李粉霞
- 作品数：18 被引量：58H指数：6
- 供职机构：南方医科大学南方医院更多>>
- 发文基金：广州市科技攻关项目广州市科技计划项目国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：医药卫生天文地球生物学更多>>
- 人酪氨酸激酶6原核表达载体的构建、表达、纯化与鉴定
- 2011年
- 目的构建人络氨酸激酶6(PTK6)与His融合蛋白重组表达载体,在大肠杆菌中诱导表达,并对重组蛋白进行纯化。方法通过PCR在编码PTK6的cDNA序列两端添加EcoR I和BamH I酶切位点,双酶切后将编码PTK6的cDNA序列亚克隆至原核表达载体PHUE构建重组蛋白表达载体PHUE/PTK。重组载体经鉴定后转化大肠杆菌表达菌株BL21(DE3)感受态细胞。IPTG诱导重组蛋白表达。收集菌体裂解后,用尿素洗涤和溶解包涵体。溶解上清经Ni-NTA亲和层析柱纯化,并用SDS-PAGE和Western blotting检测纯化产物。结果成功构建人PTK6重组蛋白原核表达载体,重组蛋白以包涵体形式表达,其相对分子质量为55 000,与预期一致。亲和层析纯化产物的SDS-PAGE和Western blotting鉴定表明获得纯度大于80%的目的重组蛋白。结论人PTK6 His融合蛋白的纯化为多克隆及单克隆抗体的制备以及结构和功能的研究奠定了基础。
- 杨学习谢美娟李欣李粉霞徐伟文李明
- 关键词：表达载体构建纯化
- 江西汉族女性BRCA2基因单核苷酸多态性与散发性乳腺癌易感相关性研究
- 2011年
- 目的：探讨BRCA2基因单核苷酸多态性（SNP）与江西汉族女性散发性乳腺癌易感性的关系。方法：利用Sequenom MassArray iPLEXGOLD系统对江西南昌大学第一附属医院散发性乳腺癌患者152倒和健康对照组165名的BRCA2基因编码区3个单核苷酸多态性位点（rs766173，rs144848．rs1801426）进行基因型检测，非条件Logistic回归分析。结果：rs766173位点基因型和等位基因型频率分布差异均有统计学意义（Х^2=-4．602，P-0．032；Х^2=4．097，P=0．043）。相对TT基因型，TG杂合型与TG＋GG型均能显著性增加乳腺癌发生的危险性，OR值（95％CI）分别为1．971（1．060～3．666）和1．934（1．052～3．555），P分别为0．032和0．034。相对等位基因T，等位基因G为易感等位基因，OR值为1．792（95％C1—1．012～3．172，P=0．045）。另外两个位点rs144848和rs1801426多态性分布频率在乳腺癌组和对照组之间差异无统计学意义。结论：rs766173位点基因多态性与江西地区汉族女性散发性乳腺癌易感性相关，另外两个多态性位点rs144848和rs1801426与江西地区女性散发性乳腺癌易感性无关。
- 李欣胡妮娅杨学习李粉霞徐伟文李明
- 关键词：BRCA2单核苷酸多态性
- 微阵列比较基因组杂交技术与二代基因测序检测拷贝数变异的对比被引量：3
- 2016年
- 目的对比分析微阵列比较基因组杂交技术(array-based comparative genomic hybridization,aCGH)和第二代基因测序技术(next generation sequencing,NGS)在基因组拷贝数变异(copy number variation,CNV)上的一致性,为临床检测CNV提供新的检测方法。方法提取15例流产组织临床样本的基因组DNA,然后分别使用aCGH和NGS 2种方法对上述DNA进行检测,分析对比每个样本的CNV的数目。结果 aCGH共检测到CNV数有109个,最小的片段有16 kb,最大的片段有34 Mb,其中小于200 kb的有20个,大于200 kb小于1 Mb的有34个,大于1 Mb小于5 Mb的有26个,大于5 Mb小于34 Mb的有29个。NGS共检出68个CNV,其中小于200 kb的有3个,检出率为15.0%;大于200 kb小于1 Mb的有22个,检出率为64.7%;大于1 Mb小于5 Mb的有20个,检出率为76.9%;大于5 Mb小于34 Mb的有29个,检出率为100.0%。结论对于目前的数据量来说,NGS在检测大于5 Mb的大片段CNV上检出率较高,与aCGH具有一定的一致性,可以应用于流产组织中CNV的检测。对于小片段的CNV的检测,需要增加相应的读取的数据量进行检测。
- 陈新周王明珠何丹周慧林方欣李粉霞
- 白细胞介素10基因单核苷酸多态性与哮喘遗传易感性的相关性研究被引量：9
- 2010年
- 目的探讨白细胞介素10(IL-10)基因三个单核苷酸多态性位点(rs1800896、rs3024496和rs3024492)与哮喘遗传易感性的相关性。方法应用基质辅助激光解吸附电离飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)平台及MassARRAY-IPLEX技术,分别对广州地区汉族人群中275例正常对照组和302例哮喘患者组IL-10三个单核苷酸多态性位点(rs1800896、rs3024496和rs3024492)进行基因分型并分析两组间分布情况。用2检验统计分析病例组和对照组基因型和等位基因的频率;采用非条件Logistic回归分析,校正性别、年龄影响,计算比数比(OR)和95%可信区间(CI),评价多态性位点与哮喘遗传易感性的相关性。结果①rs1800896位点在广州地区汉族人群中存在GG、GA、AA三种多态性,其总分布频率分别为2.12%、39.65%、58.23%,携带GA杂型者患哮喘的危险性高于AA基因型者。②rs3024492位点在广州地区汉族人群中只存在AA和AT两种基因型,其总分布频率分别为1.22%和98.78%,该位点的多态性与哮喘的易感性无关。③rs3024496位点在广州地区汉族人群中也只存在TT和CT两种基因型,其总分布频率分别为90.59%和9.41%,该位点的多态性与哮喘的易感性无关。结论在IL-10三个单核苷酸多态性位点中,rs1800896与哮喘的易感性显著相关,而rs3024492和rs3024496与哮喘的易感性不相关。
- 杨学习李粉霞李欣孙静哲孙敏英李明
- 关键词：白细胞介素10单核苷酸多态性哮喘
- IL-10、MD-1基因单核苷酸多态性与哮喘易感性的相关性研究被引量：11
- 2010年
- 目的：分析IL-10基因rs1800896、rs3024492位点和髓样分化蛋白1（Myeloid differentiation1,MD-1）基因rs7740529、rs2233128位点单核苷酸多态性（Single nucleotide polymorphism,SNP）与哮喘遗传易感性的相关性以及过敏性鼻炎（Allergic rhini-tis,AR）对哮喘遗传易感性的影响。方法：应用Sequenom MassARRAYSNP分型技术对141例哮喘患者和145例正常对照的四个SNP位点（rs1800896、rs3024492、rs7740529、rs2233128）进行基因分型,再将哮喘患者中确定有过敏性鼻炎和无过敏性鼻炎者分别与正常对照组比较。χ2检验统计分析病例组和对照组的基因型频率;采用非条件Logistic回归校正年龄、性别影响,计算比数比（OR）和95%可信区间（CI）,以此评价各位点多态性与哮喘遗传易感性的相关性以及过敏性鼻炎对哮喘易感性的影响。结果：（1）IL-10rs1800896多态性位点GG、GA、AA三种基因型分布频率在哮喘组、哮喘和过敏性鼻炎共患组、哮喘而无鼻炎组的分布频率和对照组相比,差异均有统计学意义（P〈0.001）,有无过敏性鼻炎对其影响不明显。相较GG或AA基因型,携带基因型GA的个体,哮喘的患病风险明显降低（OR=0.033,95%CI：0.017~0.065）。（2）MD-1rs7740529位点CC、CT、TT三种基因型分布频率在哮喘患者组、哮喘和过敏性鼻炎共患组、哮喘而无鼻炎组的分布频率和对照组相比,差异也均有统计学意义（P≤0.005）,有无过敏性鼻炎对其影响不明显。相比较CC或TT基因型,携带基因型CT的个体,哮喘的患病风险明显降低（OR=0.369,95%CI：0.225~0.606）。（3）IL-10rs3024492位点TA、AA基因型和MD-1rs2233128位点AG、GG基因型在哮喘人群中的分布频率与对照组相比无统计学意义（P〉0.05）。结论：IL-10rs1800896与MD-1rs7740529位点多态性与哮喘的遗传易感性相关,其杂合型的患病风险均明显降低,且有无过敏性鼻炎对其影响不明显。
- 孙敏英李粉霞杨学习李明
- 关键词：IL-10哮喘单核苷酸多态性易感性
- 侧脑室扩张胎儿产前诊断及临床预后
- 2022年
- 目的 探讨侧脑室扩张胎儿的产前诊断及预后,为产前咨询及临床处理提供依据。方法 回顾性分析2017年1月至2020年12月在南方医科大学南方医院妇产科行产前超声提示胎儿侧脑室扩张,并行介入性产前诊断的孕妇223例。根据首次超声检查的侧脑室宽度分为轻度组(10~11.9 mm)、中度组(12~14.9 mm)、重度组(≥15 mm)。根据首次超声诊断胎儿侧脑室扩张时的孕周分为中孕早期(孕18~23+6周)、中孕晚期(孕24~27+6周)、孕晚期(≥28周)。根据是否合并其他异常,分为孤立性侧脑室扩张组和非孤立性侧脑室扩张组,根据累及的侧脑室分为单侧侧脑室扩张组和双侧侧脑室扩张组。根据上述不同分组分析胎儿侧脑室扩张病例的染色体核型、基因芯片结果及妊娠结局。结果 173例纳入病例中,29例(29/173)染色体结果异常,轻度组染色体异常率为12.15%,中重度组为24.24%,差异有统计学意义(P=0.039)。162例(162/173)随访患者中122例分娩,40例引产。经Logistic回归分析,初诊孕周、侧脑室宽度及超声提示其他结构异常等因素对分娩结局有影响,差异有统计学意义(P<0.05)。对分娩的122例婴幼儿进行随访,1例出生后1周因严重脑积水夭折,孤立性侧脑室扩张与非孤立性侧脑室扩张胎儿出生后异常结局发生率比较[16.18%(11/68)vs 50.54%(47/93)],差异有统计学意义(χ^(2)=20.123,P<0.01)。结论 产前侧脑室扩张胎儿的预后受侧脑室宽度、是否伴发染色体异常及是否合并神经系统结构异常等多种因素影响,在排除病毒感染、胎儿染色体或基因异常后,需定期采用超声监测宫内转归情况。
- 谢薇李粉霞朱雯倩刘思平秦霞万丽萍欧美微常清贤
- 关键词：侧脑室扩张产前诊断预后
- VARS2基因单核苷酸多态性和广东汉族女性散发性乳腺癌相关性研究
- 2012年
- 目的探讨VARS2(valyl-tRNA synthetase 2)基因中单核苷酸多态性位点(single nucleotide polymorphisms,SNP)rs2249464与广东省汉族女性散发性乳腺癌的相关性。方法采用MassARRAY-IPLEX SNP分型技术,以南方医科大学南方医院的216例广东汉族乳腺癌患者及216例同期健康体检者为研究对象,对rs2249464多态性位点进行基因分型,利用χ2检验统计分析病例组和对照组的基因型频率有无差异,利用非条件Logistic回归计算比数比(odds ratio,OR)和95%可信区间(confidence interval,CI)来评价此位点多态性与乳腺癌的相关性。然后进一步将病例组按雌激素受体(estrogen receptor,ER)和孕激素受体(progesterone receptor,PR)免疫组化结果行分层分析。结果 rs2249464位点C/C,C/T,T/T 3种基因型分布在对照组和病例组之间有统计学差异。根据免疫组化情况进一步分层分析结果表明rs2249464的基因型分布在ER阳性/阴性组之间的差异无统计学意义(P>0.05);但在PR阳性/阴性组之间的差异有统计学意义(P<0.05)。结论 VARS2基因rs2249464位点单核苷酸多态性与广东汉族散发性乳腺癌的易感性具有相关性,且携带T/T基因型的患者更容易罹患PR阴性乳腺癌。
- 黄传蔷杨学习李粉霞刘民锋郭昭泽董建宇叶长生
- 关键词：单核苷酸多态性乳腺癌雌激素受体孕激素受体
- 广东汉族女性TAP2基因单核苷酸多态性与散发性乳腺癌相关性研究被引量：2
- 2011年
- 目的:探讨TAP2(Antigen Peptide Transporter 2)基因单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNP)与广东汉族女性乳腺癌发生的相关性。方法:利用Sequenom系统对来自南方医科大学南方医院的216例广东汉族乳腺癌患者及216人健康对照组的TAP2中两个单核苷酸多态性位点chr6-32914099和chr6-32897933进行基因分型,并利用非条件Logistic回归进行统计分析,以95%置信区间(confidence interval,CI)的比值比(odds ratio,OR)评价多态性位点与乳腺癌的相关性。在此基础上,根据临床资料中雌激素受体(Estrogen Receptor,ER)和孕激素受体(Progesterone Receptor,PR)进行分层分析。结果:chr6-32914099位点在检测人群中存在TT、TC、CC三种多态性,chr6-32897933位点存在CC和CT两种多态性。chr6-32914099位点多态性分布在病例/对照的分布无显著性差异(P=0.36),但在ER阳/阴性分组和PR阳/阴性分组中有显著性差异,与纯合基因型相比,TC基因型和ER阴性及PR阴性乳腺癌都相关(P=0.029和P=0.038)。相对于CC纯合基因型,chr6-32897933位点TC基因型患乳腺癌的风险性增加(P=0.0001),但基因型分布在ER阳/阴性分组和PR阳/阴性分组中无显著性差异(P=0.59和P=0.46)。结论:TAP2多态性位点chr6-32897933 TC基因型患乳腺癌的风险性增加,而chr6-32914099等位基因杂合状态(TC基因型)与ER阴性及PR阴性乳腺癌相关。
- 黎佩怡李粉霞孙敏英徐伟文杜红延杨学习
- 关键词：TAP2单核苷酸多态性乳腺癌易感性
- LTA基因单核苷酸多态位点与胃癌易感性的研究被引量：3
- 2011年
- 目的通过对江西地区汉族胃癌患者和正常人群中淋巴毒素-α（LTA）基因单核苷酸多态（single nucleotide polymorphism,SNP）位点rs909253基因型的检测,探讨rs909253位点与胃癌患者易感性的关系。方法利用Sequenom-MassArray-IPLEX检测194例胃癌和250例对照LTA基因多态位点rs909253的基因分型,并利用非条件logistic回归对检测结果进行相关统计。结果 LTA rs909253多态位点GG、GA、AA三种基因型在胃癌的频率分别为26.4%、52.0%和21.6%,与对照组（35.6%、46.4%和18.0%）相比,统计学上无显著意义（χ2=4.403,P=0.111）;但胃癌组和正常组的等位基因频率分布差异临近显著,P值达0.059;对年龄和性别进行校正后,携带等位基因G的胃癌发病风险有所增加（OR=1.315,95%CI：1.001~1.728）。结论江西汉族人群胃癌的遗传易感性可能与LTA基因rs909253位点的单核苷酸多态性有关,G等位基因为其发病的危险因素。
- 何选秋李粉霞杨学习
- 关键词：单核苷酸多态性胃癌
- HLA-Ⅰ基因单核苷酸多态性与中国南方汉族女性乳腺癌易感性的相关性研究被引量：3
- 2012年
- 目的:探讨位于白细胞抗原复合体基因HLA-Ⅰ区域的17个单核苷酸多态性位点与中国南方汉族女性乳腺癌易感性的相关性。方法:应用Sequenom MassArray iPLEX检测系统对所选位点在267例乳腺癌患者和274例健康对照女性中进行基因分型分析。χ2检验分析各位点基因型分布频率在病例组和对照组中的差异,非条件Logistic回归评价多态性位点与乳腺癌遗传易感性的相关性。另外,根据临床治疗中癌组织ER、PR和HER-2状态进行分层分析。结果:所选位点在中国南方汉族女性中均存在多态性,其中rs9260682遗传多态性与乳腺癌易感性显著相关,与AA基因型相比,AT基因型可增加携带者乳腺癌的患病风险(P=0.04),且与HER-2阴性乳腺癌相关(P=0.04);rs9260734位点多态性分布在病例-对照分组中无显著性差异(P=0.25),但AA基因型与PR阴性乳腺癌相关(P=0.048);其余位点与乳腺癌易感性、ER、PR和HER-2状态均无显著相关性。结论:位于HLA-Ⅰ基因区域的多态性位点rs9260682既与乳腺癌易感性相关,又与HER-2阴性乳腺癌相关,而rs9260734位点的AA基因型与PR阴性乳腺癌相关。
- 佟琳杨学习李粉霞孙敏英刘民锋董建宇郭昭泽叶长生
- 关键词：单核苷酸多态性乳腺癌易感性
