胡静
- 作品数：3 被引量：28H指数：3
- 供职机构：安徽师范大学生命科学学院更多>>
- 发文基金：安徽省优秀青年科技基金国家自然科学基金北京市自然科学基金更多>>
- 相关领域：生物学更多>>
- 菜粉蝶线粒体基因组的全序列测定和分析被引量：19
- 2010年
- 目前关于蝶类线粒体基因组全序列及其分子进化的研究还不多见。本研究通过长PCR和引物步移法对菜粉蝶Pieris rapae Linnaeus线粒体基因组全序列进行了测定和初步分析。结果表明:菜粉蝶线粒体基因组全长15157bp,包含13个蛋白编码基因、22个tRNA和2个rRNA基因以及1个非编码的控制区域,它们的长度分别是11196bp,1474bp,2093bp和393bp。37个基因的位置与已报道的其他蝶类基本一致,共有10对基因间存在总共59bp的重叠,重叠碱基数在1～35bp之间;基因间隔序列共计13处120bp,间隔长度1～46bp不等,最大的基因间隔46bp,位于tRNAIle和tRNAGln基因之间。另外,基于13个蛋白质编码基因的氨基酸序列,重建了基于蛋白质编码基因序列数据的11种代表性蝶类的NJ和MP系统树。结果表明:凤蝶类(包括凤蝶和绢蝶)为一大支系,粉蝶类、灰蝶类与蛱蝶类(包括蛱蝶、珍蝶)构成另一大支系。结果不支持粉蝶科与凤蝶科(包括凤蝶类和绢蝶类)构成单系群,却显示粉蝶科、灰蝶科和蛱蝶科的组合为单系群。
- 毛增辉郝家胜朱国萍胡静司曼曼朱朝东
- 关键词：鳞翅目粉蝶科菜粉蝶线粒体基因组RNA二级结构
- 大卫绢蛱蝶线粒体基因组全序列测定和分析被引量：14
- 2011年
- 目前有关蝶类线粒体基因组全序列及其分子进化的研究报道还不多见。本文利用long PCR和引物步移法得到大卫绢蛱蝶Calinaga davidis的线粒体基因组全序列,同时就其基因组成和结构特点作了初步分析。结果显示：其基因组全长为15 267 bp（GenBank登录号为HQ658143）,包括13个蛋白质编码基因（ATP6,ATP8,COI-III,ND1-6,ND4L,Cytb）、22个tRNA基因、2个rRNA基因（16S和12S）以及非编码的控制区。与其他鳞翅目昆虫相一致,其基因组未出现基因重排现象。基因组共包含11个基因间隔区,总长度为130 bp,间隔长度1~46 bp,最大间隔在tRNAGln与ND2基因之间;基因间共存在13处重叠,总长度为66 bp,重叠碱基数1~35 bp,最长的重叠区位于COII与tRNALys基因。lrRNA和srRNA基因长度分别为1 337 bp和773 bp;除tRNASer（AGN）缺少二氢尿嘧啶臂（DHUstem）,在相应的位置上只形成一个简单环外,其余的tRNA基因都能形成典型的三叶草结构。13个蛋白编码基因总长度为11 247 bp,共有3 737个密码子,它们的碱基组成和密码子的使用具有明显的偏倚性;除COI外（起始密码子TTG）,其余的12个蛋白质编码基因都以标准的ATN作为起始密码子;COI基因终止密码子为不完全T,ND4基因终止密码子为不完全TA,其余基因都以TAA为终止密码子。A＋T丰富区全长为389 bp,A＋T含量高达92.0%,其中存在2段类似微卫星的重复序列（TA）6和（AAT）4。本文的研究结果为探讨绢蛱蝶亚科在蛱蝶科中的系统学地位及其与其他亚科间的系统发生关系等问题提供了重要的分子生物学数据。
- 夏靖胡静朱国萍朱朝东郝家胜
- 关键词：鳞翅目线粒体基因组串联重复序列
- 斐豹蛱蝶线粒体基因组全序列的测定和分析(英文)被引量：12
- 2011年
- 该研究对斐豹蛱蝶(Argyreus hyperbius)(鳞翅目:蛱蝶科)线粒体基因组全序列进行了测定和初步分析。结果表明:斐豹蛱蝶线粒体基因全序列全长为15156bp,包含13个蛋白质编码基因、22个tRNA和2个rRNA基因以及1个非编码的A+T富集区,基因排列顺序与其它鳞翅目种类一致;线粒体全序列核苷酸组成和密码子使用显示出明显的A+T偏好(80.8%)和轻微的AT偏移(AT skew,?0.019)。基因组中共存在11个2～52bp不等的基因间隔区,总长96bp;以及14个1～8bp不等的基因重叠区,总长34bp。除COI以CGA作为起始密码子外,13个蛋白质编码基因中的其余12个基因是以ATN作为起始密码子。除COI和COII基因是以单独的一个T为终止密码子,其余11个蛋白质编码基因都是以TAA结尾的。除了缺少DHU臂的tRNASer(AGN),其余的tRNA基因都显示典型的三叶草结构。tRNA(AGN)和ND1之间的基因间隔区包含一个ATACTAA结构域,这个结构域在鳞翅目中是保守的。A+T富集区没有较大的多拷贝重复序列,但是包含一些微小重复结构:ATAGA结构域下游的20bp poly-T结构,ATTTA结构域后的(AT)9重复,以及位于tRNAMet上游的5bp poly-A结构等。这项研究所揭示的斐豹蛱蝶的线粒体基因组特征,不仅为认识蛱蝶科的遗传多样性贡献数据,而且对于该物种的保护生物学、群体遗传学、谱系地理及演化研究等具有重要意义。
- 王晓灿孙晓燕孙倩倩张大秀胡静杨群郝家胜
- 关键词：蛱蝶科鳞翅目线粒体基因组
