孙亮先 作品数:54 被引量:168 H指数:8 供职机构: 泉州师范学院 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 福建省农科院青年科技人才创新基金 福建省自然科学基金 更多>> 相关领域: 农业科学 生物学 经济管理 更多>>
水稻胚乳及幼苗基因表达谱的研究 真核生物基因组庞大,其中仅有的2-3﹪的序列编码基因,如人的基因组由31.647亿bp组成,约有2﹪的序列编码3.3万个基固(Venter等,2001);水稻基因组为4.2亿bp,编码约3-5万个基因(Goff等,200... 孙亮先关键词:水稻胚乳 幼苗 基因表达谱 以随机扩增多态性DNA(RAPD)技术筛选意大利蜜蜂重要农艺性状遗传标记 被引量:9 2003年 为了获得意大利蜜蜂重要农艺性状的分子遗传标记 ,本研究以 30种RAPD随机引物对平湖浆蜂、美意、澳意、苏意等 4个在产浆、采蜜和抗病性上存在较大差异的意蜂品系的基因组DNA进行RAPD_PCR扩增筛选。试验结果显示 ,随机引物W 1 8(5′_CGGACGGCGG_3′)和W2 3(5′_GTACCGCCCG_3′)的扩增图谱呈多态性。其中 ,在引物W 1 8所扩增出的 9条片断中 ,2 35 2bp和 36 4bp条带为美意所特有 ,表明可将之用于鉴别美意 ;2 0 92bp条带仅出现于蜂蜜高产的美意和澳意中 ,意味着该条带为一个蜂蜜高产性状的遗传标记 ;而 6 32bp条带在王浆高产品系平湖浆蜂中出现的频率 (0 91 )显著高于 (P <0 0 1 )美意(0 0 4 )、澳意 (0 0 2 )和苏意 (0 0 0 ) ,说明 6 32bp条带可能为王浆高产性状的一个遗传标记。在W2 3引物扩增条带中 ,6 5 1bp条带为澳意所特有 。 孙亮先 吉挺 周斌 陈国宏 袁建军 黄周英关键词:RAPD 意大利蜜蜂 农艺性状 随机扩增多态性DNA 表达序列标记(EST)研究进展 被引量:30 2002年 表达序列标记 (EST)是通过对cDNA文库克隆进行大规模测序所获得的 5′或 3′端序列 ,长度一般为 30 0~ 5 0 0bp ,可代表生物体某一时间内某组织中表达的基因 .本文就EST技术原理、概念最新发展及其在大规模快速克隆基因。 孙亮先 谢进金 黄周英关键词:EST 基因克隆 生物信息学 CDNA文库 基因表达 基因组 用5'LongSAGE标签产生的长cDNA片段分析西方蜜蜂(Apis mellifera)基因座LOC727225的选择性剪接 2011年 选择性剪接是真核生物产生蛋白多样性的一个重要机制,并能通过产生不同的剪接本来调节基因在不同组织或发育阶段的表达而发挥其作用。本研究采用3条5'LongSAGE标签序列作为上游引物,通过RT-PCR克隆了西方蜜蜂(Apis mellifera)的一个预测基因座LOC727225的4条cDNA序列(GenBank登录号:JN627500至JN627503)。将cDNA序列对蜜蜂基因组作图发现,雄蜂头部中该基因的mRNA前体经由两种不同的剪接方式产生的2个长度不同的剪接本,其中较短的剪接本编码一个功能未知的新蛋白,而较大剪接本的推导产物蛋白与分支酸合酶和神经胰蛋白酶具有序列相似性。5'LongSAGE标签数据显示,LOC727225在成年雄蜂头部的表达水平非常高,RNA PolⅡ可从该基因的6个不同的转录起始位点(TSS)上以不同效率起始转录,其中在2个优势TSS上所起始的pre-mRNA被剪接成较小的剪接本,其数量占该基因成熟mRNA分子总量的90%。启动子序列分析显示,LOC727225是受细胞周期转录因子E2F和StuAP调控的靶基因,该基因可能在蜜蜂的细胞增殖中起重要作用。研究首次证实了基因座LOC727225的选择性剪接和选择性起始,结果为深入探索该基因的功能奠定了基础。 孙亮先 欧阳昊 郑华军 黄周英关键词:西方蜜蜂 转录起始位点 选择性剪接 启动子 基因座 龙竹和麻竹FT同源序列的扩增与序列分析 被引量:2 2012年 根据拟南芥Flowering Locus T(FT)基因和水稻Heading date 3a(Hd3a)基因的序列设计引物,通过PCR扩增的方法分别从麻竹和龙竹基因组DNA中各得到长为334bp的DNA片段.经BLAST检索、基因结构分析和编码蛋白功能域预测等分析,初步确定所得DNA片段可能是麻竹和龙竹中的FT同源基因的部分序列. 桑庆亮 黄周英 孙亮先关键词:麻竹 龙竹 PCR扩增 生物行为变化研究的新模式——工蜂 被引量:3 2007年 蜜蜂群体由1只蜂王、几百只雄蜂和数千只工蜂组成,工蜂数量巨大,除蜂王和雄蜂共同完成生殖任务,巢内外活动均由工蜂完成,其行为呈现多样性。工蜂发育经过卵、幼虫、蛹、成虫4个阶段,其活动范围由温度、湿度相对稳定的巢内环境发展到复杂的巢外自然环境。随发育阶段和生活环境的变化,工蜂的生理、行为等方面也发生相应变化,这种变化为综合研究生物行为的分子机理提供了可能。又因工蜂数量多、体积较大易于观察、标记、饲养管理简单,而且目前对其形态、发育、生理、分子生物学、神经、社会生态等各方面的研究比较充分,所以工蜂成为研究生物体行为变化、发育机理和个体与群体关系的理想模式生物。该文介绍工蜂活动由巢内发展到巢外时出现的一系列变化以及部分变化的机制,主要包括行为的变化、激素的分泌、代谢活动、飞行能力、神经系统等。 曲宁 邓爱华 孙亮先 徐金森 吴学记关键词:工蜂 3×P3-eCFP基因在中华蜜蜂幼虫中瞬时表达的研究 2012年 本研究用显微注射法将PiggyBacc转座子载体pXL-BacII-ECFP导入中华蜜蜂幼虫,并利用荧光显微镜检测了转基因载体上的报告基因3×P3-eCFP的表达情况。实验结果显示,注射外源DNA 4 h后,eCFP基因在幼虫的注射部位出现微弱蓝色,36 h后检测到强烈的荧光信号,意味着ECFP蛋白已在在蜜蜂幼虫中高水平表达。本研究证实人工启动子3×P3可用于驱动外源基因在蜜蜂细胞中表达。 葛清秀 郑宏 孙亮先 陈怀宇关键词:中华蜜蜂 显微注射 中华蜜蜂抗氧化酶基因的基因组鉴定及其在工蜂行为发育中的表达特征 被引量:1 2014年 根据中华蜜蜂(Apis cerana cerana)基因组序列,鉴定抗氧化酶系统的主要组分,并用RNA-Seq数据分析了工蜂行为发育中抗氧化基因在脑组织中的转录水平.研究表明,共有47个抗氧化基因,包括34个抗氧化酶基因和13个硫氧还蛋白基因.比较东方蜜蜂(Apis cerana)、西方蜜蜂(Apis mellifera)和黑腹果蝇(Drosophila melanogaster)的抗氧化基因,抗氧化酶系统的主要组分在进化上保守,但抗氧化酶基因家族的成员存在物种间差异.如东方蜜蜂和黑腹果蝇的SOD基因家族含3个成员,而西方蜜蜂有2个;果蝇有43个GST基因,而东方蜜蜂和西方蜜蜂仅有14和13个.RNA-seq分析显示,抗氧化基因的表达水平随着工蜂行为发育而发生规律性变化.工蜂脑表达的46个抗氧化基因,约有60%在由内勤蜂(哺育蜂和守卫蜂)转变为外勤蜂(采集蜂和侦察蜂)时明显表达上调,说明外勤蜂脑组织清除活性氧的酶促反应速率更高. 葛清秀 周冰峰 张明丽 孙旭 孙亮先关键词:中华蜜蜂 基因组 抗氧化酶 工蜂 行为发育 羽速性状对番鸭生长速度的影响 被引量:1 2000年 羽速性状对公番鸭生长速度影响不显著 ,快、慢羽公番鸭 0~ 84日龄体重差异不大 (P >0 .0 5) ;慢羽母番鸭 14~ 56日龄体重显著大于快羽母番鸭P <0 .0 1) ,70日龄后 ,两羽型母番鸭体重差异不显著 (P >0 .0 5) .慢羽番鸭饲料利用率略高 ,至 70日龄 ,快、慢羽公番鸭的料肉比为 2 72和2 64,母番鸭为 3.0 4和 2 .92 . 谢进金 孙亮先 黄周英关键词:番鸭 快羽 慢羽 料肉比 蜜蜂表皮蛋白apidermin(apd)基因家族3个新成员的特性鉴定及昆虫APD家族序列特征的分析 被引量:5 2012年 Apidermin(APD)蛋白家族是一个新的昆虫结构性表皮蛋白家族。本研究结合生物信息学和RT-PCR扩增,对意大利蜜蜂Apis mellifera ligustica(简称"意蜂")的apd-1-like,apd-3-like和中华蜜蜂Apis cerena cerena(简称"中蜂")的apd-2等3个新的apd基因的结构特征和表达进行了分析,并分析了昆虫APD蛋白家族的序列特征。结果显示,在西方蜜蜂Apis mellifera(简称"西蜂")中,apd基因家族的6个成员串联排列在基因组序列第4号连锁群上,它们在A.m.ligustica雄蜂头部中的转录水平差异明显,且其启动子序列所含顺式元件也不同。中蜂apd-2和意蜂apd-1-like都含有3个外显子和2个内含子,而意蜂apd-3-like则由4个外显子和3个内含子组成。蛋白序列分析结果显示,目前已知的10条APD蛋白序列N末端均具有相似的信号肽序列,其成熟蛋白分子量为6.0~37.0kD,pI为6.2~10.8。其中西蜂的APD1-3、APD-like和东方蜜蜂Apiscerena的APD-2等5条较短的多肽中疏水氨基酸残基达52%~67%,且Ala含量最为丰富(占25%~34%);而丽蝇蛹集金小蜂Nasonia vitripennis的APD1-3和西蜂APD-1-like,APD-3-like等另外5条APD多肽富含Gly(21%~30%),其序列中疏水氨基酸残基含量为35%~41%。多肽序列多重比对和系统进化分析结果显示,APD家族可划分为2个亚家族。亚家族Ⅰ含有西蜂APD1-3和东方蜜蜂APD-2等4条较短的多肽序列,其N末端为一个长33aa的保守基序;亚家族Ⅱ由另外6条相对较长的多肽序列组成,其N末端保守基序长50aa,C末端保守基序长16aa。本文所描述的APD蛋白家族序列特征有助于以后从其他昆虫中鉴定新的apd基因。 孙亮先 黄周英 郑华军 葛清秀 龚丽萍 陈怀宇关键词:西方蜜蜂 东方蜜蜂 表皮蛋白 生物信息学分析