赵剑
- 作品数：8 被引量：7H指数：2
- 供职机构：南京工业大学理学院更多>>
- 相关领域：医药卫生生物学理学文化科学更多>>
- 数学结构的蛋白质二维数字表达及其应用被引量：2
- 2013年
- 提出了蛋白质的一种二维数字表达,该表达考虑了组成蛋白质的核苷酸在DNA双螺旋结构中的对称性和密码子当中的核苷酸组成规律,使之与生物学意义相符合。Cosic′s的一维共鸣识别方法是一种数学物理模型,它使用信号处理的方法识别蛋白质序列当中包含的信息。对蛋白质的二维数字表达结合使用向量序列的傅里叶变换理论,提出高维共鸣识别方法。实验结果显示,所提出的蛋白质二维数字表达和高维共鸣识别在判别双序列的蛋白质相似性时同样有效。
- 赵剑阮越王嘉松
- 关键词：蛋白质序列
- 高维共鸣识别——蛋白质比较的新方法被引量：2
- 2013年
- 在提出的符号序列的高维数字表达以及高维傅里叶变换概念的基础上,提出了蛋白质比较的新方法——高维共鸣识别。将两种蛋白质对应的氨基酸序列转化为向量序列,分别计算它们对应的向量序列的离散傅里叶变换。据此,定义两个蛋白质序列所对应的交叉谱函数,考查交叉谱函数的信噪比,判断两种蛋白质序列的相似性或差异性。计算结果显示它是蛋白质比对的又一个有效方法,是Cosic一维共鸣识别的拓展。
- 赵剑王嘉松刘国庆
- 关键词：信噪比
- 问题驱动的高等数学中微分的教学设计被引量：1
- 2013年
- 微分是高等数学中一个重要的概念，也是学生最难理解的概念之一，对于微积分的学习能起到承上启下的作用。由于概念比较抽象，涉及到极限、无穷小以及无穷小量的阶，初学者对定义难以理解。尤其是微分的定义为“增量的线性主部”，教科书中关于这种定义的合理性、必然性介绍较少，因此一直是高等数学教学中的一个重点和难点。本文通过对同济六版高数教材中的内容改进，从微观和宏观两个角度设计微分教学，微观教学部分注重微分定义的合理性和必然性，宏观教学部分则注重微分定义的思想内涵以及与极限、积分和级数的联系。
- 赵剑
- 关键词：教学模式高等数学微分教学设计
- 不同DNA序列映射对频谱3-周期性的影响
- 2012年
- DNA符号序列经过数值映射后其数字序列所具有的频谱3-周期性被认为是用来区分编码区和非编码区的一个重要特征。将常见映射分为4类,讨论了各类映射之间的关系;使用Parzen窗口密度估计法确定不同映射下的3-周期信噪比阈值,并利用在该阈值下的分类正确率指标对不同映射进行了评价;依据移动序列信噪比曲线给出敏感性、非震荡性2种指标,比较了不同映射在利用3-周期性进行基因编码区域识别上的优劣性。
- 邵建峰邵伟严晓华赵剑
- 关键词：基因识别敏感性
- 两类含参变量Dirichlet积分的公式解
- 2005年
- 给出了含参变量Dirichlet积分In,m(s)的定义。数学分析中的许多含参变量积分都是In,m(s)的特例。利用三角降次公式及解析函数的理论解决了含参变量Dirichlet积分的公式解问题,由此推出第一类Dirichlet积分与第二类Dirichlet积分的公式解。通过计算,解决了In,m(s)的表示问题。
- 赵剑许丙胜张维荣
- 关键词：DIRICHLET积分计算方法公式解解析函数
- 蛋白质序列在频率域上的一种特征提取方法被引量：1
- 2013年
- 针对不同蛋白质选取不同的氨基酸指数进行蛋白质研究,提取氨基酸序列的位置和排列信息在频率上的特征频谱作为特征向量,通过计算特征向量的距离考察蛋白质的相似性。这是一种非比对相似性的判别方法。蛋白质组的聚类结果表明,蛋白质序列在频率域上的特征提取方法具有一定的应用价值和生物学意义。
- 赵剑许金涛顾凌榕
- 关键词：互相关自相关特征提取
- AAindex数据库中傅里叶方法的多重氨基酸指数选择被引量：1
- 2013年
- 波谱学方法研究蛋白质时,蛋白质序列的特征频率与蛋白质的位点、功能、空间结构对应。基于时间序列傅里叶变换的交叉谱原理,本文提出的"一个蛋白质关于多种氨基酸指数的一致谱"能够获取一个或多个蛋白质序列较显著的特征频率,再由特征频率去筛选与之对应的氨基酸指数。该方法与Lazovic'的筛选方法和筛选意义不同。结果显示,筛选出的氨基酸指数对应的性质多数与蛋白质的空间结构性质有关。蛋白质特征频率也许是用于特征提取的好方法,氨基酸指数筛选可被看作蛋白质数字表达的一种优化。
- 赵剑许金涛
- 关键词：傅里叶变换信噪比
