成的关键基因,为分析miR172及其靶基因AP2的基因特征和不同发育时期的表达模式,本研究开展参薯miR172及靶基因预测分析和验证。基于参薯转录组和基因组序列,找到8个DalmiR172基因,并预测到其靶基因主要为AP2基因家族。通过多序列比对,发现8条DalmiR172成熟序列高度保守,其前体序列有一定差异。通过RT-qPCR分析参薯miR172在不同生长阶段中的表达情况,发现参薯已结薯植株中的表达量显著高于参薯幼苗期,表明miR172的表达水平在参薯幼苗到结薯时期呈增加趋势,推测miR172可能对参薯块茎形成具有促进作用。通过农杆菌介导的烟草瞬时表达实验验证了参薯miR172负调控AP2的转录水平。本研究为miR172-AP2调控模块在参薯生长发育过程中的功能分析提供实验依据。
- 王丹丹刘梦丽戴云素黄东益肖勇吴文嫱黄小龙夏薇
- 一种RNA的提取液、制备方法及油棕果RNA提取方法
- 本发明涉及生物技术领域，公开了一种RNA的提取液、制备方法及油棕果RNA提取方法。本发明所述的RNA提取液各组分均为常用的试剂，制备方法简单，质量稳定可控。采用本发明所述的RNA提取液提取油棕果的RNA，所得的油棕果RN...
- 肖勇夏薇周丽霞杨耀东李静
- 文献传递
- 多倍体在植物进化中的意义被引量：7
- 2013年
- 几乎所有的开花作物都为多倍体植物,其基因组至少经历1次以上的全基因组加倍事件。随着测序技术的不断革新,人们对作物的基因组以及基因组的演化历史有了全新认识。分析了全基因组加倍在物种进化中的意义:多倍化改变基因组结构,丰富物种的遗传多样性,改变重复基因表达模式,增强物种的适应性,并展望多倍化在作物遗传育种中的应用。
- 肖勇杨耀东夏薇雷新涛马子龙
- 关键词：进化多倍化重复基因多倍体
- 几种影响矮种椰子成熟胚愈伤组织诱导的因素研究
- 2021年
- 本文对几个影响矮种椰子成熟胚的愈伤组织诱导及褐化程度的因素进行研究。以海南优良矮种椰子‘文椰2号’和‘文椰4号’11月龄的成熟胚为材料,研究不同的基因型、凝固剂、激素浓度和接种方式对愈伤组织的诱导率和外植体褐化程度的影响。结果显示:以‘文椰2号’成熟胚为材料,愈伤率最高个体为H1;接种至PhytagelTM-P8169凝固剂的愈伤率最高,为71.43%;接种至Gelrite-G1910凝固剂的褐化率最低,为40.00%;接种至添加110μmol/L 2,4-D的培养基的愈伤率最高,为63%,褐化率最低,为46.67%;剥取胚芽接种的愈伤率最高,为48.72%,其褐化率与完整胚接种的无显著性差异。以‘文椰4号’成熟胚为材料,愈伤率最高个体为X1;接种至Agar-A8190凝固剂的愈伤率和褐化率最高,分别为46.15%和30.77%;接种至Gelrite-G1910凝固剂的褐化率最低,为16.67%;接种至添加600μmol/L 2,4-D的培养基愈伤率最高,为40.00%,但与110μmol/L 2,4-D无显著性差异;接种至110μmol/L 2,4-D的褐化率最低,为50.00%;纵切接种获得愈伤率最高,为40.00%;完整胚接种褐化率最低,为33.33%。结果表明:基因型、凝固剂、激素浓度和外植体接种方式对愈伤组织的诱导率均有显著影响。‘文椰2号’愈伤组织诱导的最佳2,4-D浓度为110μmol/L,最佳凝固剂为PhytagelTM-P8169,最佳接种方法为剥取胚芽接种。‘文椰4号’愈伤组织诱导的最佳2,4-D浓度为110μmol/L,最佳凝固剂为Agar-A8190,最佳接种方法为胚纵切接种。
- 李志瑛穆治华肖勇范海阔
- 关键词：椰子愈伤组织
- 椰子SUT基因家族的生物信息学及其表达分析被引量：1
- 2021年
- 蔗糖转运蛋白是非常典型的跨膜转运蛋白,它在蔗糖的吸收和转运过程中发挥重要作用。目前对椰子蔗糖转运蛋白的功能和机制还不够了解,为深入探究椰子蔗糖转运蛋白家族(CnSUTs),通过生物信息学方法对CnSUTs的5个成员(编号CnSUT1~CnSUT5)进行综合性分析,主要涉及到蛋白理化性质、同源性等方面。结果表明:CnSUTs主要定位于质膜上,它属于典型的疏水性膜蛋白;这种蛋白存在GPH结构功能域,具有高度保守性;α-螺旋和无规卷曲是最为重要的二级结构元件,其三级结构非常类似。本研究为探究CnSUTs蛋白家族在高粱的蔗糖吸收及转运中的功能提供重要参考。
- 姚慧玲范海阔刘蕊肖勇
- 关键词：椰子蔗糖转运蛋白生物信息学分析
