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草莓SBP基因家族生物信息学初步分析被引量：8: 2012年; 为了研究草莓SBP基因家族的功能,利用多种生物信息学软件,对SBP蛋白序列的系统发生和基因组定位进行分析,对其氨基酸组成成分、理化性质以及二、三级结构进行分析和预测等。结果表明草莓16条SBP蛋白序列与拟南芥16条SBP蛋白序列一起分成了3个亚族,说明拟南芥与草莓SBP基因间具有较高的保守性。基因组定位发现16个SBP基因分布在6条染色体上。研究还发现不同亚族间氨基酸数目、氨基酸序列间的疏水性存在一定的差异,而它们的二级结构主要以随机卷曲为主,三级结构相似。SBP基因家族在植物的生长、发育等多个方面起重要作用,笔者实验结果为草莓SBP基因家族的进一步功能分析提供了重要研究基础。; 葛安静张春华董清华赵密珍宋长年张希; 关键词：草莓拟南芥生物信息学

利用高通量测序发现草莓中保守的和新的microRNAs: MicroRNAs(miRNAs)是近年来新发现的一类非编码蛋白的18～25 nt单链小分子RNA,它通过介导靶基因的裂解或抑制靶基因的翻译从而在调控植物生长发育、激素信号及环境胁迫等方面起重要作用。为了大规模地发现草莓...; 葛安静张希董清华宋长年; 关键词：草莓 MICRORNAS 果实发育; 文献传递

干旱胁迫对4个刺柏品种抗旱生理指标的影响被引量：5: 2011年; 以4个刺柏品种Junipenus scopulorum(代号1)、J.sabina(代号2)、J.ehinencis(代号3)、J.scopulorum var.(代号4)为研究对象,采用聚乙二醇(PEG-6000)模拟不同程度的干旱胁迫,测定其在不同干旱胁迫下,可溶性糖含量、可溶性蛋白含量、叶片质膜相对透性及相对含水量的变化。结果表明,随着干旱程度加深,相对含水量下降,可溶性糖、细胞膜相对透性增加,可溶性蛋白在低浓度胁迫时含量有所增加,高浓度胁迫时含量下降;相关分析结果显示可溶性蛋白与叶片的相对含水量之间存在极显著的负相关性,与相对电导率之间存在极显著的正相关性;可溶性糖和叶片内的相对含水量之间存在极显著的正相关性,叶片的相对含水量和电导率之间呈显著的负相关性;运用灰色关联分析方法综合评价4个刺柏品种之间的抗旱性能力的大小为2>3>1>4。; 刘华张玉平葛安静潘青华; 关键词：刺柏水分胁迫抗旱性

草莓EST-SSR标记开发及在品种遗传多样性分析中的应用被引量：38: 2011年; 【目的】探讨草莓EST序列中SSR位点的分布规律,开发草莓EST-SSR引物,并分析其在草莓品种遗传多样性研究中的应用。【方法】从NCBI公共数据库下载草莓表达序列标签(expressed sequence tag,EST)55 750条,利用MISA软件查找SSR位点,并利用Primer3.0 Plus软件设计60对引物,通过非变性聚丙烯酰胺凝胶(PAGE)研究这些SSR引物的PCR扩增特点,并对部分扩增产物进行克隆和测序,以验证其真实性。【结果】55 750条草莓EST序列含有SSR位点的序列1 334条,SSR位点1 490个。其中,二核苷酸、三核苷酸和六核苷酸重复是最主要的SSR类型,分别占36.17%、26.51%和19.87%。60对引物中有42对引物能在20个草莓品种中扩增出理想的PCR产物,其中36对引物扩增条带具有多态性。利用11对验证的EST-SSR引物分析了20个草莓品种的亲缘关系。【结论】草莓EST-SSR标记的开发对于草莓品种鉴定与遗传多样性分析具有重要应用价值。; 董清华王西成赵密珍宋长年葛安静王静; 关键词：草莓 EST SSR

草莓ABA结合蛋白基因的克隆及序列分析被引量：1: 2011年; 为进一步研究ABA结合蛋白在草莓抗逆性方面的作用,通过CTAB法提取五叶草莓总DNA,根据NCBI数据库中的ABA结合蛋白受体的基因序列信息,设计特异引物,克隆得到ABA结合蛋白基因,命名为FpCHLH。序列分析表明该基因全长4426bp,编码1393个氨基酸,核苷酸序列比对表明,该序列与GenBank中其他物种的CHLH序列有极高的同源性,核苷酸序列比较相似率在77%~90%,氨基酸相似性在63%~73%。; 刘雅萍张希葛安静董清华; 关键词：草莓

不同草莓CHLH基因序列及其内含子信息差异分析被引量：1: 2012年; Mg^(2+)螯合酶H亚基(CHLH)是一种ABA特异性结合蛋白。为进一步研究ABA结合蛋白在抗逆性方面的作用,利用GenBank数据库中草莓Mg2+螯合酶H亚基基因CHLH的cDNA序列(登录号为HQ829473)信息,采用同源克隆法从3种不同草莓品种栽培八倍体‘红颜’草莓、野生二倍体森林草莓和野生二倍体五叶草莓叶片中克隆获得了CHLH基因DNA序列。基因结构分析表明,CHLH包含有个5个外显子和4个内含子,4个内含子的变化范围为109～486bp,其中五叶草莓的第2个和第4个内含子序列上不同于另外2种。内含子参与基因表达调节,说明五叶草莓可能在内含子调控作用上有不同之处。; 张希葛安静董清华; 关键词：草莓

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葛安静