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付晓腾

作品数:8 被引量:1H指数:1
供职机构:中国海洋大学更多>>
发文基金:国家自然科学基金国家重点基础研究发展计划国家高技术研究发展计划更多>>
相关领域:农业科学轻工技术与工程更多>>

文献类型

  • 4篇专利
  • 2篇学位论文
  • 1篇期刊文章
  • 1篇会议论文

领域

  • 4篇农业科学
  • 1篇轻工技术与工...

主题

  • 4篇扇贝
  • 4篇栉孔扇贝
  • 3篇基因
  • 3篇高通量
  • 3篇SNP
  • 2篇蛋白
  • 2篇快速提取方法
  • 2篇基因分型
  • 2篇基因组
  • 2篇贝类
  • 2篇抽提
  • 1篇单核
  • 1篇单核苷酸
  • 1篇单核苷酸多态
  • 1篇单核苷酸多态...
  • 1篇多态
  • 1篇多态性
  • 1篇性状
  • 1篇序列对
  • 1篇遗传标记技术

机构

  • 8篇中国海洋大学

作者

  • 8篇付晓腾
  • 6篇胡晓丽
  • 6篇包振民
  • 4篇王师
  • 4篇张玲玲
  • 2篇焦文倩
  • 2篇王珊
  • 2篇苗艳
  • 2篇毛俊霞
  • 1篇陆维
  • 1篇李纪勤
  • 1篇窦锦壮
  • 1篇赵熙强
  • 1篇胡景杰
  • 1篇苏海林
  • 1篇张月月
  • 1篇李艳
  • 1篇侯睿
  • 1篇贺艳
  • 1篇吕佳

传媒

  • 1篇中国海洋大学...

年份

  • 1篇2015
  • 3篇2014
  • 2篇2013
  • 1篇2010
  • 1篇2009
8 条 记 录,以下是 1-8
排序方式:
基于454测序的栉孔扇贝(Chlamys farreri)基因和SNP筛查
高通量的新一代测序技术在基因表达、注释和突变筛查等方面显示了强大的功能。本文应用454公司的高通量测序系统GS FLX Titanium对栉孔扇贝的转录本进行了测序分析,首次将新一代测序技术应用于贝类的基因和突变筛查。分...
王珊包振民胡晓丽苏海林贺艳张月月李艳付晓腾
关键词:栉孔扇贝转录本SNPS
文献传递
栉孔扇贝(Chlamys farreri)高密度图谱构建和基因组框架图谱绘制
栉孔扇贝Chlamys farreri(Jones et Preston1904)作为双壳类的一种,是我国极具商业价值的重要经济种。本研究借助二代测序平台,建立了栉孔扇贝高通量SNP开发与分型技术,构建了高精度图谱,进行...
付晓腾
关键词:栉孔扇贝生长繁殖经济性状
文献传递
测序错误和重复序列对无参照基因组单核苷酸多态性分型的影响
2013年
单核苷酸多态性(Single nucleotide polymorphism—SNP)被认为是揭示遗传变异理想的分子标记,近几年来一系列针对高通量测序平台的技术如RAD,GBS,RRLs,2b-RAD等成为非模式生物尤其是水生动物的de novo SNP标记规模开发和大样本群体遗传研究的有利途径。本文从理论上讨论了测序错误和重复序列因素对de novo SNP分型的影响,并利用模式生物拟南芥RAD模拟数据对理论分析进行了验证。通过理论推导和模拟验证发现测序数据量在15~20X左右时单拷贝区域内SNP被检测的概率大于95%,等位基因的支持度不小于2时能够有效屏蔽掉测序错误对SNP分型的影响(假阳性低于2%),这些为实际数据的de novo SNP分型提供了理论上的指导。
窦锦壮赵熙强付晓腾焦文倩王南南张玲玲胡晓丽王师包振民
关键词:DESNP分型
一种大量样本同时分型的方法
本发明提供一种大量样本同时分型的方法,能够通用于多种测序平台的SNP筛查和分型。本发明选用II B型限制性内切酶对提取的基因组DNA进行酶切,并在酶切片段的两端加上接头,且其中一个接头从5'至3'端包括有测序平台的通用测...
王师焦文倩包振民吕佳付晓腾张玲玲胡晓丽
文献传递
一种用于大规模、高通量基因分型的贝类DNA快速提取方法
本发明提供了一种用于大规模、高通量基因分型的贝类DNA快速提取方法,首先选取少量鳃丝组织作为取样组织,然后进行蛋白消化裂解细胞释放DNA,仅需离心吸取上清弃除沉淀,上清溶液稀释后即可用于后续分子标记分型工作,省略了常规D...
包振民毛俊霞王师苗艳张玲玲胡晓丽付晓腾
文献传递
一种大规模筛查扇贝SNP的方法
本发明属于扇贝DNA分子遗传标记技术领域的一种大规模筛查扇贝SNP标记的方法,先用溶液D和酚氯仿提取多个栉孔扇贝RNA,按比例混匀后紫外分光光度计测定其浓度备用;再构建扇贝全长cDNA样品,包括cDNA第一链合成和cDN...
包振民王珊胡景杰胡晓丽李纪勤侯睿付晓腾陆维
文献传递
一种用于大规模、高通量基因分型的贝类DNA快速提取方法
本发明提供了一种用于大规模、高通量基因分型的贝类DNA快速提取方法,首先选取少量鳃丝组织作为取样组织,然后进行蛋白消化裂解细胞释放DNA,仅需离心吸取上清弃除沉淀,上清溶液稀释后即可用于后续分子标记分型工作,省略了常规D...
包振民毛俊霞王师苗艳张玲玲胡晓丽付晓腾
栉孔扇贝(Chlamys farreri)高密度图谱构建和基因组框架图绘制
栉孔扇贝Chlamys farreri (Jones et Preston1904)作为双壳类的一种,是我国极具商业价值的重要经济种。本研究借助二代测序平台,建立了栉孔扇贝高通量SNP开发与分型技术,构建了高精度图谱,进...
付晓腾
关键词:栉孔扇贝SNPQTL基因组测序
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