邓亚军
- 作品数：14 被引量：97H指数：5
- 供职机构：西安交通大学更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金教育部科技基础资源数据平台建设项目陕西省科技攻关计划更多>>
- 相关领域：医药卫生生物学政治法律农业科学更多>>
- 突发灾难遇难者个体识别技术规范化的研究
- 邓亚军
- 关键词：法医鉴定学尸体检验骨骼线粒体
- SARS相关病毒(BJ01株)的全序列及其比较分析被引量：23
- 2003年
- 严重急性呼吸综合征(SARS)是一种新发现的急性传染病。对一株已确认为SARS病原体的冠状病毒(BJ01)进行了全基因组序列测定,并与其他已知病毒进行了比较分析。该病毒基因组全长为29.725kb,含11个可读框(ORFs),由1个稳定区和1个可变区组成,其中稳定区编码RNA依赖性RNA聚合酶,包括两个ORFs;可变区含有4个蛋白质编码序列(CDSs),分别编码病毒的4个结构蛋白(S,E,M,N蛋白)。此外,可变区还包括5个非典型的预测蛋白(PUPs)。此病毒基因的排列顺序与其他已知的冠状病毒一致。通过与已知RNA病毒的序列比对,可以确认该病毒属于冠状病毒科(Coronaviridae)。与GenBank中已知的5个SARS相关病毒全基因组序列的比较分析显示,已在30个核苷酸位置上检出序列差异,总体突变率为0.1％,其中15个变异位点在编码区,可能会导致蛋白质的氨基酸改变(异义突变)。S蛋白中已发现3处可能引起该蛋白质物化特征变化的变异,而该蛋白质可能参与病毒与宿主间的免疫反应.与病毒包膜形成相关的M蛋白中则已发现两处氨基酸变化。进化分析表明,SARS病毒可能不是来源于人类,但没有证据证明是人为制造的。为了阐明SARS相关病毒的病因学以及排除其他可能的SARS病原体的存在,仍需进行更深入的研究。
- 秦鄂德祝庆余于曼范宝昌常国辉司炳银杨保安彭文明姜涛刘伯华邓永强刘洪张雨王翠娥李豫川甘永华李晓萸吕富双谭刚曹务春杨瑞馥汪建李蔚徐祖元李彦吴清发林伟陈维军唐琳邓亚军韩玉军李昌峰雷蒙李国庆
- 关键词：冠状病毒基因组系统发生学
- 北京地区人群HLA-A、B、DRB1的聚合酶链反应-直接测序分型研究被引量：23
- 2006年
- 目的调查北京人群人类白细胞抗原(humanleukocyte antigen,HLA)-A、B、DRB1的基因多态性,获得完整准确的遗传学数据。方法应用聚合酶链反应-直接测序分型(polymerase chain reaction se-quence-basedtyping,PCR-SBT)法对北京地区人群中618名健康无关个体进行HLA-A、B、DRB1基因座高分辨分型。结果检出HLA-A、B、DRB1的基因型数和等位基因数分别为199和84、366和143、286和122,这3个基因座分布均符合Hardy-Weinberg平衡定律(P>0.05)。结论从基因水平分析了北京地区HLA-A、B、DRB1基因座的群体分布特征,提供了一套比较完整准确的HLA-A、B、DRB1等位基因频率、基因型频率,为器官移植的供体选择、法医学个体认定、HLA与疾病相关性及人类学等研究提供了重要的参考数据。
- 邓亚军杨光吴东颖胡松年李生斌朱军朱波峰刘耀
- 关键词：人类白细胞抗原-ADRB1基因频率
- 猪脂肪EST大规模测序及分析
- 该文利用大规模DNA序列测定的方法,对猪脂肪组织进行了EST序列测定和初步的分析.猪脂肪大规模EST序列共测定了10860个单向单次测定反应,所处理的总克隆数达到了8,730,421个碱基,成功反应数为9297（85.6...
- 邓亚军
- 关键词：表达序列标签测序相容性抗原免疫反应
- 文献传递
- 中国华北地区汉族人群HLA两基因座的PCR-SBT分型
- 2006年
- 杨光邓亚军胡松年吴东颖李生斌王振原朱波峰朱军刘耀
- 关键词：法医物证学汉族
- 中国纳西族STR遗传结构研究被引量：24
- 2002年
- 采用荧光标记STR基因扫描技术对纳西族进行了STR多态性调查。 9个STR基因座在纳西族群体中 ,检出72个等位基因、16 5种基因型 ,其频率分布在 0 .0 0 5 2～ 0 .5 2 0 8和 0 .0 10 4～ 0 .30 2 1。χ2 检验表明 ,各基因座的基因型分布符合Hardy Weinberg平衡定律 (P >0 .0 5 )。统计学结果显示 ,这些遗传标记在纳西族群体中 ,H均大于 0 .6 ,平均PIC高于 0 .7,平均DP在 0 .8以上 ,EPP也都超过了 0 .5。
- 赖江华张保华郑海波朱波峰邓亚军李生斌
- 关键词：STR遗传多态性纳西族
- 猪脂肪组织表达序列标签 (ESTs)大规模测序及分析被引量：5
- 2004年
- 利用大规模DNA序列测定的方法 ,对猪脂肪组织进行了表达序列标签 (ExpressedSequenceTag ,EST)序列测定 ,获得高质量EST共 7790个 ,并对此进行了初步分析。使用STACK_PACK软件进行聚类分析 ,得到 4 35 4个基因聚类 ,包括 36 0 9个单拷贝基因和 74 5个多拷贝基因 ;将候选基因序列用BlastN与nr库进行比较 (e =1e 10 ) ,从 4 35 4个候选基因中得到 2 712个已知基因 ,其中单基因为 1987个 ,多拷贝基因为 72 5 (36 94克隆 )个 ;未知功能基因和新EST有 2 10 9个克隆。根据BlastN结果 ,利用基因组文库添加序号 (GenBankAccessionNo .)为索引 ,构建了猪脂肪组织已知功能基因表达谱。从基因表达谱可以看出 ,在猪脂肪组织中参与代谢的基因所占比例最高 ,在某些方面也显示了脂肪组织旺盛的代谢活性。同时发现在猪脂肪组织中主组织相容性抗原 (MajorHistocompatibilityComplex ,MHC)或与MHC相关的基因表达丰度很高。其中单拷贝基因 181个 ,多拷贝基因 4 4个 ,共计 2 5 7个克隆 ,占细胞机体防御 (cellandorganismdefense)总数的 4 4 9%。占总已知基因数的 5 4 %。提取出全部与MHC相关的EST序列 (2 5 7个克隆 ) ,发现所有EST的部分序列 (长约 2 0 0个碱基 ) ,几乎分布在每一个已知猪BAC的所有编码序列上。据此推测 ,
- 邓亚军童维陈雁炯胡松年李生斌
- 关键词：表达序列标签测序MHC基因
- PCR-SBT法检测北京地区人群HLA-DRB1遗传多态性被引量：4
- 2005年
- 目的调查北京地区人群HLA-DRB1基因座多态性,并探讨HLA的聚合酶链反应-直接测序分型(PCR-SBT)在法医物证学中的应用价值。方法应用PCR-SBT分型方法对北京地区人群中494名健康无关个体进行HLA-DRB1基因座高分辨分型。结果检出233种HLA-DRB1基因型、102种DRB1等位基因型,基因型的分布符合Hardy-Weinberg平衡定律,该位点的观察杂合度(Ho)为0.9210,期望杂合度(He)为0.9342,多态信息量(PIC)为0.9333,匹配概率(Pm)为0.0104,个体识别率(DP)为0.9896,非父排除率(PPE)为0.7776。结论使用PCR-SBT对HLA进行精确分型在法医学领域具有重要的应用价值。
- 邓亚军杨光吴东颖胡松年李生斌朱波峰朱军刘耀
- 关键词：HLA-DRB1基因频率PCR-SBT法医学
- 家猪百日胚胎胸腺的基因表达谱被引量：1
- 2003年
- 目的 :构建家猪 1 0 0d胚胎胸腺基因表达谱 ,为研究胸腺的发育和分化机制奠定基础 .方法 :随机挑取家猪1 0 0d胸腺cDNA文库 (FTY)的 1 1 71 2个克隆 ,进行单向全自动大规模测序 ,去污染后共获得 70 71个高质量的表达序列标签 (EST)用于基因表达分析 .结果 :对 70 71个高质量EST的聚类分析结果获得 95 9个多拷贝基因和 30 74个单拷贝基因 .与非冗余的核酸数据库、Swiss Prot数据库及人、牛和鼠的U nigene数据库进行BLAST ,发现 80 6个多拷贝基因和 1 6 6 9个单拷贝基因 (共计 5 4 4 2个ESTs)与已知序列有同源性 ,1 6 2 9个EST没有发现同源序列被认为是新基因 .根据功能将已知基因归为 7类 ,其中基因表达相关基因占 36 .99% ,胸腺特异的防御功能相关基因有一定程度表达 (占 7.5 5 % ) ,这与人婴儿胸腺基因表达谱相类似而不同于成年人胸腺组织 .将 1 0 9个既发现有ORF又具有PolyA的多拷贝新基因与人类基因组框架序列进行BLAST ,发现其中 5 8个有同源序列 .结论 :EST技术是发现新基因的有效手段之一 ;此期家猪胸腺仍处于发育阶段 .
- 陈艳炯邓亚军叶琳耿佳宁李生斌
- 关键词：EST
- 中国青海藏族、汉族mtDNA控制区遗传多态性被引量：2
- 2008年
- 目的研究中国青海藏族、汉族mtDNA控制区遗传多态性。方法收集69份青海藏族和青海汉族无关人群外周血样本,对其mtDNA控制区进行序列分析,计算多个多态性指标,结合其他民族mtDNA遗传资料,根据Nei法计算包括青海藏族和汉族群体在内的11个群体之间的Fst和Rst遗传距离,进行聚类分析,绘制系统发生树。结果在青海藏族和汉族群体mtDNA控制区中分别发现56和59个多态性位点。Rst遗传距离显示青海藏族人群与各人群之间遗传距离均较远(P<0.05);青海汉族人群与西安汉族、蒙古族、长沙汉族等人群之间距离较近(P>0.05)。结论我国青海藏族和汉族人群mtDNA具有相对独特的遗传特征,其遗传多态性和个体识别力较高,可用于民族起源、迁徙、法医学个体识别等领域研究。
- 穆豪放陈峰熊新张博阎春霞陈腾邓亚军
- 关键词：法医遗传学遗传多态性藏族汉族
