初亚男
- 作品数：13 被引量：66H指数：5
- 供职机构：南京军区南京总医院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金江苏省科技支撑计划项目中国博士后科学基金更多>>
- 相关领域：医药卫生生物学农业科学更多>>
- 焦磷酸测序检测载脂蛋白E基因多态性方法的建立被引量：1
- 2019年
- 目的载脂蛋白E主要参与脂类代谢和胆固醇转运,对维持身体健康有重要意义。建立载脂蛋白E基因112T>C和158C>T单核苷酸多态性的焦磷酸测序方法。方法选择T、L、TT 3种扩增体系分别用60℃退火程序和62-68℃梯度升温退火程序,进行PCR体系和温度的优化考察。将焦磷酸测序结果与Sanger测序结果比较,考察方法的特异性,通过梯度稀释人基因组核酸作为检测模板,考察方法的灵敏度。结果根据产物浓度和特异性确定60℃循环程序和L体系为最优条件。20份标本的焦磷酸测序结果与Sanger测序完全一致。灵敏度可达0.16 ng基因组DNA。结论建立了ApoE基因中112和158位点的焦测序检测方法,可用于临床个体化用药指导。
- 初亚男封利颖吴燕子张婕妤
- 关键词：焦磷酸测序载脂蛋白E
- CYP2C9、VKORC1基因多态性对华法令抗凝治疗维持剂量的影响被引量：2
- 2014年
- 目的:研究细胞色素P450 2C9基因(CYP2C9)和维生素K环氧化物还原酶复合物1基因(VKORC1)在华法令抗凝治疗患者的多态性分布,并探讨其对抗凝剂量的影响。方法:收集74例服用华法令抗凝治疗病人的外周血,测定其凝血酶原时间国际标准化比值(INR)和CYP2C9、VKORC1基因类型,探讨基因多态性的分布特点,以及华法令维持剂量与基因多态性的关系。结果:CYP2C9基因分布主要为野生型,突变型较少,抗凝治疗的维持剂量野生型组与突变组无明显差别。VKORC1基因型的分布AA型为主,AG型较少,GG型未见,抗凝治疗的维持剂量AG组明显高于AA组。结论:CYP2C9、VKORC1基因在中国汉族人群中具有遗传多态性,VKORC1基因的多态性在华法令抗凝治疗中具有显著意义。
- 倪立初亚男张婕妤周国华
- 关键词：CYP2C9VKORC1基因多态性华法令INR
- 基于克隆测序技术的人类白细胞抗原基因高分辨率分型方法的建立被引量：3
- 2014年
- 运用优化的扩增和克隆测序技术,建立了人类白细胞抗原(HLA-B)基因的高分辨率分型方法。针对HLA-B基因保守区序列设计引物进行等位基因扩增,基于质粒不相容原理将杂合型等位基因有效克隆入质粒DNA中,经细菌培养后进行Sanger测序,根据测序结果经ClustalX2软件分析和IMTG/HLA数据库的BLAST比对即可完成HLA-B基因的高分辨率分型。利用建立的方法对7例临床样本进行了HLA-B基因分型,并且与第三方直接碱基序列分析基因分型技术(PCR-SBT)进行比对,结果完全一致。本方法无需专业分型软件,准确度高,成本低;采用通用引物进行等位基因的扩增和测序,无需传统方法中繁琐的引物设计和过程优化,实现了HLA-B基因的高分辨率分型。
- 邢晓清初亚男项铮宋沁馨周国华
- 多重环介导核酸等温扩增技术检测血液中常见病原体被引量：6
- 2013年
- 背景:血液安全性筛查是输血前必要检测项目。目前临床采用血清学检测技术,存在较长的检测窗口期,易产生假阴性检测结果,造成输血交叉感染。目的:建立多重环介导核酸等温扩增技术,实现在一管反应体系内同时检测四种病原体:乙肝病毒,丙肝病毒,艾滋病毒和梅毒螺旋体。方法:通过限制性酶切处理多重环介导核酸等温扩增产物,利用酶切产物的长度分析扩增产物的种类,从而分析待测样本中含有何种血液病原体。结果:检测164例临床样本,其检测结果可以通过琼脂糖电泳,聚丙烯酰胺凝胶电泳及芯片电泳分析,且均可实现对多重扩增产物的酶切片段进行区分和鉴别。结论:多重环介导核酸等温扩增技术可以同时单管检测多种待测血液病原体,可以为临床提高简单、快速、高灵敏和高特异的检测技术。
- 梁超成思佳王聪初亚男奚涛周国华
- 环介导等温扩增技术改进的研究进展被引量：19
- 2015年
- 环介导等温扩增法(LAMP)是近年发展起来的新型核酸检测技术,因其检测特异性好、灵敏度高、时间短、无需热循环设备而在病原体检测中得到广泛应用。基于该技术进行的改造和改良也层出不穷,本文从该技术的方法改造、缩短反应时间和简化模板预处理、多重扩增产物分析、防止假阳性污染四个方面对近几年LAMP技术的发展进行综述,为今后以该技术平台为基础的创新和应用提供理论依据。
- 初亚男封利颖张婕妤邹秉杰周国华
- 关键词：环介导等温扩增
- 人类白细胞抗原基因HLA-B*58∶01基因型的快速低成本鉴别方法被引量：3
- 2016年
- 采用焦磷酸测序技术和改进的全血基因组提取方法,建立了位于6号染色体的银屑病易感基因1候选基因1(Psoriasis susceptibility 1 candidate 1,PSORS1C1)rs9263726位点的焦磷酸测序方法,检出限达到0.4 ng/μL基因组DNA,20例标本的焦磷酸法和Sanger法测序结果完全一致。利用本方法对683例标本的rs9263726位点进行测序,得到中国人群该位点野生型(GG型)分布频率为87.6%,突变的GA型分布频率为11.7%、AA型分布频率为0.7%。通过对随机选取的46例标本rs9263726位点与人类白细胞抗原基因HLA-B*58∶01基因型的连锁关系进行分析,结果表明,该位点预测HLA-B*58∶01基因型的灵敏度为100%、特异性为91.3%。本方法可用于HLA-B*58∶01基因型的检测。
- 初亚男张婕妤封利颖周国华
- 关键词：焦磷酸测序基因型
- 焦磷酸测序技术对阿司匹林个体化用药相关SNP位点分型被引量：1
- 2017年
- 阿司匹林的抗血小板作用在临床存在显著的个体差异,而rs5918、rs12041331和rs730012 3个单核苷酸多态性位点与阿司匹林的药效和不良反应有着密切的联系。本文基于PCR结合焦磷酸测序技术,建立了阿司匹林相关SNP位点的基因分型方法。自主设计扩增引物和测序引物;优化PCR扩增条件,使3个位点能够在相同的条件下扩增并通过梯度稀释基因组DNA检测方法的灵敏度;最后,分别基于本文建立的新方法和Sanger测序技术对20例临床样本进行3个位点的基因分型,验证该方法的准确性。结果显示,本文成功建立了阿司匹林个体化用药相关SNP位点的基因分型方法,检测下限低至0.4 ng基因组DNA,用两种方法对20例临床样本进行3个位点的基因分型,结果完全一致,说明该方法有较高的准确性。
- 邢晓清卜修民初亚男邹秉杰宋沁馨周国华
- 关键词：阿司匹林单核苷酸多态性个体化用药
- 阿司匹林抵抗与基因多态性的研究进展被引量：1
- 2019年
- 阿司匹林作为抗血小板凝集的一线用药,广泛用于心血管阻塞性疾病的预防及治疗,然而,临床观察显示,并非所有患者均能从治疗中获益,部分患者会出现阿司匹林抵抗现象,遗传变异是其主要原因之一。文章主要从阿司匹林作用靶标基因的多态性、糖蛋白受体基因的多态性、二磷酸腺苷受体基因的多态性以及基因?基因相互作用等方面进行综述。
- 李婷唐棠初亚男
- 关键词：阿司匹林抵抗基因多态性靶标糖蛋白受体
- 胚胎植入前遗传学诊断新技术的研究进展被引量：7
- 2018年
- 胚胎植入前遗传学诊断(PGD)是配合辅助生殖技术而发展起来的一类诊断技术,其通过检测体外培养的包括染色体拷贝数变异情况、易位倒位情况、单基因突变情况等排除遗传异常胚胎,将正常的胚胎植入母体继续发育,提高植入成功率,降低流产率,避免异常染色体遗传入子代。随着芯片杂交技术、二代测序技术和显微延时摄像技术等的出现,植入前遗传学诊断不断向高分辨率、高特异性、无创的方向发展。文章主要就该领域近年来涌现的新技术,特别是MicroSeq-PGD技术、等位基因映射识别技术(MaReCs)、基于cfDNA的胚胎植入前诊断技术等最新的研究进展进行综述。
- 封利颖初亚男邹秉杰张婕妤
- 关键词：胚胎植入前遗传学诊断杂交技术
- 全血改进线性指数聚合酶链式反应用于焦磷酸测序检测基因多态性被引量：3
- 2015年
- 焦磷酸测序是目前基因多态性检测的主要方法之一,但是其前期的样本制备工作较为繁琐,限制了其在临床检测中的应用。为了简化焦磷酸测序的流程,本研究根据不对称PCR原理,改进了线性指数聚合酶链式反应(LATE-PCR)的引物设计方法,增加过量引物的长度和浓度,并结合全血直接扩增技术,建立了基于普通r Taq聚合酶和高p H缓冲液(Hp H Buffer)的全血改进LATE-PCR(Improved LATE-PCR,im LATE-PCR)方法。考察了方法的最优扩增体系、血液抗凝剂对其影响以及全血模板量。采用单管、一步法直接扩增出单链测序模板,成功地对24例临床血样的乙醇脱氢酶基因多态性进行了检测,检测结果可用于指导临床个体化用药。24例样本的基因型分别为ADH1B位点AA纯合6例、AG杂合14例、GG纯合4例;ADH1C位点GG纯合20例、AG杂合4例、AA纯合0例。
- 项铮刘云龙邢晓清初亚男宋沁馨周国华
- 关键词：焦磷酸测序基因多态性酒精代谢
