张银霞
- 作品数:4 被引量:3H指数:1
- 供职机构:西北农林科技大学理学院更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金更多>>
- 相关领域:生物学理学更多>>
- 相邻位点碱基突变的熵性质
- 自然界的生物绚丽多姿,千姿百态,不但不同种属的生物个体之间存在着差异,即使是同一种属的生物不同个体之间也存在着这样那样的不同,即生物具有多样性。生物多样性是一种普遍现象,是生物群体存在和发展的基础;“熵”是其最好的度量。...
- 张银霞
- 关键词:双参数模型生物多样性
- 文献传递
- 选择效率世代指数研究被引量:2
- 2009年
- 【目的】在假定没有突变和迁移等产生新的变异且环境不变的情况下,对数量遗传学中的选择效率问题进行探讨。【方法】根据数量性状改良的选择理论,以各世代的遗传进展与第1代遗传进展之比构建了选择效率世代指数,以度量各世代的选择效果和潜力。【结果】在已知育种群体0世代遗传力的情况下,可计算出该群体各世代的选择效率世代指数:在第1世代时为1,以后世代可由遗传力推算得到。在留种率不变时,不同遗传力对应的选择效率世代指数在前3代变化较快,很快就趋于稳定;在固定低、中、高3种遗传力水平时,不同留种率的群体在第1代的遗传进展随着留种率增大而单调递减,且遗传力水平越高,遗传进展越大,选择效率世代指数也越大。【结论】影响选择效率的主要因素是遗传力,遗传力越大,选择效率越高,且育种群体的选择潜力通常只有2-3代,因此在育种中可引入新的选择反应。
- 曹钻张银霞袁志发郭满才
- 信息熵方法大批量分析成熟体及前体miRNA序列的重要位点被引量:1
- 2009年
- 为了寻找miRNA连续序列上的位点保守性和碱基关联性的证据,本研究通过信息熵分析研究了一些已报告的miRNA和它们前体上的一些重要位点.根据miRNA的来源(动物、植物和病毒)和序列在miRNA前体上的位置(头部和尾部),把得到的数据分为12组.然后通过计算单个碱基信息的冗余度(D1(L))和相邻碱基相关信息冗余(D2(L))的方法来分析这些数据.研究结果表明D2(L)比D1(L)含有更多的信息,尽管在各个组里面D1(L)和D2(L)值的变化基本呈正相关.病毒的前体miRNA比来源于动物和植物的前体miRNA在这些关键位点上更具有保守性.另外,和其他碱基相比,U在所研究的位点中占有很大比例.研究发现在一些组的中间位点(即Dicer酶在前体miRNAs上的剪切位点)十分保守.这个现象表明保守性在miRNAs的成熟过程中很重要,而且可能参与了Dicer酶的识别和剪切过程.以上这些结果从另外一个角度理解了miRNA前体的一级结构.
- 杜江峰武永军张银霞吴磊陶士珩
- 关键词:MIRNA保守性信息熵前体进化
- 相邻位点碱基突变的熵性质
- 2010年
- 为了在分子水平上探讨2相邻位点碱基突变的熵性质,在双参数模型下建立有限长DNA序列2相邻位点碱基突变的微分方程模型,得出了16种碱基组成的概率随世代变化的函数关系式,证明2相邻位点碱基突变具有保熵性,生物是朝着熵增方向即多样性增加的方向进化的;阐明了在单参数模型下相邻位点碱基突变的熵性质亦是如此;该结论也适用于3个相邻位点以及更多相邻位点碱基突变的情况。并利用Matlab软件进行2相邻位点碱基突变的计算机模拟,直观地验证了所得的理论结果。
- 张银霞曹钻袁志发陶士珩
- 关键词:双参数模型生物多样性