王晓花
- 作品数：4 被引量：4H指数：1
- 供职机构：内蒙古大学物理科学与技术学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金国家教育部博士点基金更多>>
- 相关领域：生物学更多>>
- 古菌基因组AUG的缺失：一种避免错误起始的机制
- 本文选取21个古菌基因组中作为研究对象。截取基因组中每一个基因起始密码子上游200bp的序列并且形式地引入3个阅读框架：阅读框1(RF1)、阅读框2(RF2)、阅读框3(RF3)。阅读框1与基因的阅读框架是一致的。分别计...
- 钟智李宏王晓花
- 关键词：起始密码子
- 文献传递
- 大肠杆菌翻译起始调控的多样性
- 本文以大肠杆菌为例，从已确定含有SD序列的部分基因出发，用自洽聚类方法预测基因的SD序列，并对SD序列进行强弱排序;然后从核糖体的二级结构和高级结构出发，用简单相关分析预测可能与翻译起始调控序列结合的16S rRNA片段...
- 王晓花
- 关键词：大肠杆菌生物信息学SD序列
- 文献传递
- 古菌起始密码子上游AUG和UAA三联体的频率分布被引量：1
- 2008年
- 分析了三联体AUG和UAA(包括UAG和UGA)在古菌基因组起始密码子上游序列的三个阅读框中的频率分布.在阅读框1,三联体AUG在起始密码子上游有非常明显的缺失.与AUG的缺失相反,三联体UAA的频率在起始密码子上游显著增加.与细菌和真核生物基因组比较发现,古菌基因组的上述特征与细菌十分相似.在古菌基因组起始密码子上游序列中,三联体AUG的缺失和UAA频率的增加可以有效地避免古菌基因被错误的翻译起始,提高翻译效率.
- 钟智李宏王晓花
- 关键词：翻译起始
- 自洽聚类法识别大肠杆菌SD序列被引量：3
- 2008年
- 用自洽聚类方法判定大肠杆菌蛋白质编码基因SD序列强弱,给出构成强SD序列的17种碱基关联模式.将全部SD序列按作用强弱不同分为三类:强、中、弱,发现强弱不同时最偏好模式不同,如GGAGG是弱SD序列的最偏好模式,AAGGA是强SD序列的最偏好模式.同一模式距起始密码子的距离不同时,所起的调控作用也不同,如GGAG模式中的A在强SD序列中位于-8位点,在弱SD序列中位于-7和-9位点.平均来说,各SD序列的-9位点上碱基G出现的概率最大.结果还表明SD序列越强,基因的表达水平越高,SD序列越弱,基因表达水平越低.SD序列与an ti-SD序列的配对程度和相对位置影响起始密码子的识别和翻译效率.
- 王晓花李宏
- 关键词：大肠杆菌SD序列基因表达水平
