汪小我
- 作品数:32 被引量:89H指数:4
- 供职机构:清华大学更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金国家重点基础研究发展计划国家重点实验室开放基金更多>>
- 相关领域:生物学医药卫生自动化与计算机技术理学更多>>
- 基于细胞—计算机交互的细胞控制方法被引量:1
- 2021年
- Wiener在控制论(Cybernetics)中强调了两大类控制对象:机器与动物.半个世纪以来,机器控制领域已形成一套较为完备且先进的控制理论,而在生物控制方面,由于生物系统的特殊性和复杂性,对生命的基本组成单位—细胞的控制仍然进展缓慢.近年来,随着合成生物学技术的发展,基于细胞—计算机交互的胞外控制手段开始引起研究者们的关注,为细胞控制带来了前所未有的机遇.胞机交互的方式能够适应生物系统的特殊性,发挥计算机控制的优势,实现细胞的自动化实时控制,为人类研究细胞内部基因调控机制与其他各项生命活动提供了大量的数据与方法支持.本文根据目前基于胞机交互的细胞控制工作,归纳与总结了胞机交互中常用的生物学工具以及控制算法,分析了细胞控制的特殊性与难点,指出研究实现细胞智能控制的可行性与重要性.
- 颜钱明张鹏程乔榕古槿汪小我
- 关键词:反馈控制合成生物学
- 外周血中癌症检测的核糖体DNA甲基化标记物及其应用
- 本发明提供了外周血中癌症检测的核酸体DNA甲基化标志物及其应用。这些标记物包括选自以下CpG位点中的至少一个:以人核糖体DNA重复片段单元参考序列U13369.1为基准,第38974,37148,37013,37028,...
- 汪小我张祥林方欢
- 文献传递
- 抗衰老药物对线虫生存曲线影响的荟萃分析
- 2015年
- 随着世界人口老龄化步伐的加快,衰老机制及抗衰老药物的研究日益成为生物医学领域的热点前沿之一.国内外已有大量研究报道抗衰老药物能够延长多种模式生物包括线虫、果蝇、小鼠、大鼠及灵长类等的寿命,然而,这些药物延缓衰老方式的差异仍缺乏系统研究.因此,本研究以衰老研究的热点模式生物线虫为对象,搜集1990年以来国内外刊物上正式发表的有关抗衰老药物寿命试验的研究文献及其涉及的生存曲线,利用荟萃分析比较了不同抗衰老药物与生存曲线变化类型间的关系,并结合药物的药理作用探讨其延寿机制.生存曲线特征聚类结果与药物生物学分类交叉分析结果表明,药理作用类型与增益类型具有很强相关性,提示这2种分类方法的结果是匹配的.抗氧化剂类药物和控制血糖类药物对生存曲线的改善总体增益虽然不是最高,但相对于正常组生存曲线其增益部分呈平移形,表明该类药物可以通过改善年龄结构对整个群体产生显著增益,且其衰老曲线的特征与自然衰老相似.抗癫痫药物及胃肠道菌群相关药物总体增益较大,其曲线增益形状呈梯形,提示该类药物(尤其是胃肠道菌群相关药物)尽管显著延长了少数个体的最大寿命,但是从整个群体来看,大多数个体寿命延长程度并不明显,受益的少数个体可能需要较长的外界资源支持方能保持较长时间的存活状态,这种模式既不大众化也不经济.综上所述,清除自由基和控制血糖类药物对健康老年有着更为积极合理的作用与效应.
- 梁亚茹刘畅王卓然董琼叶汪小我王钊
- 关键词:衰老抗衰老线虫药物
- 从生物大数据到知识大发现:十年进展与未来展望被引量:3
- 2016年
- 生物和医疗大数据的快速大量积累是当今生命科学领域的一个重要特征,但从这些大数据能否获得关于生命现象规律的重大知识发现,是人们更关心的关键问题,也是2005年Science杂志展望的125个最具挑战性问题之一.本文从新一代DNA测序技术发展以及医学遗传学、合成生物学、精准医学、微生物组学等几个方面,回顾了近十年来生物大数据的重要发展和已经由此带来的科学进步,并对未来的发展方向进行了展望.
- 张学工江瑞汪小我古槿陈挺
- 关键词:基因组学生物信息学系统生物学
- 人类智能的基因调控机理
- 2018年
- 问题描述以各种深度神经网络为核心的深度学习方法引领了人工智能研究与应用的新高潮。深度神经网络的基础是对人类神经系统中神经细胞(神经元)之间相互连接的认识,是在细胞层面上对自然神经系统的简化模拟。
- 张学工江瑞汪小我
- 关键词:人类智能基因神经细胞神经系统人工智能
- A systems biology study of cellular senescence gene regulatory networks
- Cellular senescence refers to an irreversible cell-cycle arrest program that cell permanently loses proliferat...
- 汪小我
- 通过合成基因线路实现细胞分类
- 2018年
- 合成生物学是生物学与工程学结合的新兴学科,通过人工将生物元器件组合成线路引入细胞,使细胞获得对信息进行处理并做特定输出的新功能。近年来,针对疾病治疗的合成生物学研究发展迅猛,基因线路的工程化特性使通过它对疾病进行更精确、灵活的干预成为可能,在基因治疗中有广泛的应用前景。精确干预的前提是综合多种输入信号并识别出特定种类的细胞,如特异性识别出癌细胞的溶瘤病毒。疾病的发生往往伴随着细胞内多种调控网络的改变,从中提取出关键信号分子作为基因线路的输入至关重要。现综述哺乳动物细胞中对不同的信号输入进行感知的基因线路细胞分类器,为未来模块化整合信号输入、设计基因线路提供新的思路。
- 胡冠华王也魏磊魏磊
- 关键词:基因治疗合成生物学
- 神经网络提取调控DNA组合模式的训练和可视化方法及系统
- 本发明公开了一种神经网络提取调控DNA组合模式的训练和可视化方法及系统,该方法包括:获取具有特定功能的DNA序列和不具有特定功能的DNA序列;对两种DNA序列进行标注,并将具有特定功能的DNA序列和不具有特定功能的DNA...
- 汪小我魏征
- microRNA相关问题的计算分析
- microRNA(miRNA)是一类长度约为22个核苷酸的内源性非编码RNA,它在动植物的生长发育等生命过程中起着重要的调控作用。近年来,miRNA的相关研究受到广泛关注,研究人员对miRNA在疾病的研究、诊断和治疗等方...
- 汪小我
- 关键词:MICRORNA进化转录调控
- 利用血浆游离核酸检测癌症的深度学习方法和系统
- 本发明公开了一种利用血浆游离核酸检测癌症的深度学习方法和系统,其中,方法包括以下步骤:通过使用核酸分子级别分辨率的甲基化状态数据定义癌症特异的差异甲基化区间,从而达到富集分子分辨率级别的信息的效果;使用深度学习模型整合核...
- 汪小我李嘉琦魏磊
- 文献传递